球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明
阐明球形病毒颗粒多样性表达机制和颗粒形成层次
基本信息
- 批准号:17053014
- 负责人:
- 金额:$ 1.86万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ウイルスは遺伝情報を持つ核酸とそれを取り囲むタンパク質からなる超分子複合体である。ウイルスのコートタンパク質(CP)は、三次構造をとることに加え、高度に秩序だった集合体を形成する。本研究では球状をした植物ウイルスであるタバコネクローシスウイルス(TNV)をとりあげた。TNVは180個のCPが集合してRNAを包んでおり、TNV粒子の立体構造から、N末端領域が多様なコンフォメーションをとっていることが明らかになった。さらに、この領域を削除したタンパク質(Δ85)を調製したところ、これが60個集合した粒子を形成し、またこの粒子の立体構造も2.7A分解能で決定した。TNVにおける四次構造の多様性、および粒子形成の階層性を明らかにするため、Δ85の他、Δ56、Δ62、Δ74タンパク質も調製した。ところが、これらのタンパク質は沈殿画分に表れ、正しくフォールドしなかった。Δ85タンパク質も凝集しやすい性質をもっており、Ca^<2+>イオンやpHを変えても、ホモジニアスな会合体をとらないことがわかった。一方、ラン藻などの光合成生物はフィコビリソームという光を捕集するタンパク質-色素複合体を持っている。この色素の合成に関与する酵素(PcyA)と基質(ビリベルジン)との複合体の立体構造を決定した。これにより、基質を正確に認識するアミノ酸残基、基質の一見離れた2ケ所を順序よく、しかも立体特異的に還元する分子機構を明らかにした。また、グルタチオン代謝の主要酵素、γ-グルタミルトランスペプチダーゼ、の立体構造を決定した。さらに、アシル-酵素中間体の構造を、クライオトラップ法を適用して決定した。これらから、酵素が基質をどのように捉えているかを明らかにし、これまでの生化学・変異実験の結果に分子基盤を与えた。
It's called a supermolecular complex. The third order structure is formed by adding the first order structure to the second order structure. In this study, the spherical plant was used as a starting point. TNV has 180 CPs and RNA, three dimensional structure of TNV particles and multiple N-terminal domains. In this case, the domain of the particle is removed, and the mass (Δ85) of the particle is modulated, and the three-dimensional structure of the particle is determined by the decomposition energy of 60 sets. Diversity of TNV quartic structure, hierarchy of particle formation, Δ85, Δ56, Δ62, Δ74, and quality modulation The first is the first time that the United States has been involved in the war against terrorism.Δ85 Photosynthetic organisms that capture light from algae and algae remain in the form of substance-pigment complexes The three-dimensional structure of the complex of enzymes (PcyA) and substrates involved in pigment synthesis is determined. The correct understanding of the acid residues, matrix and the sequence of the stereospecific molecular structure In addition, the three-dimensional structure of γ-Glutamiraton receptor, the main enzyme of Glutamiraton metabolism, is determined. The structure of the enzyme intermediate was determined by the appropriate method. The results of this study are as follows:
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystal structure of phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase in complex with biliverdin IXα, a key enzyme in the biosynthesis of phycocyanobilin
- DOI:10.1073/pnas.0507266103
- 发表时间:2006-01-03
- 期刊:
- 影响因子:11.1
- 作者:Hagiwara, Y;Sugishima, M;Fukuyama, K
- 通讯作者:Fukuyama, K
ウイルスのライフサイクルを化学の言葉で表現する
用化学术语表达病毒的生命周期
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Y.Hagiwara;M.Sugishima;Y.Takahashi;K.Fukuyama;福山恵一
- 通讯作者:福山恵一
Identification of Variant Molecules of Bacillus thermoproteolyticus Ferredoxin : Crystal Structure Reveals Bound Coenzyme A and an Unexpected [3Fe-4S] Cluster Associated with a Canonical [4Fe-4S] Ligand Motif
热蛋白解芽孢杆菌铁氧还蛋白变体分子的鉴定:晶体结构揭示了结合的辅酶 A 和与规范 [4Fe-4S] 配体基序相关的意外 [3Fe-4S] 簇
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T.Shirakawa;Y.Takahashi;K.Wada;J.Hirota;T.Takao;D.Ohmori;K.Fukuyama
- 通讯作者:K.Fukuyama
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
福山 恵一其他文献
SufBCD複合体への変異導入解析から見えてきた鉄硫黄クラスターの生合成機構
通过SufBCD复合物的突变引入分析揭示铁硫簇的生物合成机制
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
湯田 瑛樹;田中 尚志;藤城 貴史;平林 佳;福山 恵一;和田 啓;高橋 康弘 - 通讯作者:
高橋 康弘
Structure and Reaction Mechanism of γ-Glutamyltranspeptidases
γ-谷氨酰转肽酶的结构和反应机制
- DOI:
10.5940/jcrsj.55.340 - 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
福山 恵一;和田 啓 - 通讯作者:
和田 啓
無酸素実験環境を利用した鉄硫黄クラスター結合タンパク質の精製および構造・機能解析
使用缺氧实验环境纯化铁硫簇结合蛋白并进行结构/功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
和田 啓;綛田 紀子;上村 紀子;元山 祐美子;髙尾 春奈;福山 恵一;藤田 祐一;高橋 康弘 - 通讯作者:
高橋 康弘
蛋白質複合体間の会合状態変換が生み出す鉄硫黄クラスターの合成基盤
蛋白质复合物缔合态转换生成铁硫簇的合成基础
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
平林 佳;長坂 雄太;佐藤 喬之; 片山 寿美枝;岩崎 憲治;福山 恵一; 高橋 康弘;和田 啓 - 通讯作者:
和田 啓
ヒトF1-ATPaseの回転・制御機構
人F1-ATP酶的旋转和控制机制
- DOI:
- 发表时间:
2012 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
田中 尚志;和田 啓;福山 恵一;葛山 智久;高橋 康弘;鈴木俊治 - 通讯作者:
鈴木俊治
福山 恵一的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('福山 恵一', 18)}}的其他基金
金属タンパク質の超高分解能X線結晶解析から金属イオンの軌道電子を見る
通过金属蛋白的超高分辨率 X 射线晶体学观察金属离子的轨道电子
- 批准号:
20657022 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明
阐明球形病毒颗粒多样性表达机制和颗粒形成层次
- 批准号:
18054016 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
タバコネクロシスウィルスの高分解能立体構造と粒子形成機構の解析
烟草坏死病毒高分辨率三维结构及颗粒形成机制分析
- 批准号:
11169223 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの立体構造に基づく基質の酸化と活性化機構の解明
基于过氧化物酶三维结构阐明底物氧化活化机制
- 批准号:
10129219 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
ペルオキシダーゼの静的および動的立体構造に基づく基質の活性化機構の解明
基于过氧化物酶静态和动态三维结构阐明底物活化机制
- 批准号:
09235217 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの反応過程における構造変化の結晶学的追跡
过氧化物酶反应过程中结构变化的晶体学追踪
- 批准号:
08214206 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの静的および動的立体構造に基づく基質の活性化機構の解明
基于过氧化物酶静态和动态三维结构阐明底物活化机制
- 批准号:
08249222 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの反応過程における構造変化の結晶学的追跡
过氧化物酶反应过程中结构变化的晶体学追踪
- 批准号:
07224207 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの酸素脱着反応に伴う構造変化の結晶的追跡
与过氧化物酶氧解吸反应相关的结构变化的晶体学追踪
- 批准号:
06235208 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ペルオキシダーゼの酸素脱着反応に伴う構造変化の結晶学的追跡
与过氧化物酶氧解吸反应相关的结构变化的晶体学追踪
- 批准号:
05244205 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似海外基金
非共有結合性阻害剤の探索を目的としたペニシリン認識酵素のX線結晶解析
青霉素识别酶的 X 射线晶体分析,用于寻找非共价抑制剂
- 批准号:
20K07484 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
核外輸送受容体CRM1のX線結晶解析
核输出受体 CRM1 的 X 射线晶体分析
- 批准号:
21770109 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
金属タンパク質の超高分解能X線結晶解析から金属イオンの軌道電子を見る
通过金属蛋白的超高分辨率 X 射线晶体学观察金属离子的轨道电子
- 批准号:
20657022 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
X線結晶解析と電子顕微鏡法による筋収縮制御の研究
利用X射线晶体学和电子显微镜研究肌肉收缩控制
- 批准号:
20051024 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
X線結晶解析・NMR分光・クライオ電子顕微鏡を統合した筋肉超分子構造決定法
结合X射线晶体学、核磁共振波谱和冷冻电子显微镜的肌肉超分子结构测定方法
- 批准号:
18054031 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
NMR分光・X線結晶解析・クライオ電顕法・高速回転関数法による筋肉超分子構造決定
使用核磁共振波谱、X 射线晶体学、冷冻电子显微镜和快速旋转函数法测定肌肉超分子结构
- 批准号:
17053026 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
膜結合性コハク酸ユビキノン酸化還元酵素複合体のX線結晶解析
膜结合琥珀酸泛醌氧化还原酶复合物的 X 射线晶体分析
- 批准号:
16048203 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
利用 X 射线晶体学研究铁氧还蛋白和亚硫酸还原酶之间的电子传递复合物的结构
- 批准号:
15770067 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
利用 X 射线晶体学研究铁氧还蛋白和亚硫酸还原酶之间的电子传递复合物的结构
- 批准号:
14780474 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
変異型γδ型TCRのX線結晶解析構造と抗原認識能との相関解析
突变型γδTCR的X射线晶体分析结构与抗原识别能力的相关性分析
- 批准号:
14770139 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 1.86万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)