高密度マイクロサテライトマーカーによるパーキンソン病関連遺伝子の同定

利用高密度微卫星标记鉴定帕金森病相关基因

• 批准号: 15012236
• 负责人: 川上 秀史
• 金额: $ 4.48万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15012236/
• 关键词: パーキンソン病; ゲノム; マイクロサテライト; 相関解析; 感受性遺伝子

パーキンソン病(PD)は、アルツハイマー病についで多い神経変性疾患であり、人口構成の高齢化に伴い増加している。その成因は明らかではなく、遺伝的要因と環境要因が関与するといわれている。このパーキンソン病の遺伝的要因に存在に関しては、最近のPETをもちいた双生児研究やアイスランドにおける網羅的家系研究によって明確に示されたが、たとえばアルツハイマー病におけるApoE4のような明確な感受性遺伝子は明らかではない。本研究の目的は、高密度マイクロサテライトマーカーを用いた全ゲノムスキャンを行い、相関解析によって、パーキンソン病発症感受性領域を同定し、さらに単一塩基多型(SNP)を用いて、感受性遺伝子そのものを同定することである。PDの感受性遺伝子の同定を行うため、一次スクリーニングにPDと正常対照のDNAをそれぞれ160検体用いてプールを作成した。全ゲノム上に約100kb毎で設定された23381個のマイクロサテライトマーカーを用いてPCRを行なった。ABI3100を用いて、マイクロサテライトマーカーの解析を行い、各アレル頻度を解析した。統計解析は頻度差をFisher exact testにて有意水準5%で検定を行った。一次スクリーニングを終了し全体の65.2%にあたる15243個のマーカーで統計値が得られた.そのうち有意差を認めたものは2913個であった.既報告領域と一致しているところもあり,それをふまえて二次スクリーニングを行っていく予定である.有意なマーカーについては二次,三次の検体を用いて確認を行い,SNPによって解析することで候補領域を狭めていき感受性遺伝子を同定する。

Disease (PD) disease (PD), disease disease disease (PD) The incidence of neurological diseases and the rapid changes in population structure are increasing. The main cause of the cause of the disease is the environmental factor.このパーキンソン Disease の伝's main cause に关しては、 Recent のP ET twin twins research ET twin twins research The research is clear and clear, and the disease is clear and clear.けるApoE4のようなclear なsensitivity 伝子は明らかではない. The purpose of this study is to use high-density vacuum cleanersた全ゲノムスキャンを行い, related analysis によって, パーキンソThe field of susceptibility to disease syndrome is を同定し, the さらに単一塩综合码(SNP)を用いて, and the sensitivity 缝子そのものを同定することである. PD の sensitivities left 伝の同定を行うため, once スクリーニングにPD とnormal対毇のDNA をそれぞれ 160検body made with いてプールをした. All of them are about 100kb each and set up 23381 のマイクロサテライトマーカーを using いてPCRを行なった. ABI3100 is used for analysis, analysis and analysis of each frequency and frequency. Statistical analysis means that the frequency difference is determined by the Fisher exact test, which is determined by the level of 5%. Once the system is finished, the overall statistics are 65.2% and 15,243 are completed. .そのうち intentionally differs and recognizes めたものは2913 であった. Both report areas are consistent しているところもあり, それをふまえて二スクリーニングを行っていく为定である. intentionalなマーカーについては二、三検体を Use いて confirmation を row い, SNP に よ っ て analysis す る こ と で candidate field を narrow め て い き sensitivities left 伝子 を Same determination す る.

项目成果

Nishimura M: "Influence of monocyte chemoattractant protein 1 gene polymorphism on age at onset of sporadic Parkinson's disease."Movement Disorder. 18・8. 953 (2003)

西村 M：“单核细胞趋化蛋白 1 基因多态性对散发性帕金森病发病年龄的影响”。运动障碍 18・8（2003）。

Oda M: "Possible reduced penetrance of expansion of 44 to 47 CAG/CAA repeats in the TATA-binding protein gene in spinocerebellar ataxia type 17."Archives of Neurology.. 61・2. 209 (2004)

Oda M：“17 型脊髓小脑性共济失调中 TATA 结合蛋白基因中 44 至 47 个 CAG/CAA 重复序列的外显率可能降低。”神经学档案.. 61・2。

Nishimura M: "Influence of Cytokine and Mannose Binding Protein Gene Polymorphisms on Human T-cell Leukemia Virus Type I (HTLV-I) Provirus Load in HTLV-I Asymptomatic Carriers."Human Immunology. 64・4. 453 (2003)

Nishimura M：“细胞因子和甘露糖结合蛋白基因多态性对 HTLV-I 无症状携带者中人类 T 细胞白血病病毒 I 型 (HTLV-I) 原病毒载量的影响”64·4。

Oda M: "Dinucleotide Repeat Polymorphism in Interferon-gamma Gene Is Not Associated With Sporadic Alzheimer's Disease"American Journal of Medical Genetics. 124B・1. 48 (2004)

Oda M：“干扰素γ基因中的二核苷酸重复多态性与散发性阿尔茨海默病无关”美国医学遗传学杂志124B·1（2004年）。

Terasawa H: "Molecular basis of prevalence and founder effect for Japanese SCA6 population"Neuroscience Letters. 358・2. 107 (2004)

Terasawa H：“日本 SCA6 人群患病率和奠基者效应的分子基础”《神经科学快报》358・2（2004 年）。