Analysis of pathobiomes of ticks and animals in relation to infection risk in wildlife communities

蜱虫和动物的致病菌与野生动物群落感染风险的关系分析

基本信息

批准号：
19F19097
负责人：
中尾亮
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19F19097/
关键词：
α多様性齧歯類都市化マダニ細菌叢ヒグマツキノワグマ

项目摘要

昨年度の野外サンプリングで採集された野生齧歯類184個体が保有する病原体叢について重点的に解析を進めた。アカネズミ、ヒメネズミ、エゾヤチネズミの脾臓からDNAを抽出し、細菌16SリボソーマルRNA遺伝子（rDNA）のV3-4領域をPCR増幅した。PCR産物をIllumina MiSeqにより解読し、得られた配列に対しQiime2を用いて細菌の系統分類を行なった。解析の結果、それぞれの動物種が固有の細菌叢を有することが分かった。検出された細菌の属レベルでの分類では、Bartonellaが全体の57.1%を占め、過半数（59.8%）の個体がBartonellaに感染していることが明らかとなった。加えて、BorreliaやEhrlichiaなどの既知マダニ媒介性病原体や、これまでほとんど報告のないNeoehrlichiaおよびDiplorickettsia等が検出された。興味深いことに、サンプリング地点を都市化地区と自然地区に分けて比較を行ったところ、都市化地区の個体ではα多様性が自然地区の個体に比べて有意に低く、マダニ媒介性病原体の保有も確認できなかった。一方で、ノミにより伝播されると考えられるBartonellaや野外環境より獲得すると考えられるMycoplasmaの保有に関しては、地区間の差は検出されなかった。このことは、環境条件により、マダニ媒介性病原体への暴露リスクが変化することを示唆しており、感染症リスク評価のための重要な知見が得られた。都市化によりもたらされる病原体叢の変化は、マダニ密度の低下によるものか、あるいはマダニ媒介性病原体の同地域からの浄化によるものかは本研究だけでは不明であり、今後地区間でのマダニ分布調査等により、その要因を明らかにする必要がある。

我们专注于去年在现场采样期间收集的184种野生啮齿动物所携带的病原体丛。从红色小鼠，日本鼠和日本鼠鼠的脾脏中提取DNA，PCR放大了细菌16S核糖体RNA基因（rDNA）的V3-4区域。使用Illumina Miseq对PCR产物进行解码，并使用Qiime2将所得序列系统发育分类为细菌。分析表明，每种动物物种都有一个流行的细菌菌群。在对属水平检测到的细菌的分类中，巴托拉占总数的57.1％，其中大多数（59.8％）感染了巴尔托内拉。此外，迄今尚未发现已知的tick传播病原体，例如伯氏和埃里希亚（Borrelia）和埃里希亚（Ehrlichia）以及neoehrlichia和Neoehrlichia和diplorickettsia。有趣的是，当将采样点与城市化和自然区域进行比较时，城市化地区个体的α多样性明显低于自然地区的个体，并且没有发现存在tick传播病原体。另一方面，没有检测到关于巴托拉持有的地区之间的差异，巴尔托内拉（Bartonella）被认为是通过跳蚤传播的，而被认为是从室外环境中获得的。这表明环境状况改变了暴露于tick传播病原体的风险，为传染病风险评估提供了重要的发现。从这项研究中尚不清楚城市化引起的病原体神经丛的变化是由于tick密度的降低或从同一地区清洗了tick传播病原体的清洁，并且有必要通过研究区域之间的tick分布来阐明将来的因素。

项目成果

期刊论文数量（13）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

トゥルク大学(フィンランド)

图尔库大学（芬兰）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

サウスバリー大学/マンスーラ大学(エジプト)

绍斯伯里大学/曼苏拉大学（埃及）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Anthropogenic interferences lead to gut microbiome dysbiosis in Asian elephants and may alter adaptation processes to surrounding environments.

DOI：
10.1038/s41598-020-80537-1
发表时间：
2021-01-12
期刊：
Scientific reports
影响因子：
4.6
作者：
Moustafa MAM;Chel HM;Thu MJ;Bawm S;Htun LL;Win MM;Oo ZM;Ohsawa N;Lahdenperä M;Mohamed WMA;Ito K;Nonaka N;Nakao R;Katakura K
通讯作者：
Katakura K

Complete Genome Sequence of Rickettsia asiatica Strain Maytaro1284, a Member of Spotted Fever Group Rickettsiae Isolated from an Ixodes ovatus Tick in Japan.

亚洲立克次体菌株 Maytaro1284 的完整基因组序列，该菌株是从日本卵形硬蜱中分离出来的斑疹热立克次体成员。

DOI：
10.1128/mra.00886-19
发表时间：
2019
期刊：
Microbiol Resour Announc
影响因子：
0
作者：
Thu MJ;Qiu Y;Yamagishi J;Kusakisako K;Ogata S;Moustafa MAM;Isoda N;Sugimoto C;Katakura K;Nonaka N;Nakao R
通讯作者：
Nakao R

獣医科学大学/ミャンマー木材公社(ミャンマー)

兽医科学大学/缅甸木材公司（缅甸）