サイクリン依存性キナーゼ群の高次構造に基づく基質認識機構の解明

基于细胞周期蛋白依赖性激酶高阶结构阐明底物识别机制

• 批准号: 06276222
• 负责人: 稲垣 昌樹
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06276222/
• 关键词: サイクリン依存性キナーゼ; 基質認識性; 活性部位の立体構造; 成基質ペプチド群

cdc2キナーゼは、サイクリン依存性キナーゼ(cdk)ファミリーの1つであり、真核細胞の細胞周期を制御する重要な働きを持つ。これまで、cdc2キナーゼの生理的基質蛋白質とそのリン酸化部位の解析から、cdc2キナーゼは、Ser/Thr-Pro-X-Z(Z:多くの場合、塩基性アミノ酸)という基質アミノ酸配列をリン酸化することが示唆されてきた。例えば、私たちが解析した中間径フィラメント蛋白質の一つであるビメンチンにおけるリン酸化部位は、-Ser^<55>-Pro-Gly-Gly-である。Proは側鎖に電荷を持たず、また、環状イミノ酸であるなど、他のキナーゼの基質認識要素として働く塩基性アミノ酸や酸性アミノ酸とは、構造および性質が大きく異なる。Proがcdc2キナーゼの基質認識要素として働く具体的な機構はまだ不明である。本研究において我々は、Pro様構造を持つ種々の異常アミノ酸を含むペプチドを合成し、その基質活性をProの場合と比較するとともにcdc2キナーゼの基質結合部位と作製した合成基質ペプチドの結合状態を、計算・解析した。その結果、Pro残基は基質のリン酸化部位周辺の最も安定な立体構造としてβターンを形成させる働きがあり、しかもこの立体構造がcdc2キナーゼの基質結合部位に最もマッチする構造であることがわかった。Proによりリン酸化部位がβターンを形成した場合、標的アミノ酸のC-末端側の塩基性アミノ酸は、cdc2の基質結合部位のGlu12およびGlu38と相互作用が可能となり、基質結合にさらに有利に働くことが示された。現在上記したcdc2キナーゼの立体構造に基づく基質認識機構解析システムをcdk5等他のサイクリン依存性キナーゼについて行っている。これらの解析により種々のサイクリン依存性キナーゼ間の基質認識の差異を明らかにできることが期待できる。

cdc2キナーゼは、サイクリンdependencyキナーゼ(cdk)ファミリーの1つであり、Eukaryotic cells' cell cycle control and control are important.これまで、cdc2キナーゼのphysiological matrix protein とそのリンAcidification site analysisから、cdc2キナーゼは、Ser/Thr -Pro-X-Z (Z: multi-based ammonia acid) and base ammonia acid complex acidified alkyl acid. Example, private analysis, middle diameter, protein, protein, one, one, one, one.おけるリンAcidification siteは、-Ser^<55>-Pro-Gly-Gly-である. Pro は side lock charge holder たず、また、cyclic イミノ acid であるなど、his のキナーゼの matrix recognition Recognition element is basic アミノ acid and acidic アミノ acid とは, structural およびproperty が大きくisoなる. Proがcdc2キナーゼのsubstrate recognition elementとして働くspecificなorganizationはまだunknownである. In this study, the structure of Pro様 is maintained, the species is abnormal, the acid is synthesized, and the matrix activity is active. Combined and compared, the cdc2キナーゼのmatrix binding site, the synthesis of the matrix, the binding state, calculation and analysis.そのResult, Pro residue and matrix のリン acidification site surrounding 辺 のmost もstable な three-dimensional structure としてβターンを formation させる働きがあり、しかもこのthree-dimensional structure がcdc2キナーゼの matrix binding site にmost もマッチするstructure であることがわかった. In the case where the Proによりリン acidification site is formed by beta ターンを, the target アミノ acid の C-terminal side の塩 basic アミノ acid は, cdc2 のThe matrix binding site's Glu12 and Glu38 interactions are possible and the matrix binding site is favorable and the interaction is possible. Now write down the three-dimensional structure of cdc2キナーゼのbase and matrix recognition mechanism analysisシステムをcdk5wait for himのサイクリンdependencyキナーゼについて行っている.これらのanalytic によりkind 々のサイクリンdependence キナーゼbetween のsubstrate understanding のdifferent を明らかにできることがlook forward to できる.