Genomic and proteomic characterizations of the central nervous system tumors

中枢神经系统肿瘤的基因组和蛋白质组特征

• 批准号: 19791003
• 负责人: OKAMOTO Hiroaki
• 金额: $ 2.23万
• 依托单位: Saga University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19791003/
• 关键词: ゲノミクス; プロテオミクス; 脳腫瘍; 神経膠腫; 脳重瘍; 神経膠種

私は脳腫瘍を対象とした研究で、病理学的診断をもとにそれぞれのsubtype間の網羅的な蛋白発現検索を施行し、これらの解析を更に進めることで各脳腫瘍(特に神経膠腫)および各subtype間の特徴をプロテオミクスパターンとしてデータベース化できないかと考えてきた。この"脳腫瘍ファイル"が出来上がれば、例えば病理学的には診断困難な場合、プロテオミクス解析からの病理診断を判断すると言う逆からのアプローチも可能になると思われる。また特に神経膠芽腫などに関してはまだ細かなsubtypeへの分類が必要と以前より考えられているが、この病理学的診断手法、プロテオミクス解析手法を合わせることによりその細分化も可能になると考えられる。平成20年度は、これまでの情報の蓄積を行うことで、脳腫瘍のプロテオミクスデータベースの構築を継続した。実際の症例に対してこの構築したプロテオミクスデータベースを利用することで、病理学的診断を試みている。これらの結果を踏まえ、当研究で得たプロテオミクスパターンと病理学的診断との関連を解析している。次にゲノムマイクロアレーによるゲノミクスデータに基づいた1p,10q,19qなどのLOHの陽性群陰性群の比較検討、EGFRのamplification有無での検討、またMSPによるMGMTのメチル化の有無での検討、更には予後(生存期間、薬剤感受性)などの因子に関しても比較検討している。これらの結果により、ゲノム異常に関連すると考えられる蛋白の同定を行い、マーカーとして有用かどうか検討するのみでなく、治療標的としても対象となりうるかどうか検討した(検討症例21例)。

The study of tumor imaging and pathological diagnosis includes protein discovery among all subtype, protein detection among all subtype, protein analysis among all subtype, and protein detection among all subtype. The diagnosis of this disease is difficult, and the diagnosis of this disease is difficult. The classification of neuroblastoma is necessary, and the pathological diagnosis method is necessary, and the analysis method is possible. In the 20th year of Heisei, the accumulation of information was carried out, and the construction of information was carried out. In the case of actual disease, the construction of the disease model and the use of pathological diagnosis were studied. The results of this study were analyzed and compared with pathological diagnosis. In addition, the comparison of positive and negative groups of LOH, EGFR amplification, MSP, MGMT and postnatal factors (survival period, drug susceptibility) should be carried out according to the following factors: 1p,10q,19q. The results showed that the abnormal correlation between the protein and the target of treatment was not significant (21 cases).

项目成果

Proteomic characterization of primary diffuse large B-cell lymphomas in the central nervous system.

中枢神经系统原发性弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的蛋白质组学特征。

• 发表时间: 2008
• 期刊: Journal of Neurosurgery
• 影响因子: 4.1
• 作者: Jie Li;H. Okamoto;Chunyue Yin;J. Jagannathan;J. Takizawa;S. Aoki;S. Gläsker;E. Rushing;A. Vortmeyer;E. Oldfield;R. Yamanaka;Z. Zhuang
• 通讯作者: Z. Zhuang

Identification of a novel proliferation-related protein, WHSC1 4a, in human gliomas

• DOI: 10.1215/15228517-2007-036
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: NEURO-ONCOLOGY
• 影响因子: 15.9
• 作者: Li, Jie;Yin, Chunyue;Zhuang, Zhengping
• 通讯作者: Zhuang, Zhengping