膜輸送を司る低分子量G蛋白質Rabのエフェクタードメインの統合的解析

Rab（一种控制膜转运的低分子量 G 蛋白）效应结构域的综合分析

• 批准号: 20054001
• 负责人: 福田 光則
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20054001/
• 关键词: 低分子量G蛋白質; 網羅的解析; 酵母two-hybrid; Rab; Rabエフェクター; コイルドコイル; Rabパネル; 膜輸送

膜輸送を司る低分子量G蛋白質Rabは、Rasスーパーファミリーの中で最大のサブファミリーを形成し、哺乳動物においては60種類以上の異なるアイソフォームが存在する。RabはGTPを結合した活性化型とGDPを結合した不活性化型の二つの状態をとり、活性化型のGTP-Rabがエフェクター(effector)と呼ばれるパートナー分子と特異的に結合することにより膜輸送を促進する。哺乳動物に存在する60種類のRabはそれぞれ特異的なエフェクター分子と結合することにより、それぞれ特異的な膜輸送を促進し、様々な生命現象に関与するものと推察されている。Rabを介する生命現象の分子基盤を解明する第一のステップとしては、特異的なエフェクター分子の同定が最も重要と考えられる。そこで本研究では、当研究室で独自に開発した「Rabの網羅的解析ツール(Rab panel)」を用い、マウスに存在する全てのRabアイソフォームを対象にエフェクター分子の網羅的スクリーニングを行うとともに、同定された分子のRabエフェクタードメインの決定に着手した。具体的には、Rab1〜30の活性化型固定化変異体をbaitに酵母two-hybrid法により、20種類以上の新規Rabエフェクター候補分子の同定に成功した(Mol. Cell. Proteomics(2008)7 : 1031-1042)。得られた候補分子のRab結合ドメインの解析から、多くのものではcoiled-coil領域がRab結合ドメインとして機能するという新たな知見を得ることができた。また、得られた候補分子のRab結合特異性の解析から、RabとRabエフェクターの結合関係は必ずしも1:1ではなく、同定された候補分子の半数以上のものは複数のRabアイソフォームと結合するという意外な事実が明らかになってきた。

Membrane transport を department る low molecular weight G protein Rab は, Ras ス ー パ ー フ ァ ミ リ ー の で maximum の サ ブ フ ァ ミ リ ー を し, mammals に お い て は over 60 kinds の different な る ア イ ソ フ ォ ー ム が exist す る. Rab は GTP を made combining し た activation type と を combined GDP し た activation type の two つ の state を と り, active type の GTP - made Rab が エ フ ェ ク タ ー (effector) と shout ば れ る パ ー ト ナ と specific に ー molecules combine す る こ と に よ り membrane transport を promote す る. Mammals に exist す る 60 kinds の Rab は そ れ ぞ れ specific な エ フ ェ ク タ ー molecular と す る こ と に よ り, そ れ ぞ れ specific な membrane transport を promote し, others 々 な life phenomenon に masato and す る も の と push examine さ れ て い る. Rab を interface す る life phenomenon の molecular base plate を interpret す る first の ス テ ッ プ と し て は, specific な エ フ ェ ク タ の ー molecules with fixed が も most important と exam え ら れ る. Youdaoplaceholder0 た で で this study で で when the research laboratory で independently に developed た "Analysis of Rab Snares そ た た (Rab. Panel) "を い, マ ウ ス に exist す る full て の Rab ア イ ソ フ ォ ー ム を like に seaborne エ フ ェ ク タ ー molecules の snare ス ク リ ー ニ ン グ を line う と と も に, with constant さ れ た molecular の Rab エ フ ェ ク タ ー ド メ イ ン の decisions に begin し た. Specific に た, Rab 1-30 <s:1> activated immobilized variants をbaitに yeast two-hybrid method によ に, more than 20 types of <s:1> new regulations rab エフェ タ タ に candidate molecules <s:1> co-determination に successful た(Mol. Cell. Proteomics(2008)7:1031-1042). Have ら れ た alternate molecular の Rab combining ド メ イ ン の parsing か ら, multiple く の も の で は coiled coil - field が Rab combining ド メ イ ン と し て function す る と い う new た な knowledge を must る こ と が で き た. ま た, ら れ た alternate molecular の Rab combining specific の parsing か ら, Rab と Rab エ フ ェ ク タ ー の combining は masato department will ず し も 1:1 で は な く, with fixed さ れ た waiting more than half of the molecular の の も の は plural の Rab ア イ ソ フ ォ ー ム と combining す る と い う な unexpected be が Ming ら か に な っ て き た.

项目成果

Rab10 in insulin-stimulated GLUT4 translocation

• DOI: 10.1042/bj20071318
• 发表时间: 2008-04-01
• 期刊: BIOCHEMICAL JOURNAL
• 影响因子: 4.1
• 作者: Sano, Hiroyuki;Roach, William G.;Lienhard, Gustav E.
• 通讯作者: Lienhard, Gustav E.

Rab35 and its GAP EPI64C in T cells regulate receptor recycling and immunological synapse formation

• DOI: 10.1074/jbc.m800056200
• 发表时间: 2008-06-27
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Patino-Lopez, Genaro;Dong, Xiaoyun;Shaw, Stephen
• 通讯作者: Shaw, Stephen

Functional significance of repressor element 1 silencing transcription factor (REST) target genes in pancreatic βcells

阻遏元件1沉默转录因子（REST）靶基因在胰腺β细胞中的功能意义

• 发表时间: 2008
• 期刊: Diabetologin 51
• 作者: Navin. D.;Allagnak F.;Chaliard;G.;CaUle;D.;Fukuda;hi;Regazei R.;Ahderrahmani A.;Waeber;G.. Meda. R;Maechler;P. & Haefliger;J.A.
• 通讯作者: J.A.

The primate-specific protein TBC1D3 is required for optimal macropinocytosis in a novel ARF6-dependent pathway

• DOI: 10.1091/mbc.e07-06-0594
• 发表时间: 2008-04-01
• 期刊: MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL
• 影响因子: 3.3
• 作者: Frittoli, Emanuela;Palamidessi, Andrea;Confalonieri, Stefano
• 通讯作者: Confalonieri, Stefano

Human RME-8 Is Involved in Membrane Trafficking through Early Endosomes

• DOI: 10.1247/csf.07045
• 发表时间: 2008-01-01
• 期刊: CELL STRUCTURE AND FUNCTION
• 影响因子: 1.5
• 作者: Fujibayashi, Akemi;Taguchi, Tomohiko;Sekiguchi, Kiyotoshi
• 通讯作者: Sekiguchi, Kiyotoshi