ヒストン修飾酵素によるヒストン認識機構の構造的基盤

组蛋白修饰酶识别组蛋白机制的结构基础

• 批准号: 17054035
• 负责人: 清水 敏之
• 金额: $ 2.56万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17054035/
• 关键词: PAD4; シトルリン化; ヒストン; アルギニン; βターン

PADは、Ca^<2+>依存的にアルギニン残基を脱イミノ化(シトルリン化)して、シトルリン残基を産出する反応を触媒するタンパク質修飾酵素である。ヒトPADタイプ4(PAD4)は、663アミノ酸残基からなり核内に優先的に局在する。PAD4はヒストン修飾による遺伝子発現の制御、慢性関節リウマチの発症と関与していることが示唆されている。PAD4はin vivo、in vitroでヒストンH3の2,8,17,26番目とH4の3番目のアルギニンをシトルリン化する。これまでに、ヒストンH3のアルギニン17(H3/R17)とH4のアルギニン3(H4/R3)はの部位がメチル化を受けると、エストロゲンレセプターを介した転写が活性化される。一方、PAD4によってH3/R17とH4/R3がシトルリン化されると、前述したメチル化とは逆に、エストロゲン応答遺伝子の転写が抑制されることが明らかになっている。我々はPAD4-ヒストンN末端ペプチド複合体の構造決定に成功した複合体においてもN-2からN+2の5残基のアミノ酸の電子密度が明瞭に確認された。PAD4は各々のペプチドN-2からN+1の主鎖と水素結合を形成しており、ペプチドの側鎖との相互作用はターゲットとなるアルギニンとN-2の位置の側鎖でのみ生じていた。さらに、認識されているヒストンペプチドの構造を比較すると、ペプチド鎖は折れ曲がったβターン様の構造をとっていて、その構造は互いに非常によく一致していた。このようなβターン様の構造形成にはArg374とヒストンペプチドとの間の多数の水素結合が大きく寄与していた。このβターン様の構造形成によってペプチドのN-1の主鎖のカルボニル酸素とN+2の主鎖の窒素原子とが同一ペプチド内で相互作用できるようになるので、PAD4と直接相互作用していないN+2のアミノ酸残基が安定化され、その電子密度を確認することができた。

PAD, Ca ^ & lt;2+>-dependent residues are deactivated and modified, and the residues are extracted from the catalyst. PAD, 4 (PAD4), 663, acid residues, nuclei, acid residues, acid residues and acid residues. The PAD4 has been shown to control the symptoms, chronic symptoms, and symptoms of the disease. PAD4, in vivo, in vitro, H3, H4, H3, H4, H4, H3, H4 Please tell me that the parts are not affected by H3/R17, H3, H3, 17 (H3/R17), H4, H4, 3 (H4/R3). One party, PAD4, H3/R17, H4/R3, and so on, the aforementioned one, the reverse, the negative, the negative. We determine the success of the PAD4-

项目成果

Structural characterization of calcineurin B homologous protein 1

• DOI: 10.1074/jbc.m503390200
• 发表时间: 2005-09-16
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Naoe, Y;Arita, K;Shimizu, T
• 通讯作者: Shimizu, T

タンパク質核酸相互作用 タンパク質科学 構造・物性・機能

蛋白质-核酸相互作用蛋白质科学结构/性质/功能

• 发表时间: 2005
• 作者: 清水敏之;箱嶋敏雄
• 通讯作者: 箱嶋敏雄

Crystal structure of the protein histidine phosphatase SixA in the multistep His-Asp phosphorelay

• DOI: 10.1111/j.1365-2443.2005.00817.x
• 发表时间: 2005-01-01
• 期刊: GENES TO CELLS
• 影响因子: 2.1
• 作者: Hamada, K;Kato, M;Hakoshima, T
• 通讯作者: Hakoshima, T

Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of rat calcineurin B homologous protein 1

大鼠钙调神经磷酸酶 B 同源蛋白 1 的结晶和初步 X 射线晶体分析

• 发表时间: 2005
• 期刊: Acta Crystallogr F 61
• 作者: TK.Mal;D.Liu;Y.Masutomi;L.Zheng;Y.Nakatani;T.Kokubo;M.Ikura;Naoe et al.;Naoe et al.
• 通讯作者: Naoe et al.

The first crystal structure of a family 31 carbohydrate-binding module with affinity to beta-1, 3-xylan.

具有 β-1, 3-木聚糖亲和力的家族 31 碳水化合物结合模块的第一个晶体结构。

• 发表时间: 2005
• 期刊: FEES Lett. 579
• 作者: Hashimoto;H.;Tamai;Y.;Okazaki;F.;Tamaru;Y.;Shimizu;T.;Araki;T.;Sato;M.
• 通讯作者: M.