ヒト免疫グロブリン遺伝子群の分子進化学的解析

人类免疫球蛋白基因的分子进化分析

• 批准号: 06273215
• 负责人: 松田 文彦
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06273215/
• 关键词: 免疫グロブリン遺伝子; V_Hファミリー; 分子進化; 遺伝子変換; 転座

1.ヒトVH遺伝子群の進化の過程を明らかにする目的で、37個の機能的VH断片のアミノ酸配列を用い、neighbour-joining法によって系統樹を作成した。その結果、ヒトVHファミリーは祖先型の遺伝子より先ずI、II、IIIの3つのグループに分岐し、その後IよりVH1、VH5、VH7が、IIよりVH2、VH4、VH6が、IIIよりVH3のファミリーがそれぞれ形成されたことが明らかになった。2.最近の重複により生じた遺伝子断片の間で、コーディング領域の同義座位とイントロンの間での塩基配列の置換率を比較した。その結果、V3-60PとV3-62Pの間で、コーディング領域に対してイントロンの塩基置換率が有意に低いことを見い出した。他のVH断片との置換率の比較で、V3-62PはV3-60Pと分岐した後V3-43をドナーとする遺伝子変換を受けたことを強く示唆する結果を得た。同様の遺伝子変換のさらに顕著な例が、V4-28/V4-55P、V4-4/V4-59、V4-4b/v4-55Pの間で見い出された。3.15番、16番染色体に転座したVH断片に塩基配列を14番染色体上のVH断片と比較した。その結果14番染色体上のV3-11^-V3-16P及びV2-26のVH断片と16番染色体上のVF3-11^-VF3-16P及びVF2-26が同じ順序で高い相同性を示すことが判明した。14番染色体から16番染色体へのの転座は約2000万年前と算出された。一方、15番染色体上のV54断片は14番染色体上のV1-18と95%の相同性を有していた。V54とV1-18の分岐年代は約1500万年前と計算され、16番染色体への転座の過程でV1-18を含む一部の領域が15番染色体へ転座した可能性が示唆された。

1. The evolution process of VH gene group is clearly defined, and the phylogenetic tree is constructed by using the neighbor-joining method and the alignment of 37 functional VH fragments. The results are as follows: First, I, II, III and III are divided into three groups, and then I, VH1, VH5, VH7, II, VH2, VH4, VH6 and III are divided into three groups. 2. Comparison of the replacement rates of the most recent repeat gene fragments and the most recent repeat gene fragments Results: V3- 60P and V3- 62P were found to have a low base substitution rate in the field of fluorescence. A comparison of the replacement rates of V3- 62P and V3 - 60P fragments was made, and the results of the comparison of V3-43 fragments and V3 - 62P fragments were obtained. For example, V4-28/V4- 55P, V4-4/V4-59, V4- 4b/V4- 55P are included. 3.15 The VH fragment on chromosome 14 is aligned with the VH fragment on chromosome 16. V3 - 11^-V3- 16P and VH fragments V2-26 on chromosome 14 and VF3 -11^-VF3 - 16P and VF2 -26 on chromosome 16 were identified. Chromosome 14 was calculated about 20 million years ago. The V54 fragment on chromosome 15 is 95% identical to V1-18 on chromosome 14. The divergence between V54 and V1-18 was dated about 15 million years ago. The process of chromosome 16 and V1-18 included a partial domain of chromosome 15 and the possibility of chromosome 16 and V1-18 was discussed.