CATCH22症候群における遺伝子レベルでの発生機構の解析

CATCH22综合征遗传机制分析

• 批准号: 10168214
• 负责人: 三好 康雄
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10168214/
• 关键词: DiGeorge症候群; CATCH22; 共通欠失領域; 22q11; VNTR

CATCH22は染色体22q11の欠失を伴う先天奇形症候群である。種々の表現型があり、隣接遺伝子症候群と考えられている。また、患者の大多数がde novoの、しかも共通の欠失領域をもっているため、欠失の生じやすいゲノム構造が示唆される。CATCH22の共通欠失の発生機構の解明を目的として以下の研究を行った。CATCH22共通欠失領域の遠位端を含むYACクローンからコスミドのサブライブラリーを作製し、これらをコンテイグ化した。遠位端の同定の目的でパルスフィールドゲル電気泳動法による解析を行ったが、この領域は高度に多型性を示し解析が困難であった。FISH解析の結果、この領域のコスミドの約半数は22q11特異的反復配列を含んでおり、これらはCATCH22欠失領域の遠位端のみならず近位端近傍にも存在することが判明し、この領域が組み換えの候補と考えられた。ところが、サザンブロット解析においても高度に多型性を示し遠位端の同定は不能であった。ただし、共通欠失を示す患者の中で、この領域のdosage解析の結果が、数タイプのパターンに分類でき、欠失の遠位端はこの領域にクラスターを形成していると考えられた。遠位端のサザンブロット解析の過程で我々はこの領域にVNTRを発見した。このVNTRも22q11に複数のコピーを持っており、FISH解析にて欠失の近位端側にも存在することが判明した。VMTRが組み換えを起こしやすい性質に注目しこの解析を行った。このVMTRの近位端側のクローンをヒトゲノムライブラリーから単離した。そしてこのクローンが共通欠失の近位端を含むYACクローンに含まれることをPCR法にて確認した。これらのクローンの全塩基配列の検討を行った結果、これらは90%以上の相同性を示した。また、共通欠失を持つ患者での間期核FISHによって、これら近位側、遠位側の反復配列が融合していることを証明した。以上により、大多数の患者の示す共通欠失領域の断端には数10kbにわたり、VNTRを含む領域特異性反復配列が存在し、これらを介した不均衡交差によってCATCH22の共通欠失が発生していると考えられた。

CATCH22 chromosome 22q11 deficiency associated with congenital anomaly syndrome. The phenotype of the species and the adjacent genetic syndrome are examined. Most of the patients are novo, common and missing areas, and missing structures. The purpose of this study is to clarify the mechanism of CATCH22 's common failure. CATCH22 common missing field remote end includes YAC switch control, switch control, switch control. The distance between the target and the target is very small. FISH analysis results show that about half of the field's samples contain 22q11-specific repeated alignment, and that there is a presence of the distal end and proximal end of the CATCH22 missing field. A high degree of polymorphism can be observed at the distal end. The results of the analysis of the dosage of the common missing part of the patient, the classification of the missing part of the distal part of the patient, and the formation of the missing part of the dosage of the field. VNTR is detected in the remote domain. The VNTR 22q11 is a complex, and FISH analysis is required to identify the presence of missing proximal terminals. The VMTR is composed of two parts: one part is composed of two parts, the other part is composed of two parts. The VMTR's proximal side of the camera can be seen in the camera. The PCR method was used to confirm the presence of a common missing gene in the proximal region of the genome. The results of this study show that more than 90% of the samples are identical. Interphase FISH was performed in patients with common mismatches, and the repeated alignment of proximal and distal sides was demonstrated. Most of the patients showed a common deficit of 10kb, VNTR included a domain-specific repeat alignment, and a common deficit of CATCH22 occurred.