イソロイシルtRNA合成酵素が持つロスマンフォールド構造の分子解剖
イソロイシルtRNA合成酵素が持つロスマンフォールド構造の分子解剖
批准号:
07280229
负责人:
芝 清隆
金额:
$1.6万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
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大腸菌イソロイシルtRNA合成酵素は、N末ドメインとしてロスマンフォールド構造をもち、このドメインがATPによるイソロイシンのアデニル化と、それに続く、tRNAのイソロイシル化反応の触媒活性を担う。このロスマンフォールドを形成する第1α鎖に注目し、この鎖を形成する17残基の各位置で酵素を2断片化した。この第1α鎖のN末端領域とそれに先立つループ領域は、ATPの結合に関与する残基や、触媒活性そのものに関わる残基が存在することが知られている。また、各種生物を通じて、非常に良く第1α鎖の1次構造が保存されている。分解した2つの酵素断片は2つのプラスミドから別々に発現させ、大腸菌イソロイシルtRNA合成酵素遺伝子ノックアウト株を用いた、in vivoでの酵素活性再構成能力アッセイを行った。その結果、調べた17対の断片化実験の全てで、活性の再構成を示す結果は得られなかった。第1α鎖は分断に関して非常に感受性が高いことが分かるタンパク質の分解単位としてのミニ遺伝構造とエクソン・イントロン構造の関係は興味を引く点である。このため、ヒトの細胞質型、ミトコンドリア型イソロイシルtRNA合成酵素cDNAから出発し、これらの2つの酵素のエクソン・イントロン構造を決定し、細胞質型酵素は34のエクソンから、また、ミトコンドリア型酵素は23のエクソンからなることを明らにした。他のグループから報告されているテトラヒメナ細胞質型同酵素遺伝子の3者の間でイントロンの位置の保存性に注目すると、唯一、ヒト細胞質型酵素と、テトラヒメナ酵素の間で1箇所のイントロン位置が完全に一致していた。少なくともこの保存されたイントロンの起源は、テトラヒメナの出現した時期にまで遡ることができる。興味深いことに、この保存されたイントロン位置で、大腸菌イソロイシルtRNA合成酵素がその活性を失うことなく2断片化される。
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Hipps,D.: "Operational RNA code for amino acides : specie-specific aminoacylation of minihelices switched by a single nucleotide." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 92. 5550-5552 (1995)
Hipps,D.:“氨基酸的操作 RNA 代码:通过单个核苷酸切换的小螺旋的物种特异性氨酰化。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Shiba,K.: "Human alanyl-tRNA synthetase : conservation in evolution of catalytic core and microhelix recognition." Biochemistry. 34. 10340-10349 (1995)
Shiba,K.:“人类丙氨酰-tRNA 合成酶:催化核心和微螺旋识别进化中的保守性。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Nakai,S.: "The POU dumain transcription factor Brn-2 is required for the determination of specific neuronal lineages in the hypothalamous of the mouse." Genes&Dev.9. 3109-3121 (1995)
Nakai,S.:“确定小鼠下丘脑中的特定神经元谱系需要 POU dumain 转录因子 Brn-2。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Shiba,K.: "Tracing biological evolution in protein and gene structures." Elsevier Science Publishers,Amsterdam., 314 (1995)
Shiba,K.:“追踪蛋白质和基因结构的生物进化。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Ripmaster,T.L.: "Wide cross-species aminoacyl-tRNA synthetase replacement in vivo : Yeast cytoplasmic alanine enzyme replaced by human polymyositis serum antigen.21GC03:Proc.Natl.Acad.Sci.USA" 92. 4932-4936 (1995)
Ripmaster,T.L.:“体内广泛跨物种氨酰基-tRNA 合成酶替代:酵母细胞质丙氨酸酶被人多发性肌炎血清抗原替代。21GC03:Proc.Natl.Acad.Sci.USA”92. 4932-4936 (1995)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Differentiation of EVs using artificial proteins and immune assay
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批准号:23K05774
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2023
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
人工タンパク質を用いた低エネルギー型ナノ無機材料形成システムの確立
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批准号:21651058
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2009
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
人工タンパク質の技術開発
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批准号:17012026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$30.66万
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财政年份:2005
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
シンセティックアプローチによる生物システム形成原理の探求
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批准号:16011262
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2004
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
プロテオームが忌避する配列をもつ人工タンパク質の示す免疫原性能力の調査
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批准号:13878137
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
ゲノム生物学から抽出される知識をタンパク質上に人為再構成するシステムの構築
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批准号:13202069
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2001
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
ヒトアミノアシルtRNA合成酵素活性の酵素間相互作用依存性
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批准号:12029222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
バキュロウイルス多重感染系を用いた翻訳装置超高分子複合体の再構成
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批准号:11169243
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
繰り返し構造単位の探索と、繰り返しにより作成された人工タンパク質の性質解析
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批准号:10157228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
マイクロ遺伝子重合法を用いた人工バイオシグナル分子創出系の確立
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批准号:10878115
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
遺伝的ブロック単位の探索と、その重合化によるタンパク質立体構造再構築の試み
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批准号:09261242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
酵素を構成する遺伝的ブロック単位とタンパク質構造との関係
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批准号:08272235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
酵素を構成する遺伝的ブロック単位とタンパク質構造との関係
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批准号:08272235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通してみる翻訳系の進化
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批准号:07250221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1995
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通してみる翻訳系の進化
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批准号:06258220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1994
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通して見る翻訳系の進化
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批准号:04272220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1992
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
蛋白質の高次構造形成過程をターゲットとしたドミナントネガティブ変異体作成系の確立
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批准号:04680263
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1992
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负责人:芝 清隆
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依托单位:
アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通して見る翻訳系の進化
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批准号:05265222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:芝 清隆
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依托单位: