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Molecular mechanism of the AID-recombinosome formation which is essential for vaccine-induced antibody gene diversification

AID重组体形成的分子机制对于疫苗诱导的抗体基因多样化至关重要

基本信息

批准号：
22H00449
负责人：
本庶佑
金额：
$ 27.04万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

DNA切断に関わるMed12とhnRNP Kについて、それぞれ以下のような新たな成果を得ることができた。Med12/eRNAによるIgH遺伝子座の長大なループ構造複合体の解析のため、IgH遺伝子の3'エンハンサーから転写されるeRNAの転写開始点と終結点を同定した。hnRNP Kのノックダウンレスキューのため、内因性hnRNP Kの発現がより少なく、またIgH遺伝子の短時間での組換え効率の良い新たなhnRNP K欠損細胞株を樹立した。また、野生型や変異型のhnRNP Kを用いてレスキュー効率などを確認した。DNA修復に関わる因子群については、フィブリラーリンとMed19のドメイン特異的な相互作用因子を単離するため、抗体遺伝子組換えをサポートする能力のない、モチーフ変異体やドメイン欠損変異体を作成し、それらの機能を検証した。また、RNaseH1によるR-ループを介したDNA修復に関わる構成因子の解析を進めhnRNP Uの機能を明らかにした。具体的には、hnRNP Uが古典的非相同DNA組換え (cNHEJ)の各種因子をIgH遺伝子の修復部位に集めるために作用していること、また、hnRNP UはR-ループ構成複合体にも結合し、また、IgH遺伝子の転写部位に形成されるR-ループのうち、特にG4構造にhnRNP Uが結合していた。hnRNP Uは総合して、cNHEJ を順調に進めるために必要であり、かつ、R-ループが過剰に形成されるために引き起こされる行き過ぎたDNA切断とゲノム不安定性を避けるために作用すると考えられた。

DNA cut Med12 hnRNP K and get the following results from the new ones. The Med12/eRNA gene IgH sub-constellation has grown up to make a copy of the complex, and the IgH sub-system has the same starting point as the starting point of eRNA writing. HnRNP K is responsible for poor cell growth, hnRNP K is responsible for short time response, and hnRNP K is a good candidate for short-time response rates. HnRNP K of wild type and wild type is confirmed by the rate of wild type and wild type. DNA modifies the factor group. The interaction factors are isolated from each other in the Med19 cluster. The antibody sub-group is sensitive to each other. The antibody subgroup is sensitive to the antibody. On the basis of the analysis of the factors caused by the correction of DNA and the analysis of the factors in the process of DNA modification, the hnRNP U machine can be used to understand the performance of the computer. The specific, hnRNP U classical and non-identical DNA components (cNHEJ) are used to assemble the various factors of the IgH cluster. The functions of the repair parts of the IgH cluster are the combination of the hnRNP UBG and the IgH UBG, and the combination of the two parts to form the combination of the two parts. The special G4 device makes the combination of the hnRNP U-cluster. HnRNP U

项目成果

期刊论文数量（11）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

XLID syndrome gene Med12 promotes Ig isotype switching through chromatin modification and enhancer RNA regulation.

DOI：
10.1126/sciadv.add1466
发表时间：
2022-11-25
期刊：
Science advances
影响因子：
13.6
作者：
通讯作者：

京都大学大学院医学研究科　免疫ゲノム医学

京都大学医学研究科免疫基因组医学

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Ago2 and a miRNA reduce Topoisomerase 1 for enhancing DNA cleavage in antibody diversification by activation-induced cytidine deaminase.

DOI：
10.1073/pnas.2216918120
发表时间：
2023-05-02
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Kobayashi, Maki;Wakaguri, Hiroyuki;Shimizu, Masakazu;Higasa, Koichiro;Matsuda, Fumihiko;Honjo, Tasuku
通讯作者：
Honjo, Tasuku

京都大学大学院医学研究科　がん免疫総合研究センター

京都大学医学研究科癌症免疫学研究中心

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

京都大学高等研究院

DOI：
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通讯作者：
福井宣規