圧力軸における蛋白質フォールディングの物理化学的研究
圧力軸における蛋白質フォールディングの物理化学的研究
批准号:
04F03363
负责人:
赤坂 一之
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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英文摘要
フォールディングとアミロイド線維は蛋白質の二つの安定形である。フォールディングについてはキネティックスの研究がこれまで盛んに行われてきたが、アミロイド形成についてのキネティックス研究はほとんど手付かずの状態である。本研究は、アミロイド線維形成の前駆体と考えられるプロトフィブリルの解離反応について、そのキネティックスを詳しく解析した最初の研究である。対象となるプロトフィブリルは、自然に変性状態にあるニワトリリゾチームのS-S欠損変異体で、圧力により加速される解離反応をトリプトファンの蛍光によりモニターした。蛍光の時間変化の解析とプロトフィブリルの線維長分布の解析から、プロトフィブリルの成長と消滅は、線維の端にモノマーが付加するのと線維の端からモノマーが解離するのとよりなるlinear polymerization mechanismにより進行することを明らかにした。また、解離速度の圧力依存性の解析から、解離の活性化体積が負(?V^<o‡>=-50.5?1.60ml mol^<-1>)で、活性化圧縮率も負であることが明らかになった。一方、高圧NMR実験から、平衡状態では、プロトフィブリルの解離に伴う体積変化が、およそ?V^o=-100ml mol^<-1>である。プロトフィブリルの体積パラメータが詳しく測定されたのはこれが初めてである。これらの一連の体積パラメータから、プロトフィブリルはもともと空隙を伴う比較的高い体積状態にあり、揺らぎによってかなりの水和が進行する活性化状態に達し、さらにより完全に水和した低体積のモノマーに解離する、と予想される。この成果はアミロイドプロトフィブリル及びその解離に関して初めての体積パラメータからの解析であり、その実験方法とともに、今後のアミロイド線維機構の解析について、貴重な示唆を与える研究成果であるといえる。
期刊论文(2)
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科研奖励(0)
会议论文
The use of high pressure NMR to study protein folding.
使用高压核磁共振研究蛋白质折叠。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Method in Molecular Biology In press
影响因子:
--
作者:
[Lassale, M.W., Akasaka, K.]
通讯作者:
K.
DOI:
10.1016/j.jmb.2005.04.010
发表时间:
2005-06-24
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
5.6
作者:
[Kamatari, YO, Yokoyama, S, Akasaka, K]
通讯作者:
Akasaka, K
圧力軸実験を主とするアミロイド形成と解離メカニズムの研究
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批准号:18031040
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$8.06万
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财政年份:2006
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質の水和と熱励起構造
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批准号:16041244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$8.51万
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财政年份:2004
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高圧NMRによる蛋白質構造とダイナミックスの研究
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批准号:99F00183
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質の基本構造に対する圧力効果
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批准号:10157215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1998
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高圧NMRによる蛋白質の構造及び熱力学的安定性に関する研究
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批准号:97F00117
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1998
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質立体構造安定性に及ぼす圧力効果
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批准号:09261224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1997
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質変性に対する圧力効果
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批准号:07280216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRによるヘムタンパク質の構造形成過程
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批准号:05209220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1993
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRによるヘムタンパク質多元構造のダイナミックス
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批准号:04225214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1992
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRを用いた金属タンパク質の多元的構造と反応過程制御の研究
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批准号:03241213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1991
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高速温度ジャンプNMR装置の開発とそのタンパク質構造転移への応用
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批准号:02558028
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
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资助金额:$7.49万
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财政年份:1990
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
recAタンパク質の動的構造と機能
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批准号:62220017
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1987
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
相転移を利用した二次元NMR分光法の開発
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批准号:61840014
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$14.59万
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财政年份:1986
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
reCAタンパク質の動的構造と機能
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批准号:61230012
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1986
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
アミノ酸側鎖レベルでみたタンパク質-タンパク質相互作用
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批准号:56580199
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1981
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
核酸-タンパク質間の特異的水素結合の検出
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批准号:X00040----220616
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1977
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
核酸-タンパク質複合体形成に関するモデル的研究
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批准号:X00040----921006
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1974
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
NMR による生体高分子の構造と生体分子間相互作用の研究
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批准号:X00080----748167
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.42万
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财政年份:1972
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负责人:赤坂 一之
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依托单位: