構造及び機能単位としてのモジュールを組み合わせた新規蛋白質の分子設計と創製
構造及び機能単位としてのモジュールを組み合わせた新規蛋白質の分子設計と創製
批准号:
12002008
负责人:
森島 績
金额:
$250.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2003
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英文摘要
1.モジュール間相互作用の再生を目指した方法論の開発ヘモグロビンα鎖のヘム結合モジュールをシトクロムb_5の対応する領域に導入したb_5αb_5を作製し、ランダム変異導入後、ヘム親和性を指標に構造力安定化している蛋白質のスクリーニングを行ったところ、ヘム結合モジュールに近接する特定の部位に変異が集中していた。そこで、構造上の歪みがかかっていると考えられるこれら残基に範囲をしぼってランダム変異を導入した変異体集団を作製し、さらに、スクリーニング過程に、崩れた構造の変異蛋白質を蛋白質分解酵素により除去するプロセスを新たに加え方法論の改良を行ったところ、モジュール置換蛋白質の安定性の向上に成功した。2.新規機能性蛋白質の創製に成功ヒトのトリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)と相互作用する蛋白質を探索したところ、解糖系の酵素であるグリセルアルデヒド3-リン酸デヒドロゲナーゼ(GapDH)がTrpRSと結合することが明らかになった。TrpRSと結合するGapDHの結合部位の特定を試みるために、様々なキメラ蛋白質を作製した。ミオグロビン(Mb)のN末端側にGapDHのあるモジュールを融合したキメラ蛋白質は、野生型Mb同様、酸素を可逆的に配位でき、またGAPDH同様にTrpRSと会合する安定な新規蛋白質であることが明らかになった。3.酸化ストレス応答性新規グロビン蛋白質の分子機構の解明とその知見に基づく人工蛋白質の設計「ニューログロビン(Ngb)」には酸化ストレスに伴う神経細胞死を抑制する働きがあると指摘されている。今回、このNgbが脳神経系においてシグナル伝達系を制御する分子として機能しているという仮説を立て、Ngbが関与する脳神経シグナル伝達系を明らかにすることを目指した。その結果、酸化ストレス下で生成する鉄3価Ngbが細胞内シグナル伝達蛋白質であるGαと特異的に結合すること、他方、通常の酸素正常状態の鉄2価NgbはGαとは相互作用しないことを発見した。また、Ngbは酸化ストレス応答性のセンサー蛋白質として働き、酸化ストレスを受けた時のみGαと結合し、GαのGDP/GTP交換反応抑制蛋白質として機能することにより、神経細胞死を抑制することを明らかにした。さらに、Ngbに関しモジュール置換した種々のキメラ蛋白質を作製し、それらの解析を行うことにより、制御メカニズムを分子レベルで明らかにすることに成功した。
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Inuzuka, T. et al.: "Identification of crucial histidines for heme binding in the N-terminal domain of the heme-regulated eIF2alpha kinase"J.Biol.Chem.. 279. 6778-6782 (2004)
Inuzuka, T. 等人:“血红素调节的 eIF2α 激酶 N 末端结构域中血红素结合的关键组氨酸的鉴定”J.Biol.Chem.. 279. 6778-6782 (2004)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Uzawa, T. et al.: "Collapse and search dynamics apomyoglobin folding revealed by submillisecond observations of alpha-helical content and compactness"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 101. 1171-1176 (2004)
Uzawa, T. 等人:“通过对 α 螺旋内容和紧凑性的亚毫秒观察揭示了无辅基肌红蛋白折叠的折叠和搜索动态”Proc.Natl.Acad.Sci.USA。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Tosha, T. et al.: "NMR study on the structural changes of cytochrome P450cam upon the complex formation with putidaredoxin. Functional significance of the putidaredoxin-induced structural changes"J.Biol.Chem.. 278. 39809-39821 (2003)
Tosha, T. 等人:“与恶臭氧还蛋白形成复合物后细胞色素 P450cam 结构变化的核磁共振研究。恶臭氧还蛋白诱导的结构变化的功能意义”J.Biol.Chem.. 278. 39809-39821 (2003)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Ihara,M., et al.: "Conversion of an Electron-Transfer Protein into an Oxygen Binding Protein : The Axial Cytochrome b5 Mutant with an Unusually High O_2 Affinity"J.Am.Chem.Soc.. 122. 11535-11536 (2000)
Ihara,M., et al.:“电子转移蛋白转化为氧结合蛋白:具有异常高 O_2 亲和力的轴向细胞色素 b5 突变体”J.Am.Chem.Soc.. 122. 11535-11536(
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Yoshioka, S. et al.: "Roles of the proximal hydrogen bonding network in cytochrome P450cam-catalyzed oxygenation"J. Am. Chem. Soc.. 124. 14571-14579 (2002)
Yoshioka, S. 等人:“细胞色素 P450cam 催化氧合中近端氢键网络的作用”J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 10 条
蛋白質構造の「揺らぎ」による電子移動過程の制御
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批准号:11480191
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$3.65万
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财政年份:1999
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负责人:森島 績
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依托单位:
金属酵素の不安定中間体を観測するための高速溶液混合実験システムの開発
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批准号:11554027
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$9.09万
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财政年份:1999
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负责人:森島 績
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依托单位:
生体金属による小分子の活性化
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批准号:08249102
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$105.34万
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财政年份:1999
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负责人:森島 績
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依托单位:
金属蛋白質の多元的構造と反応過程制御
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批准号:04225103
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$64.64万
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财政年份:1993
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负责人:森島 績
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依托单位:
金属蛋白質の多元的構造と反応過程制御
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批准号:03241103
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$11.97万
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财政年份:1991
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负责人:森島 績
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依托单位:
色素置換ヘム蛋白質における光電子移動反応の動的制御
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批准号:02250222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1990
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负责人:森島 績
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依托单位:
高圧NMR法によるタンパク質の動的構造の研究
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批准号:62220018
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1987
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负责人:森島 績
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依托单位:
高圧下におけるNMR、分子分光併用測定法の開発とその応用
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批准号:62840013
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$6.66万
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财政年份:1987
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负责人:森島 績
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依托单位:
ヘムタンパクの機能発現における高次構造の役割と機能制御
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批准号:60540285
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1985
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负责人:森島 績
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依托单位:
ヘム蛋白質の機能変換とその有効利用に関する研究
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批准号:57470119
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$5.89万
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财政年份:1982
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负责人:森島 績
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依托单位:
ヘム蛋白質の高次構造および活性部位構造の解明とモデル錯体によるシミュレーション
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批准号:56209012
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1981
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负责人:森島 績
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依托单位:
ヘム蛋白質およびそのモデル錯体における電子伝達とヘム近傍の構造に関する研究
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批准号:X00090----354139
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.38万
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财政年份:1978
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负责人:森島 績
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依托单位:
H, ^<13>Cならびに^<15>NNMRによるヘム蛋白質, ヘム酵素の構造と機能に関する研究
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批准号:X00080----049012
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$3.2万
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财政年份:1975
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负责人:森島 績
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依托单位:
国内基金
海外基金
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基于蛋白质三维结构解析ASGARD古菌与
真核生物的起源过程
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:冯晓远
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依托单位:
珍稀食用菌腐败菌噬菌体凝胶形成及抑菌机理研究
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批准号:2025JJ40029
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:熊颖
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依托单位:
计算生物物理学解析癌症转移中 CKAP4 相变聚集促细胞
骨架分支的机制研究
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批准号:2024JJ6492
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:孙圣杰
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依托单位:
骨源性因子的跨器官调控作用和机制研究
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批准号:2023JJ20096
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2023
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负责人:王振兴
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依托单位:
E3泛素连接酶RNF135发挥多种生物学功能的结构基础研究
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批准号:2020A1515010081
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2020
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负责人:邝志和
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依托单位:
crRNA-Cas12a复合体识别与切割靶DNA分子机制的单分子生物物理学研究
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批准号:31900884
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:25.0万元
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批准年份:2019
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负责人:曾俨
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依托单位:
传递Mg LAMPs的外泌体在诱导巨噬细胞炎症反应中的作用
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批准号:2018JJ6072
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2018
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负责人:何军
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依托单位:
大肠杆菌K-12对葡萄糖的运动动力学响应及机制研究
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批准号:11804072
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2018
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负责人:王芳彬
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依托单位:
流感病毒感染引起气道液体生物物理学特性改变及相关机制的研究
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批准号:81670010
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2016
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负责人:聂宏光
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依托单位:
与肿瘤相关的DNA甲基化和组蛋白修饰数据的分析与研究
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批准号:31460234
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:50.0万元
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批准年份:2014
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负责人:李前忠
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依托单位: