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球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明

阐明球形病毒颗粒多样性表达机制和颗粒形成层次

基本信息

批准号：
18054016
负责人：
福山恵一
金额：
$ 3.78万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18054016/
关键词：
球状ウイルス粒子形成 X線結晶構造解析 γ-グルタミルトランスペプチダーゼアシビシン酵素阻害アザセリンタバコネクロシスウイルス γ-グルタミルトランスペプチターゼ γ-グルタミル酵素中間体プロセッシング

项目摘要

富栄養域の海水中には高密度でウイルス粒子が浮遊している。その一部は、赤潮原因プランクトンに対して感染性を持ち、赤潮の動態・終息に重要な影響をおよぼしていることが知られている。ここで、ウイルスは感染を成立させる方向に、宿主はウイルス感染から逃れる方向にそれぞれ変異を繰り返す。本研究では、赤潮原因藻ヘテロカプサ・サーキュラリスカーマを宿主とする球状RNAウイルス(HcRNAV)の構造生物学的解析から、この粒子表面の構造と性状を明らかにする。この第一歩として、HcRNAVの幾つかの株のRNAからcDNAを調製した。Y-グルタミルトランスペプチターゼ(GGT)はバクテリアから哺乳類まで幅広い生物が持つ酵素であり、グルタチオン(GSH)などのY-グルタミル基を他のアミノ酸やペプチドに転移する反応とy-グルタミル基の加水分解反応を触媒する。これまでに大腸菌由来GGTについて、この酵素の立体構造だけでなく、基質認識や触媒機構、プロセッシングによる成熟化機構を明らかにした。本年度は、2種類の阻害剤(アシビシンとアザセリン)の各々によるGGTの阻害機構を解析した。これら2種類の複合体の1.65Å分解能結晶構造から、両阻害剤ともGGTの活性残基Thr391と共有結合し、注目すべきことに四面体中間体で酵素に捉えられていることを明らかにした。さらにアシビシンでは、単にこれが酵素に結合したのではなく、アシビシン内で結合の再配置が起っていた。

The high density of floating particles in the seawater of the rich ecosystem The causes of red tides are related to their infectivity, and the dynamics of red tides are related to their final impact. This is the direction in which the infection is established, the direction in which the infection is escaped, and the direction in which it is returned. In this study, the structural biology analysis of the host and spherical RNA (HcRNAV) and the structural characteristics of the particle surface were investigated. The first step is to modulate the RNA of HcRNAV. Y-GSH (GGT) is a catalyst for the hydrolysis reaction of mammalian enzymes and other enzymes. These include the origin of Escherichia coli, the three-dimensional structure of the enzyme, the recognition of the substrate, the catalytic mechanism, and the maturation mechanism. This year, the analysis of GGT's damage mechanism in each of the two types of damage agents was carried out. The 1.65-fold decomposition of GGT complex is a common binding activity. In addition to the above, it is necessary to re-configure the enzyme within the system.

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Crystal Structure of the γ-Glutamyltranspeptidase Precursor Protein from Escherichia coli

大肠杆菌 γ-谷氨酰转肽酶前体蛋白的晶体结构

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Journal of Biological Chemistry 282・4
影响因子：
0
作者：
T.Okada;H.Suzuki;K.Wada;H.Kumagai;K.Fukuyama
通讯作者：
K.Fukuyama

Crystal Structures of γ-glutamyltranspeptidase in complexes with inhibitors and an analog mimicking the transition state

γ-谷氨酰转肽酶与抑制剂和模拟过渡态类似物复合物的晶体结构

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
K.;Wada
通讯作者：
Wada

Alternative cyanidebinding modes to the haem iron in haem oxygenase.

血红素加氧酶中血红素铁的替代氰化物结合模式。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 63(pt6)
影响因子：
0
作者：
Masakazu Sugishima;Kenji Oda;Takashi Ogura;Hiroshi Sakamoto;Masato Noguchi;Keiichi Fukuyama
通讯作者：
Keiichi Fukuyama

Crystal structures of γ-glutamyltranspeptidase from E. coli, a key enzyme in glutathione metabolism, and its reaction intermediate

谷胱甘肽代谢关键酶——大肠杆菌γ-谷氨酰转肽酶及其反应中间体的晶体结构