课题基金 / 基金详情

動的インバースフォールディングと統計法則

動的インバースフォールディングと統計法則
动态逆折叠和统计定律
批准号：
09261213
负责人：
笹井 理生
金额：
$1.02万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1997 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09261213/
关键词：
蛋白質フォールディングスピングラスエネルギーランドスケープ

项目摘要

项目成果

笹井 理生的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
翻译
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
蛋白質のフォールド能力は進化の歴史上でいつどのように獲得されたのであろうか?近年の理論的研究は残基間の相互作用におけるフラストレーションを極小化することがフォールド能力を持つ配列を選択するための必要条件であることを示してきた。しかし、可能な配列数は莫大で、生物の進化史的な時間の範囲内に広大な配列空間をくまなく探して最適化することは不可能であるように思われる。もし、広大な配列空間の一部だけから現存の蛋白質が選ばれてきたとしたら、それはどのような仕方によってであろうか?この問題を考えるために1)スピングラス模型、2)ランダムエネルギー模型、3)経験的ポテンシャルを用いた模型、4)格子模型を用いた次の4つの理論的アプローチを試みた。その結果、機能を持つ配列を選択するだけでフォールド能力を持つ配列が自然に選ばれる、というシナリオの妥当性が示唆された。また、機能を持つ全体構造は非常に多数存在し、その一つがゆらぎによって偶然選ばれること、選ばれた全体構造を最安定化するように配列は進化せず、機能を保持できる範囲の多数の配列の間を中立的にゆらぐこと、この2つの理由により、全配列空間の網羅的探索なしでも、実際的な時間内でフォールド能力を持つ配列が選択されうることが示された。さらに、配列空間の構造とフォールディングファネルとの相関を分析することにより、蛋白質における進化的側面と物理化学的側面の関係を明らかにしていけるのではないかと、将来の研究の可能性が予想される。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
S.Saito, M.Sasai and T.Yomo: "Evolution of the folding ability of proteins through functional selection" Proc.Notl.Acad.Sci.USA. 94. 11324-11328 (1997)
S.Saito、M.Sasai 和 T.Yomo：“通过功能选择实现蛋白质折叠能力的进化”Proc.Notl.Acad.Sci.USA。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
E.Shiratani and M.Sasai: "Molecular scale precursor of the liouid-liquid transition" J.Chem.Phys.108(印刷中). (1998)
E. Shiratani 和 M. Sasai：“液-液转变的分子尺度前体”J.Chem.Phys.108（出版中）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
笹井理生: "蛋白質フォールディングの物理を探る" 日本物理学会誌. 52. 901-908 (1997)
Rio Sasai：“探索蛋白质折叠的物理学”日本物理学会杂志 52. 901-908 (1997)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Principles of genome dynamics and DNA functions
蛋白質の柔らかいダイナミクスの分子論
  • 批准号：
    18031017
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $8.0万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    笹井 理生
  • 依托单位：
    Nagoya University
機能発現の蛋白質ダイナミクス理論
  • 批准号：
    16041221
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $9.02万
  • 财政年份：
    2004
  • 负责人：
    笹井 理生
  • 依托单位：
    Nagoya University
遺伝子の確率的発現とネットワーク
  • 批准号：
    16014210
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $3.9万
  • 财政年份：
    2004
  • 负责人：
    笹井 理生
  • 依托单位：
    Nagoya University
海外基金