機能性ミニチュアRNAタンパク質複合体の構築

功能性微型RNA-蛋白质复合物的构建

• 批准号: 17026019
• 负责人: 森井 孝
• 金额: $ 3.39万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17026019/
• 关键词: バイオセンサー; セカンドメッセンジャー; 分子認識; リセプター; ケミカルバイオロジー; コンビナトリアルケミストリー; RNA; ペプチド

本研究では、RNA、タンパク質複合体酵素であるリボソームがタンパク質酵素を凌駕する高機能の触媒活性を有することに注目し、RNA-ペプチド複合体(リボヌクレオペプチド)を人工酵素の基本骨格として用いた分子設計を行った。さらに、リボヌクレオペプチドの構造的特徴を生かすことにより、化学反応の進行に応じて反応場の構造が変化することで触媒活性を発揮するRNAタンパク質複合体酵素を創製することを目指した。1.遷移状態アナログの作製及びスクリーニングGly-pTyr-Valのペプチド結合加水分解の遷移状態アナログを合成した。また反応基質となるGly-pTyr-Valを合成し、樹脂に固定化した。Rev-RRE複合体を含むリボヌクレオペプチドライブラリーを用いて、Gly-Tyr-Val配列に対してインビトロセレクション法を適用することにより、基質となるGly-Tyr-Val配列に対して親和性を持つリボヌクレオペプチドを得た。得られたGly-pTyr-Valに親和性を示すリボヌクレオペプチドのRNA結合モチーフは、ループ構造を有するペプチドライブラリーとRNA-ペプチド複合体を形成させることによりリボヌクレオペプチドライブラリーが作製できる。このライブラリーと合成した遷移状態アナログに対して親和性を示すRNA-ペプチド複合体を選択する。2.可動性ペプチドの設計ループ領域をコイルドコイルペプチドによって形成させ、可動性ペプチドとして用いることを試みた。結晶構造が明らかになっているseryl-tRNA synthetase(SRS)のコイルドコイルモチーフをもとにして、C末端側ヘリックス表面にRevペプチドのRRE配列認識アミノ酸配列を導入し、コイルドコイル構造をとった際に、7アミノ酸からなるループ領域を形成できるペプチドを設計・合成した。

In this study, we investigated the molecular design of RNA, protein complex enzymes and high functional catalytic activity of RNA, protein complex enzymes. In addition, the characteristics of the structure of the enzyme, the structure of the reaction field, the structure of the catalytic activity and the production of the RNA and protein complex enzyme are indicated. 1. The transition state of Gly-p-Tyr-Val is selected by combining the transition state of hydrolysis with the synthesis of Gly-p-Tyr. Gly-p Tyr-Val was synthesized and immobilized on resin. Rev-RRE complex contains the following: Gly-Tyr-Val alignment, Gly-Tyr-Val affinity, Gly-Tyr-Val affinity. The affinity of Gly-p Tyr-Val is shown in the following table. The RNA junction of Gly-p Tyr-Val is formed in the structure of Gly-p Tyr-Val. The synthesis, migration and affinity of RNA-selection complexes are discussed. 2. Movability selection and design of a range of products The crystal structure of seryl-tRNA synthase (SRS) is composed of three parts: crystal structure, crystal structure,

项目成果

Stepwise functionalization of ribonucleopeptides: optimization of the response of fluorescent ribonucleopeptide sensors for ATP

核糖核酸肽的逐步功能化：优化荧光核糖核酸肽传感器对 ATP 的响应

• 发表时间: 2007
• 期刊: Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids 26
• 作者: 水野稔久;長谷川千夏;武藤隆史;織田昌幸;田中俊樹;松岡英明;T. Morii
• 通讯作者: T. Morii

Synergistic action of polyanionic and non‐polar cofactors in fibrillation of human islet amyloid polypeptide

• DOI: 10.1016/j.febslet.2007.03.030
• 发表时间: 2007-04
• 期刊: FEBS Letters
• 影响因子: 3.5
• 作者: T. Konno;S. Oiki;T. Morii

Dual DNA recognition codes of a short peptide derived from the basic leucine zipper protein EmBPl.

衍生自碱性亮氨酸拉链蛋白 EmBP1 的短肽的双 DNA 识别码。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Bioorg.Med.Chem. 13
• 作者: T.Morii;Y.Mori;T.Morii;T.Morii;T.Konno;T.Morii
• 通讯作者: T.Morii

A Ribonucleopeptide Receptor Targets Phosphotyrosine

核糖核酸肽受体靶向磷酸酪氨酸

• DOI: 10.1380/ejssnt.2005.33
• 发表时间: 2005
• 期刊: E-journal of Surface Science and Nanotechnology
• 影响因子: 0.7
• 作者: Tetsuya Hasegawa;K. Ohkubo;S. Yoshikawa;T. Morii
• 通讯作者: T. Morii

A modular strategy for tailoring fluorescent biosensors from ribonucleopeptide complexes

• DOI: 10.1021/ja063965c
• 发表时间: 2006-10-04
• 期刊: JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
• 影响因子: 15
• 作者: Hagihara, Masaki;Fukuda, Masatora;Morii, Takashi
• 通讯作者: Morii, Takashi