化学反応で動くRNA-ペプチド複合体の創製

通过化学反应创建 RNA-肽复合物

• 批准号: 16651108
• 负责人: 森井 孝
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16651108/
• 关键词: ナノバイオ; 核酸; 分子認識; リセプター; ケミカルバイオロジー; コンビナトリアルケミストリー; RNA; ペプチド; 構造転移

我々はすでに生体高分子RNAとペプチドをもとにして、RNAとペプチドのサブユニットから形成される機能性組織体を設計し、RNAサブユニットをライブラリー法によって機能化し、リボヌクレオペプチドリセプターを作製する方法論を開発している。本年度の研究では、(1)RNAサブユニットを機能化したリセプターをもとにして、ペプチドサブユニットをライブラリー法によって機能化し、リボヌクレオペプチドリセプターの結合能・識別能を向上させる方法論を開発した。これによって、アデノシン三リン酸(ATP)とデオキシアデノシン三リン酸(dATP)の識別が可能なRNPリセプターが得られた。(2)ATP結合性RNPリセプターのペプチドサブユニットをもとにしてStructure-based designを行い、コイルドコイル構造を有するRNP複合体を作成した。現在、コイルドコイルRNPのリガンド結合時の構造変化を解析中である。(3)構造変化を伴いながら、NADとNADHを識別するリボヌクレオペプチドの作製。T7ファージをもとにして、Revペプチドと7アミノ酸のランダム領域をループ構造として有するペプチドライブラリーを作成した。このループRevペプチドライブラリーとATP結合性RNPリセプターのRNAサブユニットから作成したRNPライブラリーをもとにして、NAD結合性RNPを得た。NADHとNADの選択性等について現在検討中である。(4)リン酸化チロシンに対するテーラーメイドリセプターを開発した。チロシンとリン酸化チロシンを識別するRNPリセプターを作成した。リン酸化チロシンおよびそのN末端側ペプチド結合加水分解遷移状態を認識するリボヌクレオペプチドリセプターの作製を試みている。

We developed a methodology for the design of functional tissues for the formation of living polymer RNA, RNA, and RNA. This year's research includes the following: (1) Methodological development of functionalization, selection, selection, binding and recognition of RNA. The identification of ATP and dATP may be used to determine the identity of ATP and dATP. (2) The ATP binding RNP complex was prepared by using structure-based design and structure. At present, the structural transformation of RNP is analyzed in detail. (3)The structure of the system can be changed to include the following: NAD and NADH. T7 - 10 - 2015: The first time the United States was involved in the war, the United States was involved in the war. RNP binding RNP binding RNA binding NADH and NAD selectivity are discussed in detail. (4)The development of the new technology is in the process of transformation. The RNP is the most important part of the system. The N-terminal transition state of the reaction mixture is recognized by the reaction mixture and the reaction mixture is prepared.

项目成果

Dual DNA recognition codes of a short peptide derived from the basic leucine zipper protein EmBP1.

源自基本亮氨酸拉链蛋白 EmBP1 的短肽的双 DNA 识别码。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Bioorg. Med. Chem. 13
• 作者: 杉村和久(他;2名);T.Morii
• 通讯作者: T.Morii

Paradoxical inhibition of protein aggregation and precipitation by transglutaminase-catalyzed intermolecular cross-linking

转谷氨酰胺酶催化的分子间交联对蛋白质聚集和沉淀的反常抑制

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biol.Chem. (In press)
• 作者: Konno;T.;T.Morii;H.Shimizu;S.Oiki;K.Ikura
• 通讯作者: K.Ikura

Ribonucleopeptides: Functional RNA-peptide complexes

• DOI: 10.1002/bip.10576
• 发表时间: 2004-01-01
• 期刊: BIOPOLYMERS
• 影响因子: 2.9
• 作者: Hagihara, M;Hasegawa, T;Morii, T
• 通讯作者: Morii, T

Novel real-time sensors to quantitatively assess in vivo inositol 1,4,5-trisphosphate production in intact cells.

新型实时传感器可定量评估完整细胞体内肌醇 1,4,5-三磷酸的产生。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Chem. Biol. 11
• 作者: K.Sugimoto;M.Nishida;M.Otsuka;K.Makino;K.Ohkubo;Y.Mori;T.Morii
• 通讯作者: T.Morii