WWドメインの機能と特異性に関する総合理解を目指した構造構能相関研究

结构-结构相关性研究旨在全面了解WW域的功能和特殊性

• 批准号: 15657024
• 负责人: 田之倉 優
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15657024/
• 关键词: WWドメイン; 表面プラズモン共鳴; 分子モデリング; シグナル伝達; 相互作用解析; プロリン・リッチ配列; リン酸化; アルツハイマー病

WWドメインは40残基程度の小さなタンパク質モチーフである。このドメインは相互作用モジュールとして、細胞周期制御(Pin1/Ess1),ユビキチンライゲーション(Nedd4/Rsp5,smurf1)、転写制御(YAP65)、スプライシングファクター(FBPs)など多岐にわたる機ををもつタンパク質中に存在している。いくつかのWWドメインはリドル症候群、デシャンヌ型筋ジストロフィー、ハンチントン病やアルツハイマー病などの病気と直接または間接的に関わる。WWドメインはプロリン・リッチな配列と相互作用することが知られているが、近年のゲノム解析で高等生物ゲノムにもっとも多く含まれるタンパク質モチーフはプロリン・リッチモチーフである。ポストゲノム時代の研究戦略を取り入れて、その基礎となるフレームワークを構築するような研究を行うことで、より迅速な理解が可能だと考えられる。したがってわれわれはWWドメインというモチーフがプロリン・リッチ配列をユニバーサルに認識する重要なタンパク質であるという観点から、上記Pin1/Ess1,FBR,Fe65などのWWドメインの結合特異性を表面プラズモン共鳴などの手法で明らかにし、分子モデリングで立体構造の観点から相互作用メカニズムを明らかにした。その結果グループI〜IVWWドメインでその特異性の鍵となる分子表面の構造を見出した。グループIではTyrグルーブ、グループII/IIIは第2XPグルーブ、グループIVはpパッチと名づけた独特の表面構造があり、それらがこれらWWドメインの特異性を規定していることがわかった。またそれぞれのグループのリガンドのコンセンサス配列も決めた。これらの結果はWWドメインの機能を理解するうえで特に重要な情報であり、機能未知のWWドメインの機能を予測することにも利用可能である。

WW is the most common type of protein. These include: cell cycle control (Pin1/Ess1), cell cycle control (Nedd4/Rsp5,smurf1), cell cycle control (YAP65), cell cycle control (FBPs), and multiple cell cycle control (FBPs). The disease is directly or indirectly related to the disease. In recent years, the analysis of higher biological species has been carried out in a variety of ways. The research strategy of the times is taken into consideration, the foundation is built, the research is conducted, the understanding is rapid, and the research is possible. Pins 1/Ess1,FBR,Fe65, the binding specificity of WW, the surface resonance, the molecular structure, the stereostructure, the interaction, the interaction. As a result, the structure of the molecular surface was revealed. The surface structure of the unique surface of the product is specified in the specification of the specificity of the product. The solution to this problem is to set up a database for the first time. The result is to understand the function of the WW and to predict the function of the WW and to make use of it.

项目成果

Ito, M., Kato, Y., Nagata, K., Oda, Y., Yamagoe, S., Suzuki, K., Tanokura, M.: "Expression, oxidative refolding and characterization of six-histidine-tagged recombinant human LECT2, a 16-kDa chemotactic protein with three disulfide bonds"Protein Express.P

Ito, M.、Kato, Y.、Nagata, K.、Oda, Y.、Yamagoe, S.、Suzuki, K.、Tanokura, M.：“六组氨酸标记重组人的表达、氧化重折叠和表征

Iwasaki, W., Sasaki, H., Nakamura, A., Kohama' K., Tanokura, M.: "Metal-free and Ca^<2+>-bound structures of a multidomain EF-hand protein, CBP40, from the lower eukaryote, Physarum polycephalum."Structure. 11. 75-85 (2003)

Iwasaki, W.、Sasaki, H.、Nakamura, A.、Koham K.、Tanokura, M.：“多域 EF 手蛋白 CBP40 的无金属和 Ca^2 结合结构，来自

Suzuki, R., Nagata, K., Yumoto, F., Kawakami, M., Nemoto, N., Furutani, M., Adachi, K., Maruyama, T., Tanokura, M.: "Three-dimensional solution structure of an archaeal FKBP with a dual function of peptidyl prolyl cis-trans isomerase and chaperone-like ac

Suzuki, R.、Nagata, K.、Yumoto, F.、Kawakami, M.、Nemoto, N.、Furutani, M.、Adachi, K.、Maruyama, T.、Tanokura, M.：“三维解决方案

田之倉優, 伊東孝祐: "ナノバイオテクノロジーの最前線(植田充美監修)、X線結晶構造解析からみるナノバイオテクノロジー"シーエムシー出版. 11 (2003)

Yu Tanokura、Kosuke Ito：“纳米生物技术的最前沿（上田光美监督），从X射线晶体结构分析中看到的纳米生物技术”CMC Publishing 11（2003）。

Katayama, H., Nagata, K., Ohira, T., Yumoto, F., Tanokura, M., Nagasawa, H.: "The solution structure of molt-inhibiting hormone from the kuruma prawn Marsupenaeus japonicus."J.Biol.Chem.. 278. 9620-9623 (2003)

Katayama，H.，Nagata，K.，Ohira，T.，Yumoto，F.，Tanokura，M.，Nagasawa，H.：“来自车虾Marsupenaeus japonicus的蜕皮抑制激素的溶液结构。”J.Biol