タバコネクロシスウィルスの高分解能立体構造と粒子形成機構の解析
タバコネクロシスウィルスの高分解能立体構造と粒子形成機構の解析
批准号:
11169223
负责人:
福山 恵一
金额:
$17.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2002
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英文摘要
タバコネクロシスウィルス(TNV)は一本鎖RNAをゲノムとして持つ球状ウィルスであり、アガサ・ナス・マメ・ユリ科などの植物に感染し、壊疽症状を起こす。TNVのサブユニットは276アミノ酸残基からなる一次構造上一種類のタンパクであるが、これが180個集合してT=3の正20面体対称を持つキャプシドを形成している。TNV粒子はN末端領域の立体構造が異なる3種類のサブユニットから構成されていることを既に明らかにしている。さらにサブユニットの境界にCa^<2+>イオンがあり、EDTA処理により粒子は解離し、またCa^<2+>の添加により元の粒子と区別できない粒子に再構成することも明らかにしている。本研究では、N末端が粒子形成にどのように影響するか、さらにその構造基盤を明らかにすべく解析を進めた。まずN末端を欠いたサブユニットををコードする遺伝子の発現系を構築し、大腸菌で大量発現させた。このタンパク質は不溶性画分に得られたので、これを尿素で可溶化した後、尿素を除くことでリフォールドさせた。このタンパク質はCa^<2+>存在下で天然の粒子より小さな粒子に再構成した。この粒子の形・サイズから正20面対称的に60個会合したと考えられる。この粒子の立体構造解析のため、結晶化を試みたところ、約0.2mmの大きさの単結晶を得た。この結晶は正方晶系に属し、単位格子中に4粒子含まれる。放射光を用いたX線回折実験で、2.7Å以上の分解能の回折点を観測できた。数百万の回折強度データを収集し、現在これに基づいて構造解析中である。
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Atsushi Yamagata: "The crystal structure of exonuclease RecJ bound to Mn^<2+> ion suggests how its characteristic motifs are involved in exonuclease activity"Proc. Nati. Acad. Sci. USA. 99・(9). 5908-5912 (2002)
Atsushi Yamagata:“与 Mn^2+ 离子结合的核酸外切酶 RecJ 的晶体结构表明其特征基序如何参与核酸外切酶活性”Proc.Nati.5908-5912。 2002)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Masakazu Sugishima: "Crystal Structure of Rat Apo-Heme Oxygenase-1 (HO-1) : Mechanism of Heme Binding in HO-1 Inferred from Structural Comparison of the Apo and Heme Complex Forms"Biochemistry. 41・(23). 7293-7300 (2002)
Masakazu Sugishima:“大鼠 Apo-血红素加氧酶-1 (HO-1) 的晶体结构:从 Apo 和血红素复合物形式的结构比较推断出 HO-1 中血红素的结合机制”生物化学 41・(23)。 7300 (2002)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Yoshimitsu Kakuta: "Crystal Structure of Escherichiacoli Fdx, an Adrenodoxin-Type Ferredoxin Involved in the Assembly of Iron-Sulfur Clusters"Biochemistry. 40. 11007-11012 (2001)
Yoshimitsu Kakuta:“大肠杆菌 Fdx 的晶体结构,一种参与铁硫簇组装的肾上腺氧还蛋白型铁氧还蛋白”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Yoshimitsu Shimomura: "Overproduction, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a quinone oxidoreductase from Thermus thermophilus HB8"Acta Crystallographica. D58. 1365-1367 (2002)
Yoshimitsu Shimomura:“来自嗜热栖热菌 HB8 的醌氧化还原酶的过量生产、结晶和初步 X 射线衍射分析”晶体学报。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Masakazu Sugishima: "Crystal Structure of Rat Heme Oxygenase-1 in Complex with Heme Bound to Azide"J. Biol. Chem.. 277・(47). 45086-45090 (2002)
Masakazu Sugishima:“与叠氮化物结合的大鼠血红素氧化酶-1的晶体结构”J. Chem. 277・(47) (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
金属タンパク質の超高分解能X線結晶解析から金属イオンの軌道電子を見る
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批准号:20657022
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2008
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明
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批准号:18054016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.78万
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财政年份:2006
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明
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批准号:17053014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2005
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの立体構造に基づく基質の酸化と活性化機構の解明
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批准号:10129219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの静的および動的立体構造に基づく基質の活性化機構の解明
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批准号:09235217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの反応過程における構造変化の結晶学的追跡
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批准号:08214206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1996
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの静的および動的立体構造に基づく基質の活性化機構の解明
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批准号:08249222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの反応過程における構造変化の結晶学的追跡
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批准号:07224207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1995
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの酸素脱着反応に伴う構造変化の結晶的追跡
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批准号:06235208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1994
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
ペルオキシダーゼの酸素脱着反応に伴う構造変化の結晶学的追跡
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批准号:05244205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1993
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
蛋白質部による-硫黄クラスターの物性と制御機構
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批准号:04225218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1992
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
蛋白質部分による鉄ー硫黄クラスタ-の物性と反応性の制御機構
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批准号:03241216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1991
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
アラビスモザイクウイルスのX線結晶構造解析
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批准号:59580104
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1984
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
アラビスモザイクウイルスの結晶化および結晶構造解析
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批准号:58780152
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1983
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
フェレドキシンーNADP還元酵素の結晶化およびX線構造解析
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批准号:X00090----458065
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1979
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
葉緑体型フェレドキシンの結晶構造解析
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批准号:X00210----378059
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1978
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负责人:福山 恵一
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依托单位:
コウジ菌の発ガン性代謝産物及びその関連物質の分子構造及び結晶構造の決定
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批准号:X00210----174184
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.19万
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财政年份:1976
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负责人:福山 恵一
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依托单位: