遺伝子の確率的発現とネットワーク

随机基因表达和网络

基本信息

  • 批准号:
    16014210
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

次の4つの研究成果を得た。(1)平均場理論の遺伝子ネットワークへの適用:新しく開発された平均場理論は、分子数ゆらぎの強弱によって、アトラクターへの軌道引き込みが制御されることを示した。これを手がかりに、ネットワークの振る舞いの多様性に関する実験結果の説明を試みた。また、複数の遺伝子ネットワークの結合による集団的振る舞いを解析し、生物工学的な実験を提言した。数個の遺伝子からなるネットワークについて、揺らぎ効果の定量的解析を行い、頑健で機能性のあるモチーフとは何か、という問題についての議論を行った。(2)外部摂動への応答と揺らぎの分析:経路積分法を用いて平均場理論を超えた揺らぎの記述理論を展開し、温度、インヂューサー分子数変化などの摂動に対する遺伝子ネットワークの応答を理論的に解析した。(3)複数アトラクターを持つネットワークのデザインと遷移ダイナミクスの解析:フラストレーションを最小にするようにネットワークをデザインする方法が有効であるか、数値計算との比較によって検討を行った。さらに、経路積分法によって複数アトラクター間の遷移ダイナミクスの構造を分析し、数値計算、実験データと比較を行う方法を開発した。(4)酵母の細胞周期ネットワークにおける揺らぎとダイナミクスの解析:ネットワーク構造をモデル化し、細胞周期チェックポイントが安定なアトラクターになっていること、チェックポイントに向かうダイナミクスに安定性があることを遺伝子発現の確率モデルの立場から検討した。
The results of this research were obtained. (1)The application of mean field theory to the evolution of molecular dynamics: new developments in mean field theory, molecular dynamics, and orbital dynamics This hands-on approach will explain the practical results related to the diversity of the Internet's vibration and dance. The analysis of the vibration of the group and the implementation of the biological engineering are also mentioned. A number of problems arise in the quantitative analysis of results, in the functional analysis, and in the discussion of problems. (2)Analysis of external motion and response: application of path integration theory to the analysis of theoretical development, temperature, molecular change and response (3)The analysis of complex data sets: data sets are minimized, data sets are calculated, and data sets are compared. In this paper, the method of circuit integration is developed to analyze the structure, calculate the numerical value and compare the numerical value of the transition between the two classes. (4)Yeast cell cycle analysis: cell cycle structure, cell cycle structure, stability, stability, and accuracy of cell generation.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Self-consistent proteomic field theory of stochastic gene switches.
  • DOI:
    10.1529/biophysj.104.050666
  • 发表时间:
    2004-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    A. Walczak;M. Sasai;P. Wolynes
  • 通讯作者:
    A. Walczak;M. Sasai;P. Wolynes
Inertia of Chemotactic Motion as an Emergent Property in a Model of Eukaryotic Cell
趋化运动惯性作为真核细胞模型中的新兴特性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.I.Nishimura;M.Sasai
  • 通讯作者:
    M.Sasai
Inertia of amoebic cell locomotion as an emergent collective property of the cellular dynamics
  • DOI:
    10.1103/physreve.71.010902
  • 发表时间:
    2005-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Nishimura, SI;Sasai, M
  • 通讯作者:
    Sasai, M
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

笹井 理生其他文献

4Dゲノムアーキテクチュア:細胞核のなかのポリマー凝縮系
4D基因组结构:细胞核中的聚合物凝聚系统
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤城 新;笹井 理生
  • 通讯作者:
    笹井 理生
量子マスター方程式法による超分子系のエネルギー移動への置換基効果の解析
利用量子主方程法分析取代基对超分子体系能量传递的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    依田 充正;江口 浩平;寺田 智樹;笹井 理生;中野雅由
  • 通讯作者:
    中野雅由
Entropic phase separation of chromatin domains to form chromosome compartments
染色质结构域的熵相分离形成染色体区室
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤城 新;笹井 理生
  • 通讯作者:
    笹井 理生
20世紀のトップ10アルゴリズム
20世纪十大算法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    金田 行雄;笹井 理生;張 紹良
  • 通讯作者:
    張 紹良
Ab inition MO-CI based quantum master equation approach to energy migration dynamics in nanostar dendrimers
基于 Ab inition MO-CI 的量子主方程方法研究纳米星树枝状聚合物中的能量迁移动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西村 信一郎;笹井 理生;Masayoshi Nakano
  • 通讯作者:
    Masayoshi Nakano

笹井 理生的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('笹井 理生', 18)}}的其他基金

Principles of genome dynamics and DNA functions
基因组动力学和 DNA 功能原理
  • 批准号:
    22H00406
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
蛋白質の柔らかいダイナミクスの分子論
蛋白质软动力学分子理论
  • 批准号:
    18031017
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
機能発現の蛋白質ダイナミクス理論
功能表达的蛋白质动力学理论
  • 批准号:
    16041221
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
蛋白質機能発現のダイナミカルモデリング
蛋白质功能表达的动态建模
  • 批准号:
    15014214
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
蛋白質機能発現のダイナミカルモデリング
蛋白质功能表达的动态建模
  • 批准号:
    14015212
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
動的インバースフォールディングと統計法則
动态逆折叠和统计定律
  • 批准号:
    10157211
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
動的インバースフォールディングと統計法則
动态逆折叠和统计定律
  • 批准号:
    09261213
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
動的インドースフォールディングと統計法則
动态逆折叠和统计定律
  • 批准号:
    08272210
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
動的インドースフォールディングと統計法則
动态逆折叠和统计定律
  • 批准号:
    08272210
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ネットワークのトポロジカル組み替え運動と分子乱流
网络中的拓扑重组运动和分子湍流
  • 批准号:
    07236220
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

相似海外基金

複数時間ウィンドウでの哺乳類脳操作を実現する薬剤誘導性人工遺伝子スイッチ開発
开发药物诱导的人工基因开关以实​​现多时间窗口的哺乳动物大脑操控
  • 批准号:
    16J07625
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
人工遺伝子スイッチSAHA-PIPによる心筋細胞の誘導
人工基因开关SAHA-PIP诱导心肌细胞
  • 批准号:
    15J02111
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
複数時間ウィンドウでの哺乳類脳操作を実現する薬剤誘導性人工遺伝子スイッチ開発
开发药物诱导的人工基因开关以实​​现多时间窗口的哺乳动物大脑操控
  • 批准号:
    15H06145
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
生育適温域に発見した‘生育変曲点’で機能する植物の温度依存的遺伝子スイッチの同定
鉴定植物中在最佳生长温度范围内发现的“生长拐点”发挥作用的温度依赖性基因开关
  • 批准号:
    09J03230
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
PAX6―SOX2―DNA複合体の塩基配列特異的な構造変化と遺伝子スイッチ機能
PAX6-SOX2-DNA复合物的序列特异性结构变化和基因开关功能
  • 批准号:
    20051014
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
細胞内シグナル応答型遺伝子スイッチの創製と心臓疾患新規遺伝子治療法の開発
创建细胞内信号响应基因开关并开发心脏病的新型基因治疗方法
  • 批准号:
    14658291
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了