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成人性T細胞白血病の遺伝因子の解明:DNA修復遺伝子の多型の遺伝解析

阐明成人T细胞白血病的遗传因素：DNA修复基因多态性的遗传分析

基本信息

批准号：
18014014
负责人：
松田文彦
金额：
$ 5.7万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

HTLV-Iウイルス感染者は日本全体で100万人存在し、毎年約1,000人が成人性T細胞白血病(ATL)を発症している。一旦ATLを発症した場合その予後は1年に満たず極めて不良で、ATLに対する治療法開発はHTLV-Iが蔓延している唯一の先進国である日本の責務である。ATLは病気の発症、進行や、予後に宿主の複数の遺伝子の多型の関与が推測されてきたが、その遺伝因子は未だ不明である。そこで、詳細な臨床情報を伴うATLの患者、ウイルスキャリア非発症者のDNA検体を用いて、候補遺伝子アプローチによる疾患感受性遺伝子の同定を試み、以下に述べる結果を得た。当研究室で同定した免疫関連遺伝子約200個に存在するSNPにHapMap計画で得られた情報を加え、1536個のタグSNPを抽出し、Goldengate法によりマーカーパネルを作成した。相関解析は段階的におこなうこととし、まず患者96人、非発症者96人でタイピングを行った。タイピング結果をもとに個別SNPのアレル頻度で統計解析を行い、p値<0.001のマーカー5個(1.1x10-6から9.8x10-4)に加え、0.01を下回るマーカー47個に対応する遺伝子領域から網羅的に384個のマーカーを選択し、患者208検体、非発症者276検体を用いて2次スクリーニングを実施した。その結果p<0.01(p=0.003〜0.006)を示すSNPが存在する遺伝子が3個同定された。現在、有意差を示す多型を含むハプロタイプ解析を行っており、また細胞株を用いた実験を開始し、これら3個の遺伝子のATL発症における役割を解析中である。

There are 1 million people infected with HTLV-I infection in Japan, and there are about 1000 people with adult T-cell leukemia (ATL) syndrome in Japan. Once the ATL epidemic has been approved, one year after the outbreak of HTLV-I, the HTLV-I epidemic will be the only one in the first country and Japan will be responsible for the treatment of HTLV-I. The symptoms, progression and prognosis of ATL's disease are complicated by the host, the number of polymorphisms is not known, and the risk factors are not known. The patients with ATL, the patients with non-symptomatic symptoms, the patients with DNA symptoms, the patients with abnormal symptoms, the patients with abnormal symptoms, the patients with non-symptomatic symptoms, and the patients with non-symptomatic symptoms were treated with the same symptoms. When the laboratory agreed that there were about 200 SNP mice in the HapMap program, and 1536 mice in the SNP program, the Goldengate method was used to evaluate the immune response. A total of 96 patients and 96 non-symptomatic patients were involved in the analysis. The results show that the statistical analysis of the statistics of SNP data sets, p & lt In 0.001, there were 5 (1.1x10-6 9.8x10-4) electives, 0.001 patients and 276 patients in 47 sub-domain networks. The results showed that there were three identical clusters in SNP. At present, there is an intentional difference to indicate that there are three genotypes in the analysis of ATL disease in China, such as the beginning of the cycle, the beginning of the cycle, and the analysis of the cancer cell lines.