協同性発現によるDNA塩基配列認識能鋭敏化の分子機構

通过协同表达提高DNA碱基序列识别能力的分子机制

• 批准号: 08680629
• 负责人: 森井 孝
• 金额: --
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08680629/
• 关键词: 分子認識; ホストーゲスト; オリゴペプチド; 協同性; DNA認識

ホスト分子とゲスト分子を同一ペプチド鎖内に存在させた場合には同一ペプチドにより、二量体、三量体などの多量体形成が期待される。多量体形成により、DNA塩基配列認識における協同性の影響を調べるため、これまでに用いられているα-ヘリックス構造を形成し、DNA塩基配列特異的に二量体を形成して結合することが知られている、ロイシンジッパー蛋白質GCN4の塩基性領域のアミノ酸配列を有し、N末端側にゲスト分子であるアダマンタン、C末端にホスト分子であるβ-シクロデキストリンを持つオリゴペプチドを合成した。標的DNAは、GCN4が二量化し結合する回文配列中の5塩基対からなるハーフサイト、5,-ATGAC-3,が繰り返した塩基配列を持つオリゴヌクレオチドである。ハーフサイトの繰り返し回数の異なるDNAに対する分子内にホスト分子とゲスト分子の両方を持つオリゴペプチドGAdCdと分子内にゲスト分子のみを持つペプチドGAdの結合様式を比較することで、DNA認識分子が非共有結合により多量化することにより塩基配列特異的認識がどのように変化するかを調べたところ、G2AdCdのみがハーフサイトが三回繰り返した配列に三量体形成を伴って結合することがわかった。GAdペプチドはハーフサイトを一つもつ塩基配列にも結合する。しかしながら、GAdCdペプチドは単量体としてDNAに結合することはなく、多量体形成を伴いながら、ハーフサイトが二回以上繰り返した塩基配列を選択的に認識することがわかった。

The same molecule exists in the same lock, and the same molecule, two molecules, three molecules, and many molecules are expected to form. Synergistic effects on the formation of multiple molecules, the recognition of DNA motif alignment, the formation of α-mer structures, the formation of dimers specific to DNA motif alignment, the binding of DNA motif alignment, the recognition of DNA motif alignment, and the recognition of DNA motif alignment. C terminal The target DNA is composed of GCN4, 5, -ATGAC-3, 5, -GCN-4, 5,-ATGAC-3, 5,-ATGAC-3, 5, ATGAC-3, 5, ATGAC-3, ATGAC-3, 5, ATGAC-3, AT DNA recognition molecule recognition G2AdCd is a three-dimensional complex. GAd is a combination of two basic configurations. For example, if a DNA fragment is found in a DNA fragment, the DNA fragment will be bound to the DNA fragment.

项目成果

Takashi Morii他: "Factors Governing the Sequence-Selective DNA Binding of Geometrically Constrained Peptide Dimers" Journal of the American Chemical Society. 119(in press). (1997)

Takashi Morii 等人：“影响几何约束肽二聚体的序列选择性 DNA 结合的因素”，美国化学会杂志 119（出版中）。

Takashi Morii他: "Cooperative Oligomerization Enhances Sequence-Selective DNA Binding by a Short Peptide" Journal of the American Chemical Society. 118. 10011 (1996)

Takashi Morii 等人：“协同寡聚化增强短肽的序列选择性 DNA 结合”美国化学会杂志 118. 10011 (1996)。

Masako Okagami他: "DNA recognition by covalently constrained peptide dimers:roles of the constraints for sequence-selectivity" Nucleic Acids Symposium Series. No.35. 163 (1996)

Masako Okagami 等人：“共价约束肽二聚体的 DNA 识别：序列选择性约束的作用”核酸研讨会系列第 35 期（1996 年）。