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急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用

急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
快速冷冻复制法细胞内蛋白结构基因组学方法的开发与应用
批准号:
15011212
负责人:
片山 栄作
金额:
$3.26万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004

项目摘要

项目成果

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本課題では、急速凍結電子顕微鏡法を用いて様々な材料に適用できる3次元構造解析法を開発し、溶液中あるいは細胞内において機能遂行中の蛋白質複合体の構造解析に応用することを目標とする。フリーズ・レプリカ試料を対象とする3次元再構成法はほぼ完成し、現在、ネガティブ染色や樹脂包埋切片に対象を拡張すべく改良中である。原子構造が判明している蛋白質を含む試料の場合には、観察されるべきレプリカ像をコンピュータ・シミュレーションにより予測し、それを実際に得られた像と比較して微妙な構造変化を定量的に評価する方法を開発している。実際の材料への応用として、まず、生物分子モーター、アクトミオシン系の機能中の構造を解析した。硬直複合体におけるミオシン頭部は、X線結晶回折のデータから予測されているものとほぼ同等の構造を示したが、滑り運動中には、「レバーアーム首振り」説により予測される分子の屈曲は見られず、むしろ逆方向に曲がるものが大多数であった。そのような構造がADP存在下で2価性試薬により架橋したミオシン頭部の形状に酷似することを見出し、それらの表面の凹凸プロファイルをシミュレーション画像のパターンマッチングにより定量的に比較した。両者は良く一致しており、ミオシン頭部が予想と逆方向に屈曲していることは確実である。他の結果も含め、これまでに観察したすべての構造データを取り込んで、滑り運動の作動機構に関する新たな作業仮説を構築した。現在、それを実験的に検証する手段を検討中である。一方、細胞内構築の表面における特定の分子やそのサブドメインの局在部位をレプリカ試料の視野内で示し、同時に生きた細胞中におけるその分子の動態を蛍光顕微鏡で追うために,高性能の顕微鏡用標識の開発を進めてきた。すでにその分子設計と標識の基本部分の発現は完了している。現在、その先端にさまざまな結合モジュールを融合した蛋白質を作成中である。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
伊東祐二, 田中孝一, 橋口周平, 杉村和久: "ヒト抗体エンジニアリングと分子標的医療"バイオインダストリー. 20-7. 34-42 (2003)
Yuji Ito、Koichi Tanaka、Shuhei Hashiguchi、Kazuhisa Sugimura:“人类抗体工程和分子靶向医学”Bioindustry 20-7。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Y.Fujita, E.Ohto, E.Katayama, Y.Atomi: "αB-crystallin-coated MAPs-microtubule resists nocodazole- and calcium-induced disassembly"J.Cell Sci.. (in press). (2004)
Y.Fujita、E.Ohto、E.Katayama、Y.Atomi:“αB-晶状体蛋白包被的 MAP 微管可抵抗诺考达唑和钙诱导的分解”J.Cell Sci..(出版中)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
M.Tominaga, H.Kojima, E.Yokota H.Orii, R.Nakamori, E.Katayama, M.Anson, I.Shimmen, K.Oiwa: "Higher plant myosin Xl moves processively on actin with 35 nm steps at high velocity"EMBO J.. 22. 1263-1272 (2003)
M.Tominaga、H.Kojima、E.Yokota H.Orii、R.Nakamori、E.Katayama、M.Anson、I.Shimmen、K.Oiwa:“高等植物肌球蛋白 Xl 在肌动蛋白上以 35 nm 的步长在高处持续移动
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
E.Katayama, N.Ichise, N.Yaeguchi, T.Yoshizawa, S.Maruta, N.Baba: "Three-dimensional structural analysis of individual myosin heads under various functional states"Adv.in Exp.Med.& Bioi.. 538. 295-304 (2004)
E.Katayama、N.Ichise、N.Yaeguchi、T.Yoshizawa、S.Maruta、N.Baba:“各种功能状态下单个肌球蛋白头的三维结构分析”Adv.in Exp.Med。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
7
    機能中の蛋白質の動的立体構造解析:新たな電子線3次元画像処理法および標識法の応用
    • 批准号:
      18054007
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.86万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    作動中の蛋白質複合体の立体構造解析をめざす高精度電子顕微境画像処理法の開発と応用
    • 批准号:
      17053004
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
    • 批准号:
      16011215
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.58万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
    • 批准号:
      14011210
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.65万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位: