テロメアDNAを利用したカリウムイオンの蛍光イメージング試薬の開発
テロメアDNAを利用したカリウムイオンの蛍光イメージング試薬の開発
批准号:
19021037
负责人:
竹中 繁織
金额:
$3.26万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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ヒトテロメアDNA配列を有するオリゴヌクレオチドの両置換基末端にピレンを導入したPSO4を用いて、K^+添加に伴うゲル電気泳動、吸収、円二色性、蛍光、蛍光偏光スペクトル変化等の解析によってヒトテロメアDNAの4本鎖構造(最近になってbasket、chahr、propeller、hybrid I、hybrid II型の五つ)のうちchair型の時だけ効果的なFRETが見られると予測された。そこで前年度はG-リッチオリゴヌクレオチドにトロンビン結合アプタマー(TBA)配列を導入することによってより高いFRET効率を示すPSO2の合成に成功した。しかし、細胞内へ導入すると導入された細胞の73%が細胞死を起こすことが明らかとなった。これは、TBA配列が核内に存在するヌクレオリンタンパクが結合したためと考えられた。そこで当該年度では二つのFRET色素に加えビオチンを導入したPSO5を合成した。これをストレプトアビジンと結合させ同様に細胞へ導入することによって細胞毒性を軽減することに成功した。PSO5をアビジンに結合させることによってヌクレオリンの相互作用が阻害されたものと考えられたが、このような条件によってもPSO5の核への移行が観察されたが、一部は細胞質に留まっていることがわかった。そこで細胞内のK^+濃度を減少させることが知られているAmphotericin Bの添加に伴う蛍光変化を調べた。その結果核内のK^+濃度の上昇がみちれた。これは、核内のK^+をモニターできた最初の例と見られる。しかしながら、PSO5の合成収率は低く、また、精製も困難であった。そこで、ペプチド-オリゴヌクレオチドコンジュゲートを利用してPSO6の設計を行い、その合成に成功した。予備的検討では、PSO5よりも感度良くK^+濃度の蛍光イメージングが可能なことが明らかとなった。
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Interaction of potassium ion with oligonucleotide carrying human telomeric sequence and pyrene moieties at both termini
钾离子与两端携带人端粒序列和芘部分的寡核苷酸的相互作用
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Bioorganic & Medicinal Chemistry 16
影响因子:
--
作者:
[H. Hayashida, J. Paczesny, B. Juskowiak, S. Takenaka]
通讯作者:
S. Takenaka
Fluorometric visualization of potassium ion in biological system by using quadraplex DNA probe carrying pyrene moieties(招待講演)
使用携带芘部分的四重 DNA 探针对生物系统中的钾离子进行荧光可视化(特邀演讲)
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Satoshi F, Kono H, Takenaka S, Go N, Sarai A, Shigeori Takenaka]
通讯作者:
Shigeori Takenaka
DOI:
10.1093/nar/gkm627
发表时间:
2007
期刊:
Nucleic acids research
影响因子:
14.9
作者:
[Fujii S, Kono H, Takenaka S, Go N, Sarai A]
通讯作者:
Sarai A
Study on the interaction of potassium ion with Synthetic human telomere DNA carrying pyrene moieties at both termini
钾离子与两端带有芘部分的合成人端粒DNA相互作用的研究
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hirohisa Hayashida, Shigeori Takenaka]
通讯作者:
Shigeori Takenaka
Probing approach to realize the fluorometric visualization reagent of potassium ion in the living cell
实现活细胞内钾离子荧光可视化试剂的探测方法
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hirohisa Hayashida, Shigeori Takenaka, Shigeori Takenaka]
通讯作者:
Shigeori Takenaka
ゲノム上の4本鎖構造形成部位分析のためのG4標的人工ヌクレアーゼの開発
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批准号:23K26681
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.74万
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财政年份:2024
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
Development of G4-targeting artificial nucleases for analysis of true G-quadruplex formation sequences on the human genome
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批准号:23H01988
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2023
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
カリウムイオンのインサイチューイメージング試薬の開発
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批准号:18038035
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2006
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
カルボジイミド表面を有する自己組織化単分子膜の形成とDNAチップへの応用
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批准号:18655032
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2006
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
DNAチップ解析のための分子シンクロデバイスの開発
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批准号:11167267
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
DNAアーキテクチャによるナノ組織体構築
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批准号:10126245
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
DNAの認識能を利用したナノ組織体の配列制御
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批准号:09232246
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
電気化学活性縫い込み型インターカレータを用いた新規DNAセンサーの開発
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批准号:08750944
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
電気化学活性プライマーを用いた新しい遺伝子定量法の開発
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批准号:07750901
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
DNAの局所高次構造を検出するプローブとしてのトリスインターカレータの研究
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批准号:02855179
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1990
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
DNAの特定塩基配列の電気化学的検出。インターカレータ型新規ラベル化剤の研究
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批准号:01750724
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
インタカレータ型新規DNAプローブの合成と遺伝子の高感度検出
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批准号:63750757
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1988
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
特異的インタカレータを利用するオリゴヌクレオチドの新しい分離・分析法
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批准号:62750724
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:竹中 繁織
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依托单位:
海外基金