栄養状態変化に対するマウスDNAメチル化プロファイルの変動性に関する研究

小鼠 DNA 甲基化谱随营养状况变化变化的研究

基本信息

  • 批准号:
    05J11557
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.58万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DNAメチル化は細胞分裂後のゲノムに複製される、細胞固有の情報を維持伝達するエピジェネティクス機構である。哺乳類においてDNAメチル化は遺伝子サイレンシングやクロマチン構造の凝縮を起こし、組織特異的遺伝子発現、細胞分化などに関与している。すなわち、ゲノムワイドなDNAメチル化プロファィルが、細胞のエピジェネティック情報の主体である。本研究ではメチル化プロファイルが栄養状態など細胞の代謝状態の変化に対してどの程度安定であり可変的であるか、個体のエネルギー対象の上で重要な白色及び褐色脂肪細胞を対象にして解析を行った。マウス白色前駆脂肪細胞in vitro系の脂肪蓄積過程におけるメチル化プロファイル解析を行った。RLGS法による約1,100のNotI座位のメチル化状態解析、Vi-RLGS法によるメチル化変動座位の予測、159のNotI座位の定量的リアルタイムPCR及びPyrosequenceによるメチル化状態解析を行い、脂肪蓄積過程でメチル化状態が変化する座位を同定した。またメチル化変化パターンとして一方向遷移と一過的変化が見出され、脂肪蓄積過程でメチル化プロファイルが柔軟に変化することが明らかになった。さらにマウス組織・幹細胞におけるメチル化プロファイルの類似度比較及びプロファイル構成座位のゲノム情報解析を行い、白色及び褐色脂肪細胞とその前駆細胞、及びその他の各種組織・細胞のメチル化プロファイルについて、階層的クラスタリング法による類似度解析を行った。メチル化プロファイルは形質上の類似性を反映することが確認された。さらに脂肪細胞系列間でのメチル化プロファイルはその他の組織・細胞よりも類似度が高いことが明らかになった。代謝状態に応じてメチル化状態は個別の座位では柔軟に変動するものの、プロファイル全体では細胞系列の範囲内での類似性を保ち安定であることが示された。
DNA sequencing is the process of replication after cell division and the maintenance of cell-specific information. Mammalian DNA fragmentation, DNA condensation, tissue-specific gene development, and cell differentiation The main body of the information in the cell is called DNA. This study aims to analyze the variable degree of stability in the nutritional status of adipocytes and changes in the metabolic status of cells, as well as important white and brown adipocytes among individual adipocytes. White preadipocytes in vitro are analyzed during fat accumulation. RLGS method for about 1,100 NotI locus classification status analysis, Vi-RLGS method for the prediction of the classification of variable loci, 159 NotI locus quantitative classification PCR and Pyrosequence for the classification status analysis, fat accumulation process for the classification of variable loci to determine the same The process of fat accumulation is characterized by a change in texture, a change in orientation, and a change in texture. The similarity analysis of tissue, stem cell, white and brown adipose cells, anterior adipose cells, and other tissue and cell types was performed by the similarity comparison and hierarchical classification method. The similarity between the two groups is confirmed. The similarity between fat cell series and other tissues is high. Metabolic status: The metabolic status of individual loci is soft, the metabolic status of the whole cell is stable, and the metabolic status of the whole cell is stable.

项目成果

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