Analysis of pathobiomes of ticks and animals in relation to infection risk in wildlife communities

蜱虫和动物的致病菌与野生动物群落感染风险的关系分析

• 批准号: 19F19097
• 负责人: 中尾 亮
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19F19097/
• 关键词: α多様性; 齧歯類; 都市化; マダニ; 細菌叢; ヒグマ; ツキノワグマ

昨年度の野外サンプリングで採集された野生齧歯類184個体が保有する病原体叢について重点的に解析を進めた。アカネズミ、ヒメネズミ、エゾヤチネズミの脾臓からDNAを抽出し、細菌16SリボソーマルRNA遺伝子（rDNA）のV3-4領域をPCR増幅した。PCR産物をIllumina MiSeqにより解読し、得られた配列に対しQiime2を用いて細菌の系統分類を行なった。解析の結果、それぞれの動物種が固有の細菌叢を有することが分かった。検出された細菌の属レベルでの分類では、Bartonellaが全体の57.1%を占め、過半数（59.8%）の個体がBartonellaに感染していることが明らかとなった。加えて、BorreliaやEhrlichiaなどの既知マダニ媒介性病原体や、これまでほとんど報告のないNeoehrlichiaおよびDiplorickettsia等が検出された。興味深いことに、サンプリング地点を都市化地区と自然地区に分けて比較を行ったところ、都市化地区の個体ではα多様性が自然地区の個体に比べて有意に低く、マダニ媒介性病原体の保有も確認できなかった。一方で、ノミにより伝播されると考えられるBartonellaや野外環境より獲得すると考えられるMycoplasmaの保有に関しては、地区間の差は検出されなかった。このことは、環境条件により、マダニ媒介性病原体への暴露リスクが変化することを示唆しており、感染症リスク評価のための重要な知見が得られた。都市化によりもたらされる病原体叢の変化は、マダニ密度の低下によるものか、あるいはマダニ媒介性病原体の同地域からの浄化によるものかは本研究だけでは不明であり、今後地区間でのマダニ分布調査等により、その要因を明らかにする必要がある。

Last year, 184 species of wild animals were selected for the analysis of the key points of pathogens in the wild. The spleen was extracted from the DNA, and the bacteria 16s was extracted from the RNA. (rDNA) V3-4 field PCR amplitude was detected. PCR products are used in the Illumina MiSeq system, and Qiime2 systems are assigned to classify the bacteria in the system. According to the analysis of the results, there is a statistical analysis of the inherent bacteria in all kinds of animals. The results showed that the total number of bacteria in Bartonella was 57.1%, and more than half (59.8%) of them were infected with Bartonella. Add information such as "Borrelia", "Ehrlichia", "vector", "vector", "Neoehrlichia", "Diplorickettsia" and so on. There is a deep taste, a deep taste, a place, a On the other hand, there is a lot of information on the other hand, and there is an examination in the field environment in the Bartonella area. There is an examination in the Mycoplasma, and the local environment is not available in the local area. The risk of infection, environmental conditions, exposure to vector pathogens, exposure to infectious diseases, infectious diseases, and important information about infectious diseases are not known. Urbanization /

项目成果

トゥルク大学(フィンランド)

图尔库大学（芬兰）

サウスバリー大学/マンスーラ大学(エジプト)

绍斯伯里大学/曼苏拉大学（埃及）

獣医科学大学/ミャンマー木材公社(ミャンマー)

兽医科学大学/缅甸木材公司（缅甸）

Complete Genome Sequence of Rickettsia asiatica Strain Maytaro1284, a Member of Spotted Fever Group Rickettsiae Isolated from an Ixodes ovatus Tick in Japan.

亚洲立克次体菌株 Maytaro1284 的完整基因组序列，该菌株是从日本卵形硬蜱中分离出来的斑疹热立克次体成员。

• DOI: 10.1128/mra.00886-19
• 发表时间: 2019
• 期刊: Microbiol Resour Announc
• 作者: Thu MJ;Qiu Y;Yamagishi J;Kusakisako K;Ogata S;Moustafa MAM;Isoda N;Sugimoto C;Katakura K;Nonaka N;Nakao R
• 通讯作者: Nakao R

Anthropogenic interferences lead to gut microbiome dysbiosis in Asian elephants and may alter adaptation processes to surrounding environments.

• DOI: 10.1038/s41598-020-80537-1
• 发表时间: 2021-01-12
• 期刊: Scientific reports
• 影响因子: 4.6
• 作者: Moustafa MAM;Chel HM;Thu MJ;Bawm S;Htun LL;Win MM;Oo ZM;Ohsawa N;Lahdenperä M;Mohamed WMA;Ito K;Nonaka N;Nakao R;Katakura K
• 通讯作者: Katakura K