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CATCH22症候群における遺伝子レベルでの発生機構の解析

CATCH22综合征遗传机制分析

基本信息

批准号：
09272213
负责人：
倉橋浩樹
金额：
$ 2.3万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09272213/
关键词：
DiGeorge症候群 CATCH22 22q11 VNTR 共通欠失領域

项目摘要

CATCH22は染色体22q11の欠失を伴う先天奇形症候群である。種々の表現型があり、隣接遺伝子症候群と考えられている。この症候群の原因遺伝子の同定に向けて、共通欠失領域のゲノム解析を行った。ヒトゲノムコスミドライブラリーよりCATCH22欠失領域内に位置するコスミドクローンを単離し、その一部をコスミドコンテイグ化し、前年度の研究により同定した最小欠失領域をHCF2から849e9Rの約300kbに限定した。また、その領域の転写地図を作製した。その領域にはHCF2、CRKL、我々が単離したLZTR-1、がマップされた。さらに新規遺伝子の単離に向けて、複数の新規ESTを単離した。また、CATCH22は患者の大多数がde novoの、しかも共通の欠失で発症しているため、欠失の生じやすいゲノム構造が示唆される。この大多数の患者が示す共通欠失領域の断端を含む近位側、遠位側のYACクローンを同定した。遠位側のYACクローンより、コスミドライブラリーを作製し、コスミドコンテイグ化し、FISH、PFGE、サザン解析などの詳細な検討を行った。その結果、共通欠失領域の断端近傍には、数200kbにわたり、22q11特異的反復配列が存在することが判明した。これらはFISHにて欠失の近位側、遠位側両側にシグナルを出す。ただし、PFGEやサザン解析では、反復とこの領域の高度多型性のため欠失の断端の同定は困難であった。この領域には特徴的なVNTRが存在する。このVNTRは27bpの反復であり、遠位側では100コピー前後の反復が2コピー、近位側では20コピーのものがそれぞれのYACクローンにのっている。これらのVNTRを含むコスミドクローンでのFISHにより、元来約3Mb離れて存在するこれらのクローンが欠失により極めて近接して存在することが示された。VNTRのrecombigenicな性質に注目すると、欠失の発生する原因の有力な候補と考えられ、実際にrecombinationが発生するプロセスの解析をすすめている。

CATCH22 chromosome 22q11 deficiency associated with congenital anomaly syndrome. The phenotype of the species and the adjacent genetic syndrome are examined. The cause of the syndrome is the same direction, common missing area is the same direction, common missing area is the same direction. The minimum missing area of HCF2 is 849e9R and is limited to about 300kb. In addition, we have made preparations for the development of new fields. HCF-2, CRKL, LZTR-1, CRKL Today, the new EST is separated from the original, and the new EST is separated from the original. The majority of CATCH22 patients are new, common and missing. Most of these patients showed that the common missing area was divided into proximal and distal YAC segments. Detailed analysis of remote YAC, CSM, CSM, FISH, PFGE and CSM The results show that there are 200kb and 22q11 specific repeated arrangements near the end of the common missing field. The FISH is missing on the proximal and distal sides. High polymorphism in the domain of PFGE analysis is difficult to identify. VNTR exists in this domain. The VNTR is 27bp in length, 100 bp in length, and 20 bp in length. The VNTR contains a total of about 3MB of FISH, and the VNTR contains a total of 10 MB of FISH. The recombination property of VNTR is noted, and the reasons for the failure of VNTR are analyzed.