高密度マイクロサテライトマーカーによるパーキンソン病関連遺伝子の同定

利用高密度微卫星标记鉴定帕金森病相关基因

• 批准号: 14013042
• 负责人: 川上 秀史
• 金额: $ 4.22万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14013042/
• 关键词: パーキンソン病; ゲノムスキャン; 相関解析

パーキンソン病は、環境要因と遺伝要因の相互作用により発症すると考えられているが、最近の双生児におけるPETを用いた遺伝学的研究やアイスランドにおける家系研究により、遺伝要因の存在がより強く示された。遺伝要因を明らかにすることは、パーキンソン病の発症リスクを明らかにするのみでなく、その発症メカニズムを解明することにより、発症予防および進展予防への創薬への道を切り開くものである。我々は、パーキンソン病発症に関わる遺伝子を同定することを目標に研究を開始した。方法としては、全ゲノムを対象にした相関解析を、3万のマイクロサテライトマーカーをもって行い、1次スクリーニング陽性のマーカーを、さらに2次、3次の検体で、検定することにより、真の感受性遺伝子を同定する。書面で同意を得た上で、パーキンソン患者500人、およびそれに対応させた正常コントロールDNAを収集した。Picogreen試薬で、個々のDNA濃度を測定し、各々160人分のDNAからなるpooled DNAを作製した。第1次スクリーニングとして、pooled DNAを基質に、X染色体上の700個のマイクロサテライトマーカーをPCRプライマーとしてPCRを行い、タイピングした。パーキンソン病患者poolと正常コントロールプールで、相関解析を行い、有意水準5%で検定した結果、約8%のマイクロサテライトマーカーで、陽性であった。今後、2次、3次の検定を行い、陽性マーカーを検出し連鎖不均衡を見出し、単一塩基多型を用いて感受性遺伝子を同定する予定である。

A study of the interaction of environmental factors and genetic factors in the development of diseases, recent twin studies of PET use in genetic studies, family studies, and the existence of genetic factors is strongly demonstrated. The main reason for this is that the disease has been prevented from occurring and the path to prevention has been opened. We started our research on how to solve the problem. Methods: To analyze the correlation between the total number of samples, the number of samples, and the number of samples. Written consent was obtained from 500 patients, and the DNA was collected from all patients. Picogreen assay, DNA concentration of each sample, DNA concentration of each sample of 160 samples The first time, the DNA was pooled on the DNA matrix, and 700 DNA samples were collected. The patient pool is normal, the correlation analysis is positive, the level is positive, and the result is positive. In the future, the second and third times of detection, positive detection, linkage disequilibrium, single detection, multiple detection, sensitivity detection, and predetermined detection will be performed.

项目成果

Nishimura M: "Contribution of the interleukin-1beta gene polymorphism in multiple system atrophy"Mov Disord. 17・4. 808 (2002)

Nishimura M：“白细胞介素1β基因多态性在多系统萎缩中的贡献”Mov Disord 17・4（2002）。

Izumi Y: "SCA 8 repeat expansion-large CTA/CTG repeat alleles are more common in ataxic patients, including those with SCA6"AM J Hum Genet. 72・3. 704 (2003)

Izumi Y：“SCA 8 重复扩增-大 CTA/CTG 重复等位基因在共济失调患者中更常见，包括患有 SCA6 的患者”AM J Hum Genet 72・3 (2003)。

Nishimura M: "Association between interleukin-6 gene polymorphism and human T-Cell leukemia virus type I associated myelopathy"Hum Immunol. 63・8. 696 (2002)

西村 M：“白细胞介素 6 基因多态性与人类 T 细胞白血病病毒 I 型相关脊髓病的关联”Hum Nutrition 63・8（2002）。

Kawakami H: "Novel mutation in X-linked Charcot-Marie-Tooth disease associated with CNS impairment"Neurology. 59・6. 923 (2002)

Kawakami H：“与 CNS 损伤相关的 X 连锁夏科-马里-图思病的新突变”神经学 59・6（2002）。

Maruyama H: "Difference in disease-free survival curve and regional distribution according to subtype of spinocerebellar ataxia : A study of 1,286 Japanese patients"AM J Med Genet.. 114・5. 578 (2002)

Maruyama H：“根据脊髓小脑性共济失调亚型的无病生存曲线和区域分布的差异：对 1,286 名日本患者的研究”AM J Med Genet.. 114・5 (2002)。