酵母カンジダ・アルビカンスにおける人体内内生存戦略分子機構の解明

阐明酵母白色念珠菌在人体内生存策略的分子机制

• 批准号: 15013208
• 负责人: 知花 博治
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15013208/
• 关键词: 病原性真菌; ゲノム創薬; 染色体; トランスクリプトーム

Candida酵母は常在性寄生菌で免疫力の低下した患者に対し重篤な感染症を起こす真菌である。Candidaの病原性は未解明であり,我々は先ずCandidaの常在性のための戦略に興味を持ちCandidaの組換え体の構築および組換え体を用いた感染実験やトランスクリプトームにより常在性に関わる遺伝子の探索を行い,常在性の分子機構の解明をめざしている。Candida属の種の中で病原性は強いが組換え実験の難しいC.albicansと病原性は弱いが組換えの容易なC.glabrataの両方の利点を生かしながら我々は研究を進めている。スタンフォード大学やミネソタ大学等との共同研究によりC.albicansの全ゲノム配列(15.5Mbp)を含む421本のコンティグを完成させた。ゲノム上には6,421の遺伝子の存在が推測され米国科学アカデミー学会誌(PNAS)に受理された。我々は引き続きゲノムシークエンスの完成をめざし,C.albicansの染色体7番(1Mbp)のコンティグ間のギャップをクローズし,シークエンスを完成させることに成功した。またより正確な遺伝子予測を行なうために,既に解析が終了しているパン酵母(Saccharomyces cerevisiaei)のゲノムシークエンスを用いて真菌ゲノムに対するGlimmer2とCriticaを用いた遺伝子予測の信憑性試験を行なった。このジョイントプログラムを用いてC.albicansの染色体7番の遺伝子予測を行なった。

Candida yeasts are often found in patients with low immunity due to sexual parasites and in patients with severe fungal infections. The pathogenicity of Candida has not yet been explained, but we have begun to explore the molecular mechanism of Candida. C.albicans and C.glabrata are pathogenic species, but their pathogenicity is weak. The research of C.albicans was completed in 15.5Mbp. The existence of 6,421 genes was hypothesized by the Journal of the American Academy of Sciences (PNAS). The chromosome 7 (1Mbp) of C.albicans was successfully completed. The correct gene prediction is performed by analyzing the final yeast (Saccharomyces cerevisiae) and using the Glimmer2 and Critica to determine the reliability of the gene prediction. The gene prediction of chromosome 7 of C.albicans was carried out by using this method.

项目成果

Chibana, H., Oka, N., Nagasawa, N., Shikinami, K., Nishimura, K., Magee, B.B., Magee, P.T., Mikami, Y: "How the physical map helps in completion of Candida albicans genome sequencing"Frontier Studies and International Networking of Genetic Resources in Pa

Chibana, H.、Oka, N.、Nagasawa, N.、Shikinami, K.、Nishimura, K.、Magee, B.B.、Magee, P.T.、Mikami, Y：“物理图谱如何帮助完成白色念珠菌基因组测序

Jones, T., Federspiel N.A, Chibana H., Dungan J., Kalman, S., Magee, B.B., Newport G., Thorstenson, Y.R., Agabian, N., Magee, P.T., Davis, R.W., Scherer S: "The Diploid Genome Sequence of Candida albicans"Proc Natl Acad Sci USA. (in press).

Jones, T.、Federspiel N.A、Chibana H.、Dungan J.、Kalman, S.、Magee, B.B.、Newport G.、Thorstenson, Y.R.、Agabian, N.、Magee, P.T.、Davis, R.W.、Scherer S：“

Chibana., H., Jones, T., Federspies, N.A., Dungan, J., Kalman, S., Magee, B.B., Forche, A., Lephart, P., Newport, G., Thorstenson Y.R.et al.: "Exploiting the DNA sequence and the physical map of the Candida albicans genome to examine in vivo chromosome dy

Chibana., H.、Jones, T.、Federspies, N.A.、Dungan, J.、Kalman, S.、Magee, B.B.、Forche, A.、Lephart, P.、Newport, G.、Thorstenson Y.R. 等人：