発光細菌の発光反応関連酵素群のX線結晶構造解析
発光細菌の発光反応関連酵素群のX線結晶構造解析
批准号:
11169206
负责人:
田之倉 優
金额:
$55.17万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2002
中文摘要
発光細菌の発光系は発光反応を触媒するモノオキシゲナーゼであるルシフェラーゼと、そのルシフェラーゼに発光基質の還元型FMNと飽和長鎖脂肪族アルデヒドを供給する共役系酵素(FMN還元酵素FRaseI及び脂肪酸還元酵素)により構成される。Photobacterium(Vibrio)harveyiのルシフェラーゼとFMN還元酵素間の直接相互作用の証拠が見出されており、共役系を含めた複合体による効率の良い発光反応系は大変興味深い。Photorhabdus luminescensのルシフェラーゼがFMN還元酵素と比較的安定な複合体を形成することから、そのルシフェラーゼの大量発現、精製、結晶化を行った。現在、球晶が得られており、解析可能な単結晶を得るために条件検討を行っている。また、FMN還元酵素のFRaseIとアミノ酸配列上相同性が高いものの機能が明確に異なる酵素として大腸菌のニトロ還元酵素NfsBがある。大腸菌はニトロ還元酵素としてNfsBに加えてNfsAも有する。本研究では、酵素群の構造機能相関を原子レベルで詳細に解明するために、これらの酵素群のX線結晶構造解析を酵素反応速度解析とともに行なった。われわれは既に、FRaseI、NfsAおよびNfsB-NAD^+複合体の結晶構造解析をそれぞれ分解能1.8Å、1.7Åおよび2.0Åで行っている。さらに、Phe124をSer残基に置換したNfsBの変異体がフラビン還元酵素のような基質特異性を示すことから、NfsBのF124S変異体の結晶構造解析も行った。
英文摘要
発光細菌の発光系は発光反応を触媒するモノオキシゲナーゼであるルシフェラーゼと、そのルシフェラーゼに発光基質の還元型FMNと飽和長鎖脂肪族アルデヒドを供給する共役系酵素(FMN還元酵素FRaseI及び脂肪酸還元酵素)により構成される。Photobacterium(Vibrio)harveyiのルシフェラーゼとFMN還元酵素間の直接相互作用の証拠が見出されており、共役系を含めた複合体による効率の良い発光反応系は大変興味深い。Photorhabdus luminescensのルシフェラーゼがFMN還元酵素と比較的安定な複合体を形成することから、そのルシフェラーゼの大量発現、精製、結晶化を行った。現在、球晶が得られており、解析可能な単結晶を得るために条件検討を行っている。また、FMN還元酵素のFRaseIとアミノ酸配列上相同性が高いものの機能が明確に異なる酵素として大腸菌のニトロ還元酵素NfsBがある。大腸菌はニトロ還元酵素としてNfsBに加えてNfsAも有する。本研究では、酵素群の構造機能相関を原子レベルで詳細に解明するために、これらの酵素群のX線結晶構造解析を酵素反応速度解析とともに行なった。われわれは既に、FRaseI、NfsAおよびNfsB-NAD^+複合体の結晶構造解析をそれぞれ分解能1.8Å、1.7Åおよび2.0Åで行っている。さらに、Phe124をSer残基に置換したNfsBの変異体がフラビン還元酵素のような基質特異性を示すことから、NfsBのF124S変異体の結晶構造解析も行った。
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Nagata,K.,Kudo,N.,Abe,K.,Arai,S.and Tanokura,M.: "Three-dimensional solution structure of oryzacystatin-I, a cysteine proteinase inhibitor of the rice, Oryza sativa L.japonica"Biochemistry. 39. 14753-14760 (2000)
Nagata,K.、Kudo,N.、Abe,K.、Arai,S. 和 Tanokura,M.:“水稻半胱氨酸蛋白酶抑制剂 oryzacystatin-I 的三维溶液结构”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
田之倉優、小堀俊郎: "フラビン還元酵素の構造決定と機能解析"バイオサイエンスとバイオインダストリー. 56(5). 319-322 (1998)
Yu Tanokura,Toshiro Kobori:“黄素还原酶的结构测定和功能分析”生物科学与生物工业56(5)319-322(1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
小堀俊郎、田之倉優: "フラビン還元酵素Fraselとそのファミリー"化学と生物. 36(6). 355-356 (1998)
Toshiro Kobori、Yu Tanokura:“黄素还原酶 Frasel 及其家族”,化学与生物学 36(6)(1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sawano, Y., Muramatsu, T., Hatano, K., Nagata, K., Tanokura, M.: "Characterization of genomic sequence coding for bromelain inhibitors in pineapple and expression of its recombinant isoform"Journal of Biological Chemistry. 277・31. 28222-28227 (2002)
Sawano, Y.、Muramatsu, T.、Hatano, K.、Nagata, K.、Tanokura, M.:“菠萝中菠萝蛋白酶抑制剂编码基因组序列的表征及其重组异构体的表达”《生物化学杂志》277。 31. 28222-28227 (2002)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Iwasaki, W., Sasaki, H., Nakamura, A., Kohama, K., Tanokura, M.: "Metal-free and Ca^<2+>-bound structures of a multidomain EF-hand protein, CBP40, from the lower eukaryote, Physarum polycephalum"Structure. 11・1. 75-85 (2003)
Iwasaki, W.、Sasaki, H.、Nakamura, A.、Kohama, K.、Tanokura, M.:“多域 EF 手蛋白 CBP40 的无金属和 Ca^2+ 结合结构,来自低等真核生物,多头绒泡菌”《结构》. 11・1. 75-85 (2003)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 24 条
NMRを用いたメタボロミクス分析法の開発及び応用
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批准号:12F02090
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2012
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
WWドメインの機能と特異性に関する総合理解を目指した構造構能相関研究
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批准号:15657024
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
ブロメラインインヒビターの3次元構造解析とそれに基づく阻害剤の開発
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批准号:10163205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1998
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
X線とNMRによるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:10157201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
キネシンとncdのNMRによる動的構造の解析
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批准号:09279210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:09261205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
ブロメラインインヒビターの3次元構造解析とそれに基づく阻害剤の開発
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批准号:09267204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:08272203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:08272203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
NMRとX線小角散乱によるクロコウジカビ酸性プロテアーゼAの折れたたみ機構の解析
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批准号:07280203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
りん核磁気共鳴法によるアクトミオシン反応中間体の立体構造の研究
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批准号:03223205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1991
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
分子レベルから見たトロポニンの筋収縮制御機構- T, I, C間相互作用のNMR測定
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批准号:57780244
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
分子レベルから見たトロポニンTの機能(キモトリプシン分解フラグメントの相互作用)
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批准号:56790187
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1981
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负责人:田之倉 優
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依托单位:
海外基金