NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
批准号:
08272203
负责人:
田之倉 優
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --
中文摘要
クロコウジカビAspergillus niger var.macrosporusが分泌する酸性プロテアーゼAは基質特異性、阻害剤に対する反応性、一次構造、分子量等の性状が、従来のペプシン型酵素とは著しく異なる新規の酸性プロテアーゼである。本研究では、プロテアーゼAの立体構造、変性中間状態ならびに中性変性過程の解析を行ない、プロテアーゼAの折れたたみ機構を明らかにすることを目指してX線結晶構造解析とX線小角散乱測定を行った。本酵素が活性を示すpH1.5〜3で得られた結晶についてX線回折を測定したところ、1.5Åの分解能の反射が得られた。重原子誘導体の探索を行った結果、Hgおよび2種類のPtの同型置換体が得られた。電子密度図から、この分子はクロワッサン型をしており、αヘリックスを含まずβシートのみからなることが分かった。アスパラギン酸プロテアーゼも主としてβシートからなるクロワッサン型をしており、プロテアーゼAは分子量がアスパラギン酸プロテアーゼに比べて約半分であるにもかかわらず、分子の外形はアスパラギン酸プロテアーゼと大雑把には相似形といえる。ただ、βシート構造の分子全体に対する配向が両者で明らかに異なっており、プロテアーゼAの立体構造法は新規の3次元構造だと考えられる。また、酸性から弱アルカリ性の種々のpHでX線小角散乱の測定を行った。その結果、GuinierプロットからpHが高くなるに従って慣性半径Rgが増大することが示された。またKratkyプロットから、(1)pH4.5ではfolded structure、pH6.75や7.0ではunfolded structureであること、(2)pH6.2では完全なfolded stateでもunfolded stateでもない中間的な状態であること、が分かった。pH4.5からpH8.0への遷移速度をX線小角散乱測定したところ、時定数0.5秒の遷移が見られた。
英文摘要
クロコウジカビAspergillus niger var.macrosporusが分泌する酸性プロテアーゼAは基質特異性、阻害剤に対する反応性、一次構造、分子量等の性状が、従来のペプシン型酵素とは著しく異なる新規の酸性プロテアーゼである。本研究では、プロテアーゼAの立体構造、変性中間状態ならびに中性変性過程の解析を行ない、プロテアーゼAの折れたたみ機構を明らかにすることを目指してX線結晶構造解析とX線小角散乱測定を行った。本酵素が活性を示すpH1.5〜3で得られた結晶についてX線回折を測定したところ、1.5Åの分解能の反射が得られた。重原子誘導体の探索を行った結果、Hgおよび2種類のPtの同型置換体が得られた。電子密度図から、この分子はクロワッサン型をしており、αヘリックスを含まずβシートのみからなることが分かった。アスパラギン酸プロテアーゼも主としてβシートからなるクロワッサン型をしており、プロテアーゼAは分子量がアスパラギン酸プロテアーゼに比べて約半分であるにもかかわらず、分子の外形はアスパラギン酸プロテアーゼと大雑把には相似形といえる。ただ、βシート構造の分子全体に対する配向が両者で明らかに異なっており、プロテアーゼAの立体構造法は新規の3次元構造だと考えられる。また、酸性から弱アルカリ性の種々のpHでX線小角散乱の測定を行った。その結果、GuinierプロットからpHが高くなるに従って慣性半径Rgが増大することが示された。またKratkyプロットから、(1)pH4.5ではfolded structure、pH6.75や7.0ではunfolded structureであること、(2)pH6.2では完全なfolded stateでもunfolded stateでもない中間的な状態であること、が分かった。pH4.5からpH8.0への遷移速度をX線小角散乱測定したところ、時定数0.5秒の遷移が見られた。
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Zenno,S.,Koike,H.,Tanokura,M.and Saigo,K.: "Conversion of NfsB.a minor Escherichia coli nitroreductase,to a flavin reductase similar in biochemical properties to Frase I,the major flavin reductase in Vibrio fischeri,by a single amino acid substitution." J
Zenno,S.,Koike,H.,Tanokura,M. 和 Saigo,K.:“将 NfsB.一种次要的大肠杆菌硝基还原酶转化为生化特性与 Frase I 类似的黄素还原酶,Frase I 是费氏弧菌中的主要黄素还原酶
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Nishivama,M.,Kinoshita,M.,Kudo,H.,Horinouchi,S.and Tanokura,M.: "Enhancement of the turnover number of thermostable malate dehydrogenase by deleting hydrogen bonds around the catalytic site." Biochemical and Biophysical Research Communications. 225. 844-8
Nishivama,M.、Kinoshita,M.、Kudo,H.、Horinouchi,S. 和 Tanokura,M.:“通过删除催化位点周围的氢键来提高热稳定苹果酸脱氢酶的周转数。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Zenno,S.,Koike,H.,Kumar,A.N.,Jayaraman,R.,Tanokura,M.and Saigo,K.: "Biochemical characterization of NfsA,the Escherichia coli major nitroreductase cxhibiting a high amino acid sequence homology to Frp,a Vibrio harveyi flavin oxidoreductase." Journal of Ba
Zenno,S.、Koike,H.、Kumar,A.N.、Jayaraman,R.、Tanokura,M. 和 Saigo,K.:“NfsA 的生化特征,NfsA 是一种与 Frp 具有高度氨基酸序列同源性的大肠杆菌主要硝基还原酶,
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hatano,K.,Tanokura,M.and Takahashi,K.: "Tertiary Structure Comparison of Bromelain Inhibitor VI from Pineapple Stem with Bovine Pancreatic Trypsin Inhibitor." Proceedings of Japan Academy. 72B. 104-107 (1996)
Hatano,K.、Tanokura,M. 和 Takahashi,K.:“菠萝茎中菠萝蛋白酶抑制剂 VI 与牛胰蛋白酶抑制剂的三级结构比较”。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kukimoto,M.,Nishiyama,M.,Tanokura,M.,Adman,E.T.and Horinouchi,S.: "Studies on protein-protein interaction between copper-containing nitrite reductase and pseudoazurin from Alcaligenes faecalis S-6." Journal of Biolgical Chemistry. 271. 13680-13683 (1996)
Kukimoto,M.、Nishiyama,M.、Tanokura,M.、Adman,E.T. 和 Horinouchi,S.:“含铜亚硝酸还原酶和粪产碱菌 S-6 中的伪天青蛋白之间的蛋白质-蛋白质相互作用研究”。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 13 条
NMRを用いたメタボロミクス分析法の開発及び応用
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批准号:12F02090
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2012
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
WWドメインの機能と特異性に関する総合理解を目指した構造構能相関研究
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批准号:15657024
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
発光細菌の発光反応関連酵素群のX線結晶構造解析
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批准号:11169206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$55.17万
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财政年份:1999
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
ブロメラインインヒビターの3次元構造解析とそれに基づく阻害剤の開発
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批准号:10163205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1998
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
X線とNMRによるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:10157201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
キネシンとncdのNMRによる動的構造の解析
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批准号:09279210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:09261205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
ブロメラインインヒビターの3次元構造解析とそれに基づく阻害剤の開発
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批准号:09267204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線小角散乱によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:07280203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
りん核磁気共鳴法によるアクトミオシン反応中間体の立体構造の研究
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批准号:03223205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1991
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
分子レベルから見たトロポニンの筋収縮制御機構- T, I, C間相互作用のNMR測定
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批准号:57780244
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
分子レベルから見たトロポニンTの機能(キモトリプシン分解フラグメントの相互作用)
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批准号:56790187
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1981
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
国内基金
海外基金
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基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
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批准号:22504159
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:王梓
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依托单位:
分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
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批准号:22502216
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:胡敏
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依托单位:
NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
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批准号:22504158
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:何小玲
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依托单位:
基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
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批准号:22577099
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:谢华勇
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依托单位:
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
新颖高灵敏F-19 NMR光化学诱导动态核极化技术开发与活细胞应用探索
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批准号:22574165
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:柴兆斐
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依托单位:
基于13C NMR的黄土高原半干旱区土壤有机碳稳定性对长期保护性耕作的响应机制
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批准号:32572472
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:李玲玲
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依托单位:
新型Hoogsteen核酸链置换反应重启G四链体过氧化物酶活性的NMR研究
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批准号:32571393
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项目类别:面上项目
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资助金额:51.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张钠
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依托单位:
低旋磁比固体MAS NMR信号检测关键技术与方法的研究
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批准号:22574167
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张志
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依托单位:
双金属改性分子筛催化甲烷选择性氧化反应的固体NMR研究
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批准号:22572201
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:郝全果
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依托单位: