Design of Nano-reactor Programmed by Synthesized DNA

合成DNA编程的纳米反应器的设计

基本信息

批准号：
24656472
负责人：
GOTO Masahiro
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

We present the covalent protein-protein conjugated nanoreactor, which is programmed by synthesized DNA. To demonstrate the concept, we chose thrombin as a model protein for the protein conjugation and designed four different single-stranded DNA. One of them is a template of a DNA scaffold for the arrangement of the thrombin-binding aptamers and three of them are thrombin-binding aptamers with different sticky ends that can hybridize with the DNA template (aptamer unit). By self-assembling these oligonucleotides, they should form a comb-like structure (termed DNA scaffold) composed of both the linear chains due to the DNA double-strands and the branched arms (the flexible DNA aptamer units). Thrombin molecules can get close to each other by the binding of the thrombin molecules with the aptamer units. Then, the addition of a chemical cross-linker induces the neighboring thrombin molecules on the DNA scaffold to easily cross-link each other.

我们提出共价蛋白质蛋白共轭纳米反应器，该纳米反应器由合成的DNA编程。为了证明这一概念，我们选择了凝血酶作为蛋白结合的模型蛋白，并设计了四个不同的单链DNA。其中一个是用于排列凝血酶结合适体的DNA支架的模板，其中三个是凝血酶结合的适体，具有不同粘性末端，可以与DNA模板（Aptamer单元）杂交。通过自组装这些寡核苷酸，它们应形成由DNA双链和分支臂（柔性DNA Aptamer单元）组成的梳状结构（称为DNA支架）。凝血酶分子可以通过凝血酶分子与适体单元的结合彼此接近。然后，添加化学交联链诱导邻近的DNA支架上的凝血酶分子，以轻松地相互交联。

项目成果

期刊论文数量（27）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Split Spy0128のバイオコンジュゲーションツールとしての利用

使用 Split Spy0128 作为生物共轭工具

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
安倍弘喜;若林里衣;後藤雅宏;神谷典穂
通讯作者：
神谷典穂

酵素応答性ペプチドハイドロゲルのネットワーク形成制御

酶响应肽水凝胶网络形成的控制

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
古賀未佳;若林里衣;神谷典穂;後藤雅宏
通讯作者：
後藤雅宏

Fabrication of Higher-Order Protein Supramolecular Complexes

高阶蛋白质超分子复合物的制备

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Y. Mori;R. Wakabayashi;M. Goto;N. Kamiya
通讯作者：
N. Kamiya

Tailing DNA aptamers with functional proteins by two-step enzymatic reaction

通过两步酶促反应为 DNA 适体添加功能蛋白

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
J. Biosci. Bioeng.
影响因子：
0
作者：
M. Takahara;K. Hayashi;M. Goto;N. Kamiya
通讯作者：
N. Kamiya

Control of a tyrosyl radical mediated protein cross-linking reaction by electrostatic interaction

通过静电相互作用控制酪氨酰自由基介导的蛋白质交联反应

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
Bioconjugate Chem.
影响因子：
4.7
作者：
K. Minamihata;M. Goto;N. Kamiya
通讯作者：
N. Kamiya

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

GOTO Masahiro其他文献

Property of Prestressed Concrete Using MSW Slag

利用城市生活垃圾矿渣预应力混凝土的性能

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Proceedings of the Japan Concrete Institute Vol.26 No.1
影响因子：
0
作者：
GOTO Masahiro;KOBAYASHI Takeshi;KITATSUJI Masafumi
通讯作者：
KITATSUJI Masafumi

Recovery of Cobalt and Manganese from Spent Lithium-ion Batteries using a Phosphonium-based Ionic Liquid

使用磷基离子液体从废旧锂离子电池中回收钴和锰

DOI：
10.15261/serdj.28.79
发表时间：
2021
期刊：
Solvent Extraction Research and Development, Japan
影响因子：
0
作者：
FIRMANSYAH Mochmad L.;FAJAR Adroit T. N.;MUKTI Rino R.;ILMI Thalabul;KADJA Grandprix T. M.;GOTO Masahiro
通讯作者：
GOTO Masahiro