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エピゲノム解析から迫るATR-X症候群の性分化異常発症機構の解明

エピゲノム解析から迫るATR-X症候群の性分化異常発症機構の解明
通过表观基因组分析阐明ATR-X综合征性别分化异常的发病机制
批准号:
19040023
负责人:
松本 直通
金额:
$4.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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X連鎖性αサラセミア精神遅滞(ATR-X)症候群に伴う性分化異常の発症機構を明らかにする事を目的とする。ATR-X症候群はクロマチン調節関連蛋白をコードするATRX遺伝子変異とそれに伴うゲノムメチル化異常がその発症に深く関わる事が示唆されている。本研究では自身で開発したBACマイクロアレーならびに市販のオリゴDNAアレーを併用しゲノムワイドにエピゲノム異常を検索し、性分化異常に関連する遺伝子を特定しその発症機構を明らかにすることを目的とする。本研究によってエピジェネティックな視点から新たな性分化異常発症機構が解明される可能性が高い。BACアレーとオリゴDNAアレーの比較検討の結果、オリゴDNAアレーが有効であると判断し、Agilent社のCpGあれーを用いてゲノムワイドなメチル化異常解析を行い正常対照と異なるメチル化異常候補領域を数十カ所同定した。それぞれの候補領域をBisulfateシーケンス法を用いて検証を行った。中でもHOXA1領域にATR-X症例で低メチル〜高メチルを呈するメチル化不安定領域を特定し、本研究手法の有用性が明らかになった。HOXA1領域のメチル化不安定領域はリンパ芽球におけるHOXA1遺伝子の発現とも相関し低メチル化は低発現、高メチル化は高発現を呈していた点は大変興味深い。同定した多数の候補領域の個別の検証を進めて性分化に関するエピゲノム異常関連遺伝子の単離へ結びつけたいと考えている。
期刊论文(17)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Less frequent NSD1-intragenic deletions in Japanese Sotos Syndrome: Analysis of 30 patients by NSD1-exon array CGH,quantitative fluorescent duplex PCR, and fluorescence in situ hybridization.
日本 Sotos 综合征中 NSD1 基因内缺失频率较低:通过 NSD1 外显子阵列 CGH、定量荧光双链 PCR 和荧光原位杂交对 30 名患者进行分析。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Acta Medica Nagasakiensia 52
影响因子: --
作者: [Sosonkina N, others, Matsumoto N]
通讯作者: Matsumoto N
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [Naomichi, Matsumoto, 松本 直通]
通讯作者: 松本 直通
Mandibuloacral dysplasia and a novel LMNA mutation in a woman with severe progressive skeletal changes
患有严重进行性骨骼变化的女性下颌骨发育不良和新型 LMNA 突变
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Am J Med Genet 43A
影响因子: --
作者: [Kosho T, Takahashi J, Momose T, Nakamura A, Sakurai A, Wada T, Yoshida K, Wakui K, Suzuki T, Kasuga K, Nishimura G, Kato H, Fukushima Y]
通讯作者: Fukushima Y
A Japanese family of typical Loeys-Dietz syndrome with a TGFBR2 mutation.
具有 TGFBR2 突变的典型 Loeys-Dietz 综合征日本家族。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Internal Medicine 46
影响因子: --
作者: [Sato K, Mizuguch T, Yamasaki-Ishizaki Y, Nakashima M, Sato D, Nishimura A, Sosonkina N, Togashi Y]
通讯作者: Togashi Y
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    希少遺伝性疾患のオプティカルゲノムマッピング:病的構造変異の完全解明
    • 批准号:
      24K02230
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      松本 直通
    • 依托单位:
    放射性物質に汚染された海底土の除染に関する研究
    • 批准号:
      15H00399
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
    • 资助金额:
      $0.19万
    • 财政年份:
      2015
    • 负责人:
      松本 直通
    • 依托单位:
    放射性物質の効果的な吸着法を確立するための研究
    • 批准号:
      26920010
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
    • 资助金额:
      $0.19万
    • 财政年份:
      2014
    • 负责人:
      松本 直通
    • 依托单位:
    電気泳動法による粘土鉱物,珪酸塩鉱物を使用した放射性物質吸着の実験的研究
    • 批准号:
      24920011
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
    • 资助金额:
      $0.19万
    • 财政年份:
      2012
    • 负责人:
      松本 直通
    • 依托单位:
    海外基金