真核光合成微生物クラミドモナスを用いた実験系とゲノム解析の現状調査

利用真核光合微生物衣藻进行实验系统和基因组分析的现状调查

• 批准号: 12896009
• 负责人: 福澤 秀哉
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12896009/
• 关键词: 光合成; 緑藻クラミドモナス; ゲノム; DNAチップ; DNAアレイ; 生殖; 遺伝; 光

クラミドモナス研究の各領域(光合成・生殖・遺伝・光応答・行動)について,班会議(函館にて2000年7月30日〜31日,木更津市にて2001年3月10日)とワークショップ(2001年3月9日〜10日,木更津市にて)を開催して,研究動向を把握した。また,平行して,国際協力体制で真核光合成微生物クラミドモナスのゲノム解析計画を推進する前段階として、クラミドモナスの実験系としての特徴とゲノム解析を進める上での問題点を明らかにした。調査の結果,以下の点を特に今後重点的に推進する必要性が明らかになった。1)ESTの大量解析とゲノムライブラリーのDNAアレイあるいはDNAチップ2)細胞培養時における環境条件の標準化3)染色体の構造と遺伝マーカーの整備4)遺伝子タギングによる変異株の取得方法とその解析手法5)オルガネラ並びに核ゲノム形質転換6)遺伝子コード領域の予測手法7)交配による遺伝子同定の簡便化と遺伝マーカーの利用8)タンパク質精製法とプロテオームのデーターベース化9)遺伝子のマッピングとポジショナルクローニング10)実験室株(標準株)の系統保存と分譲システムの整備さらに,国際協力体制でのグノム研究を推進するには,来年度にも企画研究を継続するとともに,2004年に日本で国際会議を開催する準備を始める必要があることが共通認識となった。

A workshop on various fields of research (photosynthesis, reproduction, genetics, photoresponse, and action) was held in Hakodate on July 30 - 31, 2000, in Kisaratsu on March 10, 2001. In parallel, the international cooperation system for eukaryotic photosynthetic microorganisms is advancing the analysis program of eukaryotic photosynthetic microorganisms, and the characteristics of eukaryotic photosynthetic microorganisms are clearly identified. As a result of the investigation, the following points are highlighted as the need for future key advances. 1) Mass analysis of ESTs and DNA fragmentation; 2) Standardization of environmental conditions in cell culture; 3) Chromosome structure and genetic preparation; 4) Methods of obtaining mutants from genetic loci; 5) Genomic DNA fragmentation; 6) Methods of predicting genetic loci; 7) Simplification of genetic identification in mating; 8) 9) Genetic engineering 10) Systematic preservation and isolation of laboratory strains (standard strains) During preparation, international cooperation system for research and development will be established. 2004 International Conference in Japan