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動的インドースフォールディングと統計法則

动态逆折叠和统计定律

基本信息

批准号：
08272210
负责人：
笹井理生
金额：
$ 1.09万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

1 配列のデザイン原理カルシウム結合蛋白を例により、経験的力場によってnative構造にフォールドする配列を、人工的に生成した。フォールド能力のある配列は、native構造だけでなくフォールディング経路に沿って広い範囲で適正なエネルギー曲面を持つ必要があること、native構造に無関係な構造を多く参照してもフォールド能力のある配列の選択には有効でないこと、一定速度で配列を試行的に変化させても、残基間の多体相関のため、選択された配列の変化速度は一定にならず揺らぐこと、などの知見が得られた。2 水の動的ゆらぎと水和蛋白質のまわりの水和水のゆらぎと蛋白質のゆらぎと相関を解析するために、水の構造を表現する局所構造指数と呼ばれる新しい統計量が開発、分析された。分子動力学計算により、水素結合ネットワーク構造が局所的に発達する時期と発達していない時期がランダムに間欠的に交替することが示された。常温のバルクの水では、構造の寿命は数100フェムト秒から10ピコ秒程度まで階層的に分布し、構造を持った分子は互いに集まってバッチを形成する傾向ある。ネットワークのゆらぎは構造の形成と崩壊を伴った振幅の大きい非線型ゆらぎであることが示された。3 立体構造の起源とゆらぎ生命進化の初期に蛋白質構造のグランドデザインがなされたとすれば、それはどのように行われたのであろうか、どのような構造や配列が出現しうるか、という統計法則を得るために、"活性中心の構造を粗く保持する能力をもつようにデザインされる"という選択過程を模した理論的モデルを構築している。経験的力場を用いたモデル、およびスピングラス理論を用いたモデルの開発を行い、選択された配列のフォールディングのキネティックス、構造の分析が進んでいる。

(1) the combination of proteins in the principle, principle, and combination of proteins, the combination of proteins, the field of force, the production of native, and the artificial production of proteins. The ability to make a multiple reference, the ability to make a multi-reference, a certain speed, and so on. If you choose a multi-body system, the speed of the system must be determined, and the information will be affected. (2) Water consumption and protein consumption. Water and water consumption are analyzed. The index created by the bureau is based on the analysis of the new statistics. The molecular dynamics calculation method and the water content are combined with the time limit of the environmental engineering bureau to show that the time limit is up to the limit time limit and the time limit is not available. At room temperature, the life span is 100 seconds, 10 seconds, 10 seconds, and the distribution of molecules, molecules. The result is that the collapse is accompanied by a large amplitude, a large amplitude and a large amplitude. 3. The origin of stereoscopic equipment. In the early stage of life, the protein was used in the early stage of life. In the early stage of life, the protein was used in the early stage of life. The active center is used to maintain the ability to maintain the ability to improve the performance of the process model. The force field of the railway is used in the field of labor, the theory and theory of the system is used to open the business, select the appropriate equipment, and make the analysis and analysis.