蛋白質を基とした複核金属配位空間の機能化設計
基于蛋白质的双核金属配位空间的功能设计
基本信息
- 批准号:17036037
- 负责人:
- 金额:$ 0.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ニッケル含有加水分解酵素ウレアーゼの活性部位を柔軟性配位空間とし、複核金属配位空間(2つの金属イオンが協同的に働く反応場)を分子設計した。金属置換法および配位空間周辺アミノ酸置換法による構造制御により、金属複核酵素の機能発現における活性部位構造因子の解明および新規機能を有する人工金属複核酵素開発のための基礎的知見を得ることを目指し、「ホモ複核金属配位空間による酸化機能発現」および「ヘテロ複核金属配位空間の構築」を行った。本研究課題の結果、ウレアーゼの活性中心金属イオンをニッケルから鉄、銅、マンガンに置換したホモ複核金属置換ウレアーゼが酸化活性(ペルオキシダーゼ、カタラーゼ、オキシゲナーゼ)を持つことを見いだした。反応活性は、マンガン、鉄、銅イオンの順で高くなった。また、配位アミノ酸によって、酸化活性化状態が制御されていることも明らかにした。鉄置換体では、酸素性配位アミノ酸残基(Glu)が多いほど活性が向上し、銅置換体では、芳香族窒素性配位アミノ酸残基(His)が多いほど活性向上することがわかった。これらの研究成果により、金属酵素の活性部位の構造変異によって酵素機能が変換されるという新しい知見が得られた。さらに、本研究課題において、複核金属配位空間における2つの金属イオンが異なるヘテロ複核金属配位空間の構築にも成功した。ニッケル・鉄ヘテロ複核金属酵素として知られているヒドロゲナーゼと類似構造を活性部位に持つウレアーゼを調製した。ニッケル・鉄ヘテロ複核ウレアーゼの活性部位における2つの金属イオンは、硫黄によって架橋している。この研究成果によって、生体金属のみならず、様々な金属イオンを金属酵素内の柔軟性配位空間に取り込んだ応用性の高い新機能性人工金属酵素の開発に必要な新規手法を提唱することができた。
The active site of a hydrolytic enzyme, a soft coordination space, and a review of the metal coordination space (2) are included in the molecular design. The metal replacement method and the coordination space periphery are used for the structural control, the functional development of metal rechecking enzymes, the interpretation of active site construction factors and the new functional development of artificial metal rechecking enzymes. The results of this research project show that the active center metal of the metal alloy is replaced by iron, copper and copper, and the acid activity of the metal alloy is replaced by iron and copper. Anti-corrosion activity, iron, copper, copper, iron, copper, iron, copper, copper, iron, copper, iron, copper, copper The state of coordination, acidification, and activation is controlled. The iron substituent has more than one acid residue (Glu) in the acidic ligand and more than one acid residue (His) in the aromatic ligand. The results of this research show that the structure of the active site of metalloenzymes is different, and the function of metalloenzymes is different. In this paper, the construction of metal coordination space was successfully reviewed. The structure of the enzyme is similar to that of the active site. 2. Metal and sulfur bridging The results of this research provide a new approach to the development of novel functional metalloenzymes with high functional properties and flexibility in the coordination space of metalloenzymes.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Preparation and Characterization of Ca^<2+>-free Methanol Dehydrogenase from Hyphomicrobium denitrificans A3151
来自脱氮丝微菌A3151的无Ca^2甲醇脱氢酶的制备和表征
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:M.Nojiri;D.Hira;K.Yamaguchi;T.Okajima;K.Tanizawa;S.Suzuki
- 通讯作者:S.Suzuki
Structural Reorganization of Copper Binding Site Involving Thr^<15> of Mavicyanin from Cucurbita pepo medullosa (Zucchini) upon Reduction
还原后涉及来自西葫芦 (Zucchini) 的 Mavicyanin Thr^<15> 的铜结合位点的结构重组
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Y.Xie;T.Inoue;Y.Miyamoto;H.Matsumura;K.Kataoka;K.Yamaguchi;M.Nojiri;S.Suzuki;Y.Kai
- 通讯作者:Y.Kai
Cu(I) and Cu(II) Complexes Containing Nitrite and Tridentate Aromatic Amine Ligand as Models for Substrate-Binding Type 2 Cu Site of Nitrite Reductases
含有亚硝酸盐和三齿芳香胺配体的 Cu(I) 和 Cu(II) 配合物作为亚硝酸盐还原酶底物结合 2 型 Cu 位点的模型
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:H.Yokoyama;K.Yamaguchi;M.Sugimoto;S.Suzuki
- 通讯作者:S.Suzuki
Roles of Trp144 and Tyr203 in copper-containing nitrite reductase from Achromobacter cycloslastes IAM1013
Trp144 和 Tyr203 在无色杆菌 IAM1013 含铜亚硝酸还原酶中的作用
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:K.Yamaguchi;K.Shuta;S.Suzuki
- 通讯作者:S.Suzuki
The Intramolecular Electron Transfer between the Type 1 Cu and the Type 2 Cu Centers in a Mutant of Hyphomicrobium Nitrite Reductases
丝菌亚硝酸还原酶突变体中 1 型 Cu 和 2 型 Cu 中心之间的分子内电子转移
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S.Suzuki;T.Maetani;K.Yamaguchi;K.Kobayashi;S.Tagawa
- 通讯作者:S.Tagawa
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
山口 和也其他文献
CeO2担持Niナノ粒子触媒を用いたアクセプターレス脱水素芳香環形成反応
CeO2负载Ni纳米粒子催化剂的无受体脱氢芳环形成反应
- DOI:
- 发表时间:
2023 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
松山 剛大;谷田部 孝文;矢部 智宏;山口 和也 - 通讯作者:
山口 和也
担持Niナノ粒子触媒を用いたベンジル位脱水素シリル化反応
使用负载型镍纳米粒子催化剂的苄基位脱氢硅烷化反应
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
虞 晴;谷田部 孝文;松山 剛大;古森 将也;矢部 智弘;山口 和也 - 通讯作者:
山口 和也
N-ヒドロキシフタルイミドおよび担持Pd複合触媒によるアミドのα酸素化反応
N-羟基邻苯二甲酰亚胺和负载Pd复合催化剂的酰胺α-氧化反应
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
谷田部 孝文;八村 信輝;若林 空良;竹井 大輔;山口 和也 - 通讯作者:
山口 和也
Cu/N-oxyl触媒によるアルコールの高選択的な酸化を用いたシュウ酸ジエステル合成
Cu/N-氧基催化剂高选择性氧化醇合成草酸二酯
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
森野 雄介;谷田部 孝文;山口 和也 - 通讯作者:
山口 和也
山口 和也的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('山口 和也', 18)}}的其他基金
Creation of ordered multinuclear active site structures from mononuclear metalates and development of highly difficult reactions using small molecules
从单核金属盐创建有序多核活性位点结构并使用小分子开发高难度反应
- 批准号:
22H04971 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
New Strategy for Green Synthesis and Conversion of Nitrogen-Containing Compounds Using Function Integrated Heterogeneous Catalysts
功能集成多相催化剂绿色合成与转化含氮化合物的新策略
- 批准号:
22H00270 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
ソフトマテリアル場における生体金属モデル錯体の挙動 触媒機能に対する反応場の影響
生物金属模型复合体在软材料领域的行为:反应场对催化功能的影响
- 批准号:
23550075 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
固体表面の精密設計による高機能選択酸化触媒の開発
通过固体表面的精确设计开发高性能选择氧化催化剂
- 批准号:
17034012 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ファインケミカルズ合成を指向した実用的不均一触媒反応系の開発
精细化工合成实用多相催化反应体系的开发
- 批准号:
16760620 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ヘテロポリ化合物と遷移金属の複合錯体を用いた環境調和型酸化反応系の開発
使用杂多化合物和过渡金属的络合物开发环境友好的氧化反应体系
- 批准号:
14750623 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
グリーンケミストリーを指向した環境調和型触媒反応系の開発
开发面向绿色化学的环境友好型催化反应体系
- 批准号:
00J01663 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
加水分解反応を触媒するニッケル複核錯体の創製
催化水解反应的镍双核配合物的制备
- 批准号:
08740520 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ニッケル含有酵素であるウレアーゼの構造と機能
含镍酶脲酶的结构和功能
- 批准号:
06740506 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
大規模配位空間の最適化理論:離散構造論の視点を中心にして
大规模配置空间的优化理论:聚焦离散结构理论的视角
- 批准号:
20K11670 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Separation of f-elements based on control of coordination space by ligand-immobilized stimuli-responsive hydrogels
基于配体固定刺激响应水凝胶控制配位空间的 f 元素分离
- 批准号:
18K19043 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Chemistry of Hierarchical Coordination Space
层次配位空间的化学
- 批准号:
25000007 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
配位空間の利用を目指した、安定な水の光還元触媒として機能する配位高分子錯体の合成
合成作为稳定水光还原催化剂的配位聚合物配合物,旨在利用配位空间
- 批准号:
12J11118 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
動的な配位空間の精密制御による協同的分子吸着システムの創成
通过精确控制动态配位空间创建协同分子吸附系统
- 批准号:
11J02365 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
共役イミドバナジウム錯体の配位空間制御を基軸とする機能性レドックスシステムの開発
基于共轭亚氨基钒配合物配位空间控制的功能性氧化还原系统的开发
- 批准号:
10J55352 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
High functionalization of nano-size coordination space based on itsinternal magnetic field for a specific reaction in the cavity
基于内部磁场的纳米配位空间的高功能化,用于腔内的特定反应
- 批准号:
22710089 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
配位空間内での光応答性分子の異性化挙動
配位空间中光响应分子的异构化行为
- 批准号:
20044006 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
オリゴペプチド鎖を配位空間として用いた金属酵素機能モデルの構築
以寡肽链为配位空间构建金属酶功能模型
- 批准号:
20655012 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
アート錯体の配位空間制御と機能発現
艺术综合体的协调空间控制与功能表达
- 批准号:
20036047 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 0.9万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas