全ゲノムデータベースを用いたトラフグ・ミオシン重鎮遺伝子の機能解析

利用全基因组数据库分析虎河豚肌球蛋白关键基因的功能

• 批准号: 03F03331
• 负责人: 渡部 終五
• 金额: $ 0.7万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03F03331/
• 关键词: トラフグ; ミオシン; ミオシン重鎖; in situハイブリダイゼーション; ゲノムデータベース; cDNAクローニング; 筋組織; in silicoスクリーニング

哺乳類のミオシン重鎖遺伝子(MHC)には速筋タイプ6種、心筋タイプ2種、平滑筋タイプ3種および非筋タイプ3種のアイソフォームが存在することが知られている。このうち、骨格筋タイプ6種のMHCはゲノム上でクラスターを形成する。この構造は哺乳類の多くの生物間で保存されているため、クラスター構造がMHCの発現調節に重要な役割を果たしていることが予想される。一方、魚類のMHCに関する知見は少なく、その正確な数さえも明らかになっていない。そこで本研究では、ゲノム配列が公開されているトラフグを対象にMHCを解析し、個々の遺伝子につき分子生物学的手法を用いてその発現様式を明らかにすることを目的とした。昨年度までに、トラフグ成体の筋組織に多く発現している速筋型MHCを同定した。本年度はさら研究を進め、次のような成果を得た。まず、トラフグ成体の速筋からfirst strand cDNAを調製し、これを鋳型に速筋MHCをコードするDNA断片をプローブにPCRを行った。その結果、3種類の速筋MHC、すなわちMHC-A、MHC-BおよびMHC-Cがクローン化された。そこで、これら各MHC遺伝子に特異的なプライマーを設計して定量的PCRを顎筋、胸筋、背筋および尾筋から調製した全RNAを対象に行った。その結果、転写産物量は顎筋でMHC-B>MHC-C>MHC-A、胸筋でMHC-A=MHC-B>MHC-C、背筋および尾筋でMHC-A>MHC-B>MHC-Cと、速筋でも部位によって各MHCの発現比率が著しく異なることが示された。そこでさらに、各MHC遺伝子に特異的なアンチセンスプローブを調製し、各速筋組織切片を作製してin situハイブリダイゼーションを行ったところ、定量的PCRでみられた各速筋MHCの発現比率の差異が確認された。以上の結果から、トラフグは同じ速筋でも部位特異的に3種類の速筋MHCを発現比率を変えて発現し、各部位に固有な運動機能を容易にしていることが示唆された。

Mammalian MHC has 6 kinds of fast muscle, 2 kinds of cardiac muscle, 3 kinds of smooth muscle and 3 kinds of non-muscle. 6 kinds of MHC are formed on the top of the list. These structures are important for the preservation of mammalian organisms and for the regulation of MHC production. A party, fish and MHC related knowledge is less, the correct number is more This study is aimed at clarifying the molecular biology approach to the development of molecular biology in response to MHC analysis and genetic analysis. In the past year, the rapid development of MHC in adult muscle tissues has been more and more stable. This year, research has made progress and results have been achieved. The first strand cDNA of the genome was modulated and the second strand DNA fragment was amplified. The results show that there are three kinds of MHC, MHC-A, MHC-B and MHC-C. A quantitative PCR was designed for each of the MHC genes, specifically for mandible, thoracic, dorsal and caudal regions. The results showed that the MHC production ratio varied from MHC-B>MHC-C>MHC-A to MHC-B>MHC-C, from MHC-A to MHC-C, from MHC-A to MHC-B>MHC-C to MHC-C, from MHC-A to MHC-C and from MHC to MHC. The differences in MHC expression rates among the different tissues were confirmed by quantitative PCR. The above results show that the MHC of the three kinds of speed muscles can be easily detected, and the inherent motor function of each part can be easily detected.