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DNAアレイを用いた新規CO_2輸送体遺伝子の単離と炭酸固定増強への利用

利用DNA阵列分离新型CO_2转运蛋白基因及其增强碳固定作用

基本信息

批准号：
14656136
负责人：
福澤秀哉
金额：
$ 1.86万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

緑藻クラミドモナスにおける無機炭素濃縮機構(CCM)の中心的役割を果たすCO_2輸送体あるいは重炭酸イオン輸送体の遺伝子を、CO_2応答性遺伝子の中から見い出すことを最終目的とする。(1)約5万個のESTクローン配列データを分類して、独立なクローン約1万個からなるcDNAマクロアレイを作成した。(2)野生株とccm1変異株とを高CO_2条件および低CO_2条件で培養し、mRNAサンプルを調製し、cDNAを合成した。それぞれをcDNAアレイに対してハイブリダイゼーションを行ない、2サンプル間で発現レベルの差が2.5倍以上の差があったものを有為とした。(3)遺伝子発現プロファイルを網羅的に比較し、51種類の低CO_2誘導性遺伝子および、32種類の低CO_2抑制性遺伝子を見い出した。低CO_2誘導性遺伝子のほとんどがccm1変異株で発現レベルが低下しており、低CO_2シグナル伝達において、調節因子CCM1(Fukuzawa et al.,2001)が総括的に働いていることを示唆した。(4)低CO_2誘導性遺伝子の中に、2つの新規な無機炭素輸送体をコードすると思われる遺伝子LciAおよびLciBを見い出した。(以上、論文投稿中)(5)遺伝子タギング法により、低CO_2条件での無機炭素濃縮能の低下した変異株を単離し、新たなCO_2シグナル伝達因子Lcir1を同定した。(論文印刷中)今後は、抗体やタグ遺伝子を用いたLCIA等の細胞内局在性、重炭酸イオンとの結合特性、RNA干渉法等によるCO_2輸送能への寄与の評価をすることによって、炭酸固定能の増強に向けて研究を進める。これによって、新規CO_2輸送体遺伝子の炭酸固定増強への利用が実現すると期待される。

The center of the green algae クラミドモナスにおける inorganic carbon concentration mechanism (CCM) is a CO_2 transport bodyいは Bicarbonate transport body の伝子を, CO_2 濜濜性伝子の中から见い出すことをFinal destinationとする. (1) Approximately 50,000 のEST クローン-aligned データを classified して, independent なクローン approximately 10,000 からなるcDNA マクロアレイを made した. (2) The wild strain and the different strains of ccm1 were cultured under high CO_2 conditions and low CO_2 conditions, and the mRNA was prepared and cDNA was synthesized.それぞれをcDNAアレイに対してハイブリダイゼーションを行ない、2サンプル间で発成レベルの differenceが 2.5 times more than the difference があったものを有为とした. (3) Comparison of the otakus that appear in the net, 51 types of low-CO_2-inducing otakus, and 32 types of low-CO_2 inhibitory otakus. Low CO_2-induced residual disease のほとんどがccm1変different strain で発appears レベルが下注しており, low CO_2 シグナル伝达において, regulatory factor CCM1 (Fukuzawa et al. al., 2001) The に働いていることをshows the した of the が総kuo. (4) Low CO_2-induced residual inorganic carbon transport body LciA and LciB. (Above, thesis is being submitted) (5) Inorganic carbon concentration using the タギング method and low CO_2 conditions The low energy level is the same as that of the different strains and the new one is CO_2 and the factor Lcir1 is the same. (The paper is being printed) From now on, the intracellular localization of antibodies such as LCIA, bicarbonate binding properties, and RN The research on CO_2 transport energy such as A dry-stemming method and the improvement of carbonic acid fixation energy have been carried out.これによって, the new regulation CO_2 transport body remains 伝子のcarbonic acid fixation enhancement へのutilization が実appears するとlook forward to される.