圧力軸実験を主とするアミロイド形成と解離メカニズムの研究
圧力軸実験を主とするアミロイド形成と解離メカニズムの研究
批准号:
18031040
负责人:
赤坂 一之
金额:
$8.06万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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野生型ニワトリリゾチーム(SS結合を4つもつ4SS体)及びそのモデル系としてSS結合欠損変異体(0SS,1SS)を対象に、アミロイド線維形成に必須のプロトフィブリル形成・解離の機構をCD,AFM,高圧蛍光、高圧NMRを用いて総合的に研究し、また圧力解離等の基本となる、プロトフィブリル形成に伴う蛋白質の部分モル体積変化を、密度計により直接測定した。これまでの研究で0SS体の自発的プロトフィブリル形成過程が、大きな部分モル体積の増大と大きな圧縮率の増大を伴うことを明らかにしている。この結果は、アミロイド線維を形成するプロトフィブリルが空隙の大きな、揺らぎの大きな構造状態であることを初めて明確に示した。平成19年度ほこれを野生型ニワトリリゾチーム(4SS体)にも拡張した。安定な4SS体おいては線維(β-oligomer)形成は室温付近では起こらないが、低いpHで加熱(57℃)すると、生じた"熱変性"蛋白質が溶液内の種(シード)と反応して、β-oligomerが形成されることを明らかにした(Native lysozyme 〓 Denatured lysozyme)+seed ⇒ β-oligomer)。さらに、生成したプロトフィブリルの線維長がほぼ単一の指数関数分布に従うことから、4SS体においてもプロトフィブリルの成長は、0SS体の場合と同様に、線維の成長端にモノマーが常に一定の親和力で脱着することによって起こると考えられる。結論として、野生型ニワトリリゾチームのアミロイド・プロトフィブリルの成長はおよそ次のような逐次反応スキームに従って起こる。(Native lysozyme 〓 Denatured lysozyme)+β-oligomer ⇒キキキ⇒ protofibril.
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Peptide regions protected against hydrogen/deuterium-exchange in the fibril of a hen lysozyme disulfide-deficient variant
母鸡溶菌酶二硫化物缺陷变体原纤维中的肽区域免受氢/氘交换的影响
DOI:
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发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[赤坂一之, 橘 秀樹 (Abdul Raziq Abdul Latif), 赤坂一之 (K.Akasaka), 赤坂一之 (H. Li), Kazuyuki Akasaka, 荒賀 麻里子, Hideki Tachibana, Hideki Tachibana]
通讯作者:
Hideki Tachibana
体積および圧縮率から見たアミロイド線維
淀粉样原纤维的体积和可压缩性
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
高圧バイオサイエンスとバイオテクノロジー第15回生物関連高圧研究会20周年記念シンポジウム・プロシーディングス 2(印刷中)
影响因子:
--
作者:
[Ken Sasaki, 橘 秀樹]
通讯作者:
橘 秀樹
Pressure dissociation kinetics of amyloid protofibrils.
淀粉样原纤维的压力解离动力学。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biophysical Journal 94
影响因子:
--
作者:
[赤坂一之, 橘 秀樹 (Abdul Raziq Abdul Latif)]
通讯作者:
橘 秀樹 (Abdul Raziq Abdul Latif)
Protein Folding Protocols in Methods in Molecular Biology Vol.350 (edited by Yawen Bai and Ruth Nussinov) (Humana Press Inc.)
分子生物学方法中的蛋白质折叠方案第 350 卷(由 Yawen Bai 和 Ruth Nussinov 编辑)(Humana Press Inc.)
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
影响因子:
--
作者:
[赤坂一之, 橘 秀樹 (Abdul Raziq Abdul Latif), 赤坂一之 (K.Akasaka), 赤坂一之 (H. Li), Kazuyuki Akasaka, 荒賀 麻里子, Hideki Tachibana, Hideki Tachibana, Ryohei Kono, 林 逸歩, 赤坂一之 (M.Lassalle)]
通讯作者:
赤坂一之 (M.Lassalle)
DOI:
10.1021/bi700648b
发表时间:
2007-09-18
期刊:
BIOCHEMISTRY
影响因子:
2.9
作者:
[Akasaka, Kazuyuki, Latif, Abdul Raziq Abdul, Gekko, Kunihiko]
通讯作者:
Gekko, Kunihiko
共 15 条
圧力軸における蛋白質フォールディングの物理化学的研究
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批准号:04F03363
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質の水和と熱励起構造
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批准号:16041244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$8.51万
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财政年份:2004
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高圧NMRによる蛋白質構造とダイナミックスの研究
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批准号:99F00183
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質の基本構造に対する圧力効果
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批准号:10157215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1998
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高圧NMRによる蛋白質の構造及び熱力学的安定性に関する研究
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批准号:97F00117
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1998
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質立体構造安定性に及ぼす圧力効果
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批准号:09261224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1997
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
蛋白質変性に対する圧力効果
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批准号:07280216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRによるヘムタンパク質の構造形成過程
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批准号:05209220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1993
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRによるヘムタンパク質多元構造のダイナミックス
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批准号:04225214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1992
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
温度ジャンプNMRを用いた金属タンパク質の多元的構造と反応過程制御の研究
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批准号:03241213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1991
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
高速温度ジャンプNMR装置の開発とそのタンパク質構造転移への応用
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批准号:02558028
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
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资助金额:$7.49万
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财政年份:1990
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
recAタンパク質の動的構造と機能
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批准号:62220017
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1987
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
相転移を利用した二次元NMR分光法の開発
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批准号:61840014
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$14.59万
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财政年份:1986
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
reCAタンパク質の動的構造と機能
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批准号:61230012
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1986
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
アミノ酸側鎖レベルでみたタンパク質-タンパク質相互作用
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批准号:56580199
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1981
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
核酸-タンパク質間の特異的水素結合の検出
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批准号:X00040----220616
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1977
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
核酸-タンパク質複合体形成に関するモデル的研究
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批准号:X00040----921006
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1974
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
NMR による生体高分子の構造と生体分子間相互作用の研究
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批准号:X00080----748167
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.42万
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财政年份:1972
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负责人:赤坂 一之
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依托单位:
海外基金