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急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用

急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
快速冷冻复制法细胞内蛋白结构基因组学方法的开发与应用
批准号:
14011210
负责人:
片山 栄作
金额:
$3.65万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 --
关键词:

项目摘要

项目成果

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われわれは、急速凍結フリーズ・レプリカ電子顕微鏡の特長を利用して、溶液内あるいは細胞内で機能遂行中の1個1個の蛋白質の一瞬の姿を捉え、その立体構造を精密に解析する一連の手法の開発と応用を進めている。具体的方法として、レプリカ像からの3次元再構成、そして原子構造既知の蛋白質やその複合体に想定されるレプリカ像のコンピュータ・シミュレーションを行ってきた。本年度は、in vitro滑り運動中のウサギ・アクトミオシン複合体試料中でしばしば観察され、アクチンフィラメントを抱き込む形で結合するミオシン頭部の構造解析を行った。ミオシン頭部はATP結合により強く屈曲することが知られ、そのX線結晶構造が発表されている。またミオシンATPaseのさまざまな反応中間体アナログを形成する金属イオン/ADP複合体でも類似の構造を取ると考えられている。しかし、これらの構造から予測されるシミュレーション画像は上記のアクチン結合ミオシンの画像とは合致しなかった。そこで、不安定な中間状態において2価性試薬(pPDM)で化学架橋を施したミオシン頭部のレプリカ画像を捉え、その3次元構造を解析したところ、滑り運動中のアクチン結合ミオシンの画像と酷似することが判明した。その構造は上記の結晶構造のレバーアーム部分をほぼ逆方向に回転させることにより得られるものであった。一方、pPDMで架橋したホタテ貝ミオシン頭部のX線結晶構造がごく最近発表され、ADP結合ミオシンに近いと結論されているが、その構造はわれわれが見出したものとは全く異なる。ウサギ・ミオシンではpPDMによる架橋はSH-1、SH-2と称される2個のチオール基をつなぐが、ホタテ貝ミオシンではSH-2とリジンが架橋されることが分かっている、これらのことから種の異なるミオシンの架橋産物が別の構造を取っているものと考えれば説明可能であろう。軽鎖中のSH基に入れた蛍光標識のスペクトルの特徴も同様のことを示唆している。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
H.Tanaka: "The motor domain, not a long neck domain, determines the large step of myosin-V"Nature. 415. 192-195 (2002)
H.Tanaka:“运动域,而不是长颈域,决定了肌球蛋白-V 的大步长”性质。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
M.Fukuda: "The calcium-binding loops of the tandem C2 domains of synaptotagmin VII cooperatively mediate calcium-dependent oligomerization"Journal of Biological Chemistry. 277. 29315-29320 (2002)
M.Fukuda:“突触结合蛋白 VII 串联 C2 结构域的钙结合环协同介导钙依赖性寡聚化”生物化学杂志。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
K.Tamano: "Shigella Spa32 is an essential secretory protein for functional type III secretion machinery and uniformity of its needle length"Journal of Bacteriology. 184. 1244-1252 (2002)
K.Tamano:“志贺氏菌 Spa32 是一种重要的分泌蛋白,对于 III 型分泌机制的功能及其针长度的一致性至关重要”《细菌学杂志》。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
M.Tominaga: "Oiwa Higher plant myosin XI moves processively on actin with 35 nm steps at high velocity"EMBO Journal. (印刷中). (2003)
M.Tominaga:“Oiwa 高等植物肌球蛋白 XI 以 35 nm 的速度在肌动蛋白上持续移动”EMBO 杂志(2003 年出版)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    機能中の蛋白質の動的立体構造解析:新たな電子線3次元画像処理法および標識法の応用
    • 批准号:
      18054007
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.86万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    作動中の蛋白質複合体の立体構造解析をめざす高精度電子顕微境画像処理法の開発と応用
    • 批准号:
      17053004
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
    • 批准号:
      16011215
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.58万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用
    • 批准号:
      15011212
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.26万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      片山 栄作
    • 依托单位:
    海外基金