生物に学ぶ動的ネットワーク最適化問題の研究
生物に学ぶ動的ネットワーク最適化問題の研究
批准号:
18654022
负责人:
小林 亮
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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英文摘要
真正粘菌変形体は原始的な神経系さえ持たない、単純な体制を持った多核単細胞生物であるが、迷路を解いたり最短経路問題を解く能力があることが、中垣らによって示されている。彼らが迷路を解く際には最終的なルートに管を残すという形を取るが、単純に迷路を解くというだけでなく、餌の量の多さによって多重にルートを残したり、単独の管を残したりと、状況に応じた反応をしている。我々はこのことを実験的に明らかにし、それを再現する数理モデルを提出した。また、真正粘菌変形体は多くの餌を提示された場合には、それらをできるだけ総長が短い経路でつなぐが、これは数理的にいえばスタイナー問題を近似的に解いていることに他ならない。NP完全問題であるスタイナー問題は、最短経路探索問題よりも遙かに困難な問題であり、まともに解けば計算時間の指数的発散という問題に直面するわけであるが、ここでも真正粘菌変形体は「知性」を発揮している。我々はPhysarum Solverを以下のように拡張することにより、スタイナー問題を近似的に解く方法を開発した。まず与えられた点を含む凸包を細かいネットワークで覆い、短い時間間隔ごとに2頂点のペアをランダムに選び(実際はまず一方を選び、他方はそれからなるべく遠い頂点を選ぶ)、それにPhysarum Solverを適用するのである。このようにすると、スタイナー最小木ではないが、それと位相的に等価な経路を求めることができる。これを元にスタイナー点の位置を緩和することにより、スタイナー最小木に到達できるのである。少なくとも正解がわかる程度に頂点数が少ない場合についてはほぼ確実に正解に到達することがシミュレーションによって確かめられた。
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A mathematical model for adaptive transport network in path finding by the true slime mold
真粘菌寻路的自适应传输网络数学模型
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
J. Theor. Biol. 244
影响因子:
--
作者:
[A. Tero, R. Kobayashi and T. Nakagaki]
通讯作者:
R. Kobayashi and T. Nakagaki
Physarum solver : -a biologically inspire method of road-network navigation-
绒泡菌求解器:-一种生物启发的路网导航方法-
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Physica A 363
影响因子:
--
作者:
[柴 玲子・石田 宏代・志倉 圭子, 他, 田中 裕美子, 田中 裕美子(分担執筆), 田中 裕美子(分担執筆), Gen Nakamura, Gen Nakamura (他3名), 中村玄(他2名), 中村 玄, T. Nakagaki, 小林 亮, T. Nakagaki, A.Tero, R.Kobayashi, A.Tero]
通讯作者:
A.Tero
DOI:
10.1103/physrevlett.99.068104
发表时间:
2007-08-10
期刊:
PHYSICAL REVIEW LETTERS
影响因子:
8.6
作者:
[Nakagaki, Toshiyuki, Iima, Makoto, Showalter, Kenneth]
通讯作者:
Showalter, Kenneth
粘菌による迷路の解法
使用粘菌解决迷宫问题
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
細胞工学 26
影响因子:
--
作者:
[柴 玲子・石田 宏代・志倉 圭子, 他, 田中 裕美子, 田中 裕美子(分担執筆), 田中 裕美子(分担執筆), Gen Nakamura, Gen Nakamura (他3名), 中村玄(他2名), 中村 玄, T. Nakagaki, 小林 亮]
通讯作者:
小林 亮
Effects of food amount on path selection in transport network of an amoeboid organism
食物量对变形虫运输网络路径选择的影响
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Topological Aspects of Critical Systems and Networks (Proceedings of the international conference on Topological Aspects of Critical Systems and networks)
影响因子:
--
作者:
[柴 玲子・石田 宏代・志倉 圭子, 他, 田中 裕美子, 田中 裕美子(分担執筆), 田中 裕美子(分担執筆), Gen Nakamura, Gen Nakamura (他3名), 中村玄(他2名), 中村 玄, T. Nakagaki, 小林 亮, T. Nakagaki]
通讯作者:
T. Nakagaki
共 9 条
酸化物原子膜のアニオンエンジニアリングと次世代誘電体の創製
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批准号:23K23175
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$3.66万
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财政年份:2024
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负责人:小林 亮
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依托单位:
多施設共同研究に基づいた高齢がん患者に最適ながん化学療法実施方法の確立
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批准号:24K09916
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:小林 亮
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依托单位:
Anion engineering of atomically- thin oxide sheets and development of dielectric materials for next-generation electric devices
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批准号:22H01907
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2022
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负责人:小林 亮
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依托单位:
Development of reactive force-field and molecular dynamics simulation of electrode-electrolyte interfaces
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批准号:21K04650
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.33万
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财政年份:2021
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负责人:小林 亮
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依托单位:
水溶液化学に立脚した低エネルギープロセスによる機能性材料の合成
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批准号:08J09329
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2008
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负责人:小林 亮
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依托单位:
生物における管のネットワークのダイナミクスの数理的研究
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批准号:16654017
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2004
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负责人:小林 亮
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依托单位:
フェーズフィールドモデルによる凝固現象の解析
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批准号:05650067
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1993
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负责人:小林 亮
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依托单位:
凝固現象,結晶成長に関する数理モデル
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批准号:61740091
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1986
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负责人:小林 亮
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依托单位:
海外基金