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マイクロアレイとBACコンティグを用いた神経芽腫発症の分子機構の解析

使用微阵列和 BAC 重叠群分析神经母细胞瘤发生的分子机制

基本信息

批准号：
16790568
负责人：
滝田順子
金额：
$ 1.98万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

神経芽腫(NB)は脳腫瘍に次いで頻度の高い小児固形腫瘍であるが、その発症の機序は十分に解明されていない。一方、腫瘍細胞で高頻度に観察されるゲノムの増幅・欠失などの変化は、しばしば腫瘍の発症機序と密接な関連を有することが知られており、これらの異常を網羅的に解析することは腫瘍の多様な分子機構を解明する上で有力な手段と考えられる。そこで本年度はNB細胞株25株、新鮮腫瘍30例にっき、12〜25万個のSNP特異的オリゴヌクレオチドプローブを搭載した(Affymetrix【○!R】Gene Chip【○!R】 50k、250k array)を用いて、NBにおけるmolecular allelo-karyotyping解析を行った。アレイ解析の結果は、HSH解析、PCR-SSCP法、直接塩基配列決定法およびreal-time PCR法を用いて検証を行った。解析した細胞株25株中20株と新鮮腫瘍の30例中10例で従来より知られているMYCN領域の増幅を確認し、このうち18株でMYCNの近傍に新たな増幅シグナルを検出した。またこれまでに報告のない7q、11q、15qなどの高度増幅も検出された。また同様に従来より報告のある17qの増幅も細胞株20株中12株、新鮮腫瘍30例中21例で検出され、この領域内に約700kbの新規高度増幅領域を計7例の検体で検出した。この700kbの領域内には唯一の構造遺伝子が存在することが判明し、この遺伝子の発現解析を行ったところ、ゲノムの増幅のみられる症例では有意な高発現が観察された。これ以外にもLOHやアレル不均衡、およびホモ欠失が多数検出された。以上より、NBで最も頻度の高いゲノム変異である17qの増幅領域内に新規高度増幅遺伝子(NBA17)を同定したが、複数の検体でこの遺伝子の高発現が観察されたことより、NBA17がNBの発症や進展に関与する新規がん遺伝子であることが示唆された。

Neuroblastoma (NB) has a high frequency of small and medium-sized solid tumors, and the mechanism of its development is well understood. A high frequency of detection of tumor cells in one side and a high frequency of detection of tumor cells in another side and a high frequency of detection of tumor cells in another side and a high frequency of detection of tumor cells in the other side. This year, 25 NB cell lines, 30 fresh tumors, 120,000 to 250,000 SNP-specific DNA fragments were obtained. R】Gene Chip【○! R] 50k, 250k array), NB, molecular allelo-karyotyping analysis. The results of PCR analysis, HSH analysis, PCR-SSCP method, direct nucleotide alignment determination method and real-time PCR method were used for identification. 20 of the 25 cell lines were analyzed and 10 of the 30 fresh tumors were identified. The height and amplitude of the report are 7q, 11q and 15q. 12 out of 20 cell lines, 21 out of 30 fresh tumors and 7 out of 700kb in the new highly amplified domain were detected. It has been determined that the only structural gene exists in this 700kb field, and the analysis of the occurrence of this gene has been carried out. However, the increase in the number of cases in the field has been intentionally observed. This is because most of them are unbalanced, unbalanced, and unbalanced. The high frequency of the above, NB, and NB increased by 17q in the amplitude domain, the high frequency of the new algorithm increased by 17q in the amplitude domain (NBA17), and the high frequency of the algorithm increased by 17q in the amplitude domain (NBA17).

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Mutations of the PTPN11 and RAS genes in rhabdomyosarcoma and pediatric hematological malignancies

DOI：
10.1002/gcc.20322
发表时间：
2006-06-01
期刊：
GENES CHROMOSOMES & CANCER
影响因子：
3.7
作者：
Chen, YY;Takita, J;Hayashi, Y
通讯作者：
Hayashi, Y

Aberrations of the CHK2 gene are rare in pediatric solid tumors.

CHK2 基因的畸变在儿童实体瘤中很少见。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Int J Mol Med 16・1
影响因子：
0
作者：
Kamio T;Toki T;Sasaki S;Ito E et al.;Chen YY;Chen YY;Lee SY;Chen YY
通讯作者：
Chen YY

In vitro drug resistance to imatinib and mutation of ABL gene in childhood Ph+ acute lymphoblastic leukemia.

儿童Ph急性淋巴细胞白血病体外伊马替尼耐药及ABL基因突变

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Leukemia and Lymphoma 46・2
影响因子：
0
作者：
Kamio T;Toki T;Sasaki S;Ito E et al.;Chen YY;Chen YY;Lee SY;Chen YY;Kawaguchi H
通讯作者：
Kawaguchi H

Gene expression profiling and identification of novel prognostic marker genes in neuroblastoma