化学反応で動くRNA-ペプチド複合体の創製

通过化学反应创建 RNA-肽复合物

• 批准号: 16651108
• 负责人: 森井 孝
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16651108/
• 关键词: ナノバイオ; 核酸; 分子認識; リセプター; ケミカルバイオロジー; コンビナトリアルケミストリー; RNA; ペプチド; 構造転移

我々はすでに生体高分子RNAとペプチドをもとにして、RNAとペプチドのサブユニットから形成される機能性組織体を設計し、RNAサブユニットをライブラリー法によって機能化し、リボヌクレオペプチドリセプターを作製する方法論を開発している。本年度の研究では、(1)RNAサブユニットを機能化したリセプターをもとにして、ペプチドサブユニットをライブラリー法によって機能化し、リボヌクレオペプチドリセプターの結合能・識別能を向上させる方法論を開発した。これによって、アデノシン三リン酸(ATP)とデオキシアデノシン三リン酸(dATP)の識別が可能なRNPリセプターが得られた。(2)ATP結合性RNPリセプターのペプチドサブユニットをもとにしてStructure-based designを行い、コイルドコイル構造を有するRNP複合体を作成した。現在、コイルドコイルRNPのリガンド結合時の構造変化を解析中である。(3)構造変化を伴いながら、NADとNADHを識別するリボヌクレオペプチドの作製。T7ファージをもとにして、Revペプチドと7アミノ酸のランダム領域をループ構造として有するペプチドライブラリーを作成した。このループRevペプチドライブラリーとATP結合性RNPリセプターのRNAサブユニットから作成したRNPライブラリーをもとにして、NAD結合性RNPを得た。NADHとNADの選択性等について現在検討中である。(4)リン酸化チロシンに対するテーラーメイドリセプターを開発した。チロシンとリン酸化チロシンを識別するRNPリセプターを作成した。リン酸化チロシンおよびそのN末端側ペプチド結合加水分解遷移状態を認識するリボヌクレオペプチドリセプターの作製を試みている。

We use raw polymer RNA and RNAi to detect the formation of functional groups, such as the design of the functional group, the design of the system, the monitoring of the mechanical properties of the system, the monitoring of the mechanical properties of the raw polymer, the detection of the raw polymer, the formation of the functional group, the design of the system, the performance of the system, and the method of monitoring. In this year's research, (1) RNA has been able to improve the performance of the research industry. (1) this year, the research has been carried out this year. (1) in this year's research, (1). It is possible that the triglyceride (ATP) and the triglyceride (dATP) may be affected by RNP. (2) the combination of ATP and RNP. The combination of RNP and RNP has been successfully completed. At present, it is necessary to analyze the data in the analysis of the RNP system. (3) to make sure that the company is responsible for the operation of the company, and that the NAD NADH is responsible for the operation. T7, please do not know if there are any problems in the field, such as T7, Rev, and so on. in the field, there are many problems. The combination of ATP and Rev was greatly improved. The combination of RNA and RNP was achieved by the combination of RNP and NAD. The NADH NAD option is available now and is currently available. (4) acidification is necessary. Please do not open the door. In the process of acidification, we need to make sure that the RNP is correct. The method of acidification is used in combination with the addition of water to decompose it in water.

项目成果

Dual DNA recognition codes of a short peptide derived from the basic leucine zipper protein EmBP1.

源自基本亮氨酸拉链蛋白 EmBP1 的短肽的双 DNA 识别码。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Bioorg. Med. Chem. 13
• 作者: 杉村和久(他;2名);T.Morii
• 通讯作者: T.Morii

Paradoxical inhibition of protein aggregation and precipitation by transglutaminase-catalyzed intermolecular cross-linking

转谷氨酰胺酶催化的分子间交联对蛋白质聚集和沉淀的反常抑制

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biol.Chem. (In press)
• 作者: Konno;T.;T.Morii;H.Shimizu;S.Oiki;K.Ikura
• 通讯作者: K.Ikura

Ribonucleopeptides: Functional RNA-peptide complexes

• DOI: 10.1002/bip.10576
• 发表时间: 2004-01-01
• 期刊: BIOPOLYMERS
• 影响因子: 2.9
• 作者: Hagihara, M;Hasegawa, T;Morii, T
• 通讯作者: Morii, T

Novel real-time sensors to quantitatively assess in vivo inositol 1,4,5-trisphosphate production in intact cells.

新型实时传感器可定量评估完整细胞体内肌醇 1,4,5-三磷酸的产生。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Chem. Biol. 11
• 作者: K.Sugimoto;M.Nishida;M.Otsuka;K.Makino;K.Ohkubo;Y.Mori;T.Morii
• 通讯作者: T.Morii