ニワトリB細胞株を用いたヒトDNA修復遺伝子のSNPの機能評価
使用鸡 B 细胞系对人类 DNA 修复基因中的 SNP 进行功能评估
基本信息
- 批准号:16651100
- 负责人:
- 金额:$ 2.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ヒト遺伝子のSNP解析で得られた情報は、個々のSNPの機能評価の裏付けがあって初めて生物学的意味を持つ。現在までに膨大な数のSNPが同定されているが、遺伝子のコーディング領域に存在するSNPと遺伝子産物の構造や機能の変化、すなわち質的影響に関してはほとんど解析されていない。本研究では、SNPが遺伝子機能に与える質的影響について、SNPをもつDNA修復遺伝子の機能を細胞レベルで容易に判定できるニワトリDT40細胞株を用いて、ヒトDNA修復遺伝子Rad51、XRCC2について調べた。DT40細胞株の外来DNA断片を導入した時極めて高頻度に相同組換えを起こす性質を利用して、ニワトリRad51、XRCC2を破壊した変異細胞株に、それぞれヒトRad51、XRCC2のアミノ酸変異を伴う一塩基多型を含むcDNAと野生型のcDNAを細胞に導入した。ヒト遺伝子の発現を確認した後、それぞれの細胞株の放射線或はシスプラチンに対する感受性を、生存する細胞数を指標に比較した。Rad51に関しては、野生型、変異型cDNAを導入し、安定に発現する細胞株を数株づつ樹立した。ガンマ線照射、シスプラチン処理の両法を用いてSNPの遺伝子機能に対する影響を調べたが、特に大きな差は見られなかった。XRCC2も同様にヒト遺伝子を安定して発現する細胞株を数株づつ樹立し、Rad51と同様に、ガンマ線照射、シスプラチン処理を行った。ガンマ線照射では野生型、変異型の間に大きな差は見られなかった。これはXRCC2はガンマ線によるDNAダメージの修復には深く関わっていないという報告と一致していた。一方シスプラチン処理では、変異型細胞株が野生型に対して約2倍感受性が高い結果が、第一回目のアッセイで得られた。現在、細胞株の数を増やして再現性の確認を行っているこの系を用いるとSNPを持つヒトDNA修復遺伝子の機能を迅速に決定でき、多型・変異遺伝子の機能評価の方法として、最も感度がよく信頼性のある方法である。現在さらに遺伝子数を増やして、系統的にヒトSNPの機能評価を進めている。
The SNP analysis shows that there is a great deal of information about the meaning of primary biology and the ability of SNP to pay attention to the meaning of primary biology. At present, the number of SNP is the same as that in the field where there is an increase in the number of SNP products in the field of industrial production. In this study, the sub-machine of the SNP engine can be used with the shadow computer of the computer, the SNP machine, the DNA machine, the cell phone, the cell line, the Rad51, the XRCC2, the cell line, the cell line. When foreign DNA fragments of DT40 cell lines were introduced into the environment, they were highly sensitive to the presence of wild-type cDNA genes in the same group, such as cell lines, Rad51, XRCC2 genes, wild-type cDNA genes, gene polymorphisms, wild-type cDNA genes, DNA fragments, DNA fragments, DNA fragments, After the confirmation, the radiation of the cell line or the number of cells in the cell line is sensitive, and the number of survival cells refers to the number of cells. Several cell lines were isolated from Rad51, wild type, wild type and diazepam type cDNA. On-line irradiation, monitoring and monitoring methods are used to monitor the impact of the SNP sub-machine on the transmission and monitoring of the computer, especially in the case of high-speed transmission. XRCC2 showed that several cell lines were isolated, Rad51 cells were co-isolated, radiation lines were irradiated, and cell lines were analyzed. The wild type, the wild type and the wild type, the wild type and the wild type. The XRCC2 reports are consistent with each other. The reports are consistent. On one side, the cell lines of wild type and wild type were about 2 times as susceptible, and the results of the first visit showed that the cell lines of wild type and wild type were highly sensitive. At present, the number of cells can confirm that the system can use the SNP to maintain the DNA repair machine to quickly determine the accuracy, the multi-type machine can be used to determine the accuracy, and the most sensitive method can be used to determine the accuracy. At present, the number of children of the system is very low, and the SNP of the system is in progress.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
松田 文彦其他文献
NGSショートリードによるHLA遺伝子全長配列の決定
通过 NGS 短读长确定全长 HLA 基因序列
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
岩崎 毅;川口 修治;稲富 雄一;清水 正和;松田 文彦 - 通讯作者:
松田 文彦
大規模シングルセル発現データを用いた細胞集団プロファイル全体の異同の解析
使用大规模单细胞表达数据分析整个细胞群概况的差异
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
岡田 大瑚;中村 直俊;瀬藤 和也;川口 喬久;奈良原 舞子;日笠 幸一郎;田原 康玄;松田 文彦;山田 亮 - 通讯作者:
山田 亮
もやもや病感受性遺伝子RNF213と脳血管狭窄・血圧の関連:ながはまスタディ
烟雾病易感基因RNF213与脑血管狭窄和血压的关系:Nagahama研究
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西尾 瞳;永田 学;楊 涛;森本 貴昭;峰晴 陽平;吉田 和道;高木 康志;松川 愛未;瀬藤 和也;川口 喬久;田原 康玄;宮本 享;松田 文彦;小杉 眞司 - 通讯作者:
小杉 眞司
1.HTLV-1 プロウイルスゲノム変異の大規模解析によるHAM/TSP発症リスク予測モデルの構築
1. 通过大规模HTLV-1原病毒基因组突变分析构建HAM/TSP发病风险预测模型
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
北田 せり;川口 修治;清水 正和;安永 純一朗;佐藤 知雄;田 耕平;原田 瑛介;高橋 めい子;山野 嘉久;松岡 雅雄;松田 文彦 - 通讯作者:
松田 文彦
HTLV-1 高浸淫地域における大規模HLA解析による感染およびHAM/TSP発症リスクの関連解析
HTLV-1 通过高度淫秽区域的大规模 HLA 分析来分析感染与 HAM/TSP 风险之间的关联
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
川口 修治;ペノヴァ マリナ;川口 喬久;清水 正和;高橋 めい子;日笠 幸一郎;松田 文彦 - 通讯作者:
松田 文彦
松田 文彦的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('松田 文彦', 18)}}的其他基金
ゲノムワイドアプローチを用いた日本人成人性T細胞白血病の感受性遺伝子・多型の探索
使用全基因组方法寻找日本成人 T 细胞白血病的易感基因和多态性
- 批准号:
20014009 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
HTLV-1関連疾患にかかわる遺伝因子の探索
寻找HTLV-1相关疾病的遗传因素
- 批准号:
08F08815 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
成人性T細胞白血病の遺伝因子の解明:DNA修復遺伝子の多型の遺伝解析
阐明成人T细胞白血病的遗传因素:DNA修复基因多态性的遗传分析
- 批准号:
18014014 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ヒトDNA修復遺伝子の一塩基多型の遺伝解析と生物学的機能の評価
人类DNA修复基因单核苷酸多态性的遗传分析及生物学功能评价
- 批准号:
17015026 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
日仏共同研究によるDNA修復遺伝子の多人種間での比較SNPデータベース構築
日法联合研究构建多种族DNA修复基因SNP比较数据库
- 批准号:
16024207 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ヒト免疫グロブリンH鎖遺伝子全領域の構造解析
整个人免疫球蛋白H链基因区的结构分析
- 批准号:
08670365 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ヒト免疫グロブリン遺伝子群の分子進化学的解析
人类免疫球蛋白基因的分子进化分析
- 批准号:
06273215 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ヒト免疫グロブリンH鎖遺伝子全領域の構造解析
整个人免疫球蛋白H链基因区的结构分析
- 批准号:
04780263 - 财政年份:1992
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ヒト免疫グロブリンH鎖全領域の構造解析
整个人免疫球蛋白 H 链区的结构分析
- 批准号:
03780229 - 财政年份:1991
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ヒト免疫グロブリンH鎖遺伝子全領域の構造解析
整个人免疫球蛋白H链基因区的结构分析
- 批准号:
01790509 - 财政年份:1989
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (Research Fellowship)
相似海外基金
一塩基多型を用いた免疫チェックポイント阻害薬の新規バイオマーカーの探索
利用单核苷酸多态性寻找免疫检查点抑制剂的新生物标志物
- 批准号:
24K10403 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
尿酸トランスポーターの一塩基多型に着目した尿路結石症発症のリスク評価
以尿酸转运蛋白单核苷酸多态性为重点的尿石症风险评估
- 批准号:
23K19387 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
網羅的一塩基多型解析を基盤にした原発性アルドステロン症の発症機構の解析
基于综合单核苷酸多态性分析原发性醛固酮增多症发病机制
- 批准号:
22K20929 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
一塩基多型及びPTH濃度を基盤とした腎移植患者におけるTAC至適投与法の開発
基于单核苷酸多态性和PTH浓度制定肾移植患者最佳TAC给药方法
- 批准号:
22H04324 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
ミトコンドリア脳筋症の遺伝子変異を抑制する新規一塩基多型の解析
抑制线粒体脑肌病基因突变的新型单核苷酸多态性分析
- 批准号:
21H04278 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
一塩基多型特異的RNAスプライシングの探索と応用
单核苷酸多态性特异性RNA剪接的探索与应用
- 批准号:
17KT0128 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
メチルエルゴメトリンマレイン酸塩による心筋虚血発現と遺伝子一塩基多型に関する研究
马来酸甲基麦角新碱致心肌缺血及基因单核苷酸多态性研究
- 批准号:
24791622 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
病的酩酊の発症に関連する一塩基多型の探索
寻找与病理中毒发作相关的单核苷酸多态性
- 批准号:
23590863 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
一塩基多型解析による肝移植後再発肝炎に対する抗ウイルス療法の革新的効果予測
利用单核苷酸多态性分析创新预测肝移植后复发性肝炎抗病毒治疗的有效性
- 批准号:
22890132 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
QT延長症候群患者における網羅的単一塩基多型分析
长QT综合征患者单核苷酸多态性综合分析
- 批准号:
21659199 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research