カンジダ酵母における網羅的発現制御株の構築と応用-病原性ゲノム機能学-

念珠菌综合表达调控菌株的构建及应用-致病基因组功能-

• 批准号: 18018004
• 负责人: 知花 博治
• 金额: $ 5.95万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018004/
• 关键词: ゲノム創薬; 病原性メカニズム; 分子標的; 日和見感染; 深在性真菌症; 分指標的; 遺伝子組換え

カンジダグラブラータは、パン酵母の近縁種であるが、人体内に常在する真菌である。健常者にとっては大きな問題とはならないが、エイズや免疫抑制剤の投与によって免疫力の低下した患者に対しては重篤な日和見深在性感染症を起こすため問題となっている。我々は、カンジダの病原性解明と優れた抗真菌薬の開発を目指し、ゲノム機能解析を進めている。まず、真菌類およびヒトゲノムのデータベースを用いて、真菌類に高く保存され,人には類似性の低い遺伝子をカンジダグラブラータのゲノムから抽出した。次にパン酵母では生育必須遺伝子が同定されており、我々は前述の遺伝子の中からパン酵母の必須遺伝子のオーソログ遺伝子を184遺伝子抽出し、このうち180遺伝子についてい誘導型プロモーターを導入した株(Tet株)を体系的に構築した。これらの株を用いてin vitroでの生育実験を行い、各遺伝子のカンジダの生育に対する影響を、定量的に測定した。今後、in vitroでの生育実験を行い、これらの結果を基に抗真菌薬の標的として適性度の順位を決めていく。カンジダグラブラータではパン酵母と比較して相同組み換え効率の低いことが問題であり、遺伝子組換え操作をより効率的に進めるために新しい組換え実験系を構築する必要があった。そこで、我々はKU80のノックダウンシステムを構築し、このシステムにおいて菌株のゲノムや生育の安定性について詳細に検証を行い、生育速度、突然変異率などに影響が無い事を確認した。平成19年度はKU80ノックダウンシステムを用いて、約600のTet株を構築した。

Youdaoplaceholder0 カ ジダグラブラ タ タ タ, パ <e:1> yeast であるが, に fungi that are often present in する in the human body である. Health is often the に と っ て は big き な problem と は な ら な い が, エ イ ズ cast with や immunosuppression tonic の に よ っ て low immunity の し た patients に し seaborne て は heavy Benedict な day and see deep in the sexual adapting just-in-time inventory を up こ す た め problem と な っ て い る. I 々 は, カ ン ジ ダ の pathogenicity interpret と optimal れ た antifungal 薬 の open 発 を refers し, ゲ ノ ム function analytical を into め て い る. ま ず, fungi お よ び ヒ ト ゲ ノ ム の デ ー タ ベ ー ス を with い て, high fungi に く save さ れ, people に は similarity の low い heritage 伝 son を カ ン ジ ダ グ ラ ブ ラ ー タ の ゲ ノ ム か ら spare し た. Time に パ ン yeast で は birth must have 伝 が son be さ れ て お り, I 々 は traces of the foregoing の 伝 child の か ら パ ン yeast の son must have 伝 の オ ー ソ ロ グ posthumous son 伝 を 184 legacy 伝 spare し, こ の う ち 180 legacy 伝 son に つ い て い induction type プ ロ モ ー タ ー を import し た strains (Tet) strains に を system constructing し た. こ れ ら の を strains with い て in vitro で の birth be 験 を い, each legacy 伝 son の カ ン ジ ダ の fertility に す seaborne る influence を, quantitative determination of に し た. Family in the future, the in vitro で の be 験 を い, こ れ ら の results を に antifungal 薬 の mark と し て eligibility degree sequence の を definitely め て い く. カ ン ジ ダ グ ラ ブ ラ ー タ で は パ ン yeast と compare し て み in same group え sharper rate の low い こ と が problem で あ り, heritage 伝 subgroups in え operation を よ り に into sharper rates め る た め に new し い group in え be 験 department を build す る necessary が あ っ た. そ こ で, I 々 は KU80 の ノ ッ ク ダ ウ ン シ ス テ ム を constructing し, こ の シ ス テ ム に お い て strains の ゲ ノ ム や fertility の stability に つ い て detailed に 検 line card を い, birth rate of speed, suddenly - different な ど に influence there is nothing い が を confirm し た. In the 19th year of the Heisei era, ダウ KU80ノッ ダウ ダウ システムを システムを was constructed using て て and approximately 600 pieces of Tet plant を to build <s:1> た.

项目成果

酵母のすべて「Candidaのゲノム情報」

关于酵母的一切“念珠菌基因组信息”

• 发表时间: 2007
• 作者: Hiroji Chibana;Keigo Ueno;Hironobu Nakayama;Jun Uno;Yuzuru Mikami;Hiroji Chibana;知花博治
• 通讯作者: 知花博治

Candida albicansにおけるMRS(Major repeated sequnce)の構造と機能解析-遺伝子型解析への応用と全ゲノム解析の永い道のり-

白色念珠菌MRS（主要重复序列）的结构和功能分析 - 在基因分型分析中的应用和全基因组分析的漫长道路 -

• 发表时间: 2006
• 期刊: 日本医真菌学会誌 総説 47(3)
• 作者: 知花博治;三上 襄
• 通讯作者: 三上 襄

Development of a highly efficient gene targeting system induced by transient repression of YKU80 expression in Candida glabrata, Eukaryotic cell

开发由瞬时抑制光滑念珠菌、真核细胞中 YKU80 表达诱导的高效基因靶向系统

• 发表时间: 2007
• 期刊: Eukaryotic cell 6(7)
• 作者: Keigo Ueno;Jun Uno;Hironobu Nakayama;Kaname Sasamoto;Yuzuru Mikami;Hiroji Chibana
• 通讯作者: Hiroji Chibana

Assembly of the Candida albicans genome into sixteen supercontigs aligned on the eight chromosomes.

• DOI: 10.1186/gb-2007-8-4-r52
• 发表时间: 2007
• 期刊: GENOME BIOLOGY
• 影响因子: 12.3
• 作者: van het Hoog, Marco;Rast, Timothy J.;Martchenko, Mikhail;Grindle, Suzanne;Dignard, Daniel;Hogues, Herve;Cuomo, Christine;Berriman, Matthew;Scherer, Stewart;Magee, B. B.;Whiteway, Malcolm;Chibana, Hiroji;Nantel, Andre;Magee, P. T.
• 通讯作者: Magee, P. T.

Prioritization of drug targets as a goal of functional genomics I pathogenic fungi

优先考虑药物靶标作为功能基因组学的目标 I 病原真菌

• 发表时间: 2007
• 作者: Hiroji Chibana;Keigo Ueno;Hironobu Nakayama;Jun Uno;Yuzuru Mikami
• 通讯作者: Yuzuru Mikami