RLGS法、AP-PCR法を用いた肝癌染色体ゲノムの解析

RLGS法和AP-PCR法分析肝癌染色体基因组

• 批准号: 09770359
• 负责人: 花房 直志
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09770359/
• 关键词: 肝癌; RLGS; AP-PCR; ゲノムメチレーション; ゲノムのメチル化; RLGS法; AP-PCR法

癌細胞における遺伝子発現の変化は遺伝子の突然変異、メチル化状態の変化、および染色体数の変化や増幅による量的変化によるものであると考えられる。本研究ではRLGS法およ調V-PCR一SSCP法で検出された各種の変異を、詳細にカタログ化するとともに、変異部位の染色体へのマッピング、およびゲノムのメチル化部位、脱メチル化部位の染色体へのマッピングを目的とした。行なった研究の実績は以下のとおりである。(1)RLGS法の改良:縦型の泳動槽を用いる手法の利点を取り入れ、より正確なランドマーク像が一度に多く得られるよう改良を加えた。(2)効率的なRLGSスポットのクローニング法の開発:鈴木らにより報告されたPCR法を用いたクローニング法を元にラベリングとアダプターに改良を加え、1度の電気泳動でクローニング可能な手法を開発した。この手法を用いて行なったRLGSスポットのクローニング解析については第34回日本肝臓学会(1998年)において報告した。ここでは肝癌において多く観察されたRLGSスポットの変化の多くが反復配列のメチル化の変化によることを報告した(投稿準備中)。(3)AP-PCR法によるメチル化部位の検出:鋳型となるゲノムDNAをメチル化感受性制限酵素Msp I等で切断したものを出発材料としたAP-PCR解析(メチル化特異的AP-PCR法)のシステムを作成し、この方法によりランダムなメチル化に関与するゲノムのSTS(Sequence tagged site)マーカーを集めることができることを示した。

The cancer is characterized by a sudden change in the number of chromosomes, a change in the number of chromosomes, an increase in the number of chromosomes, a change in the number of chromosomes, and an increase in the number of chromosomes. In this study, RLGS method and V-PCR-SSCP method were used to detect all kinds of chromosomes, such as chromosomes, and chromosomes. All right, please do some research on the following information. (1) improvement of the RLGS method: the swimming trough of the model swimmer is used to gain access to the swimming trough, and it is correct to make sure that it is more than one time to improve the performance of the swimming trough. (2) the accuracy of the RLGS method is very high. The PCR method is used to improve the performance of the electrophoretic swimming machine. The method was used to analyze the report of the Society of Hepatology of Japan (1998) for the 34th return to the Japanese liver Society (1998). Liver cancer, liver cancer, liver cancer and liver cancer. (3) the AP-PCR method was used to determine the location of the enzyme: type I, DNA, enzyme restriction enzyme MSP I, etc., cut off, export the material, analyze the AP-PCR (the AP-PCR method of the chemical specialization), make the enzyme, The method is different from that of STS (Sequence tagged site). The data sets are displayed.

项目成果

湯本泰弘: "肝細胞癌の遺伝子異常" 臨床消化器内科. 13・10. 1447-1464 (1998)

Yasuhiro Yumoto：“肝细胞癌的遗传异常”临床胃肠病学13・10（1998）。