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小児がんにおける網羅的ゲノム・エピゲノム解析

儿童癌症的全面基因组和表观基因组分析

基本信息

批准号：
08J07931
负责人：
加藤元博
金额：
$ 0.77万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

がんの発症の基盤となるゲノム異常を明らかにするために、高密度ゲノムアレイを中心としたゲノム解析手法で、網羅的にゲノム異常を解析し、がんに生じているゲノム異常を詳細に明らかにし、標的遺伝子の探索を行った。解析の結果、横紋筋肉腫筋肉腫35例中1例にALK遺伝子の増幅があり、Ewing肉腫においてもALK遺伝子の変異が49例中2例において生じていることが明らかになった。神経芽腫で昨年度に報告したALK遺伝子の異常は横紋筋肉腫筋肉腫やEwing肉腫においてもその病態に関与していることが示され、これらの難治性疾患の予後を改善させる標的分子としても期待される。さらに、急性白血病などの造血器腫瘍496例、神経芽腫などの固形腫瘍135例について網羅的なヘテロ接合性の消失(LOH)についてその分布を詳細に検討したところ、腫瘍間で共通したLOHの集積領域がある一方で、腫瘍において特異的なLOHの集積領域があり、さらに、腫瘍内でもこのLOHの分布はクラスターを形成することが示された。それぞれのLOH領域にはがん関連遺伝子が存在しており、LOHの分布を詳細に検討することで、さらに新たながん関連遺伝子の同定に至る可能性が示された。また、悪性リンパ腫238例に対してのゲノム解析の結果から、A20遺伝子がその10%に欠失または変異を起こしていることを同定した。A20遺伝子を欠いた細胞株にA20を誘導的に発現させることにより、細胞の増殖は抑制され、免疫不全マウスにおける腫瘍造成能も抑制された。これらのことから、A20が悪性リンパ腫においてがん抑制遺伝子として発症・病態に関与していることが明らかになった。A20は炎症反応や免疫反応において中心的な役割を果たす分子であることから、本研究で明らかになったA20の異常は、慢性的な炎症とリンパ腫発症とを結びつける分子機序のひとつであると推定された。

For the purpose of analyzing and analyzing the abnormal phenomena, we should analyze the abnormal phenomena in detail and explore the abnormal phenomena in detail The results of analysis showed that 1 of 35 cases of striated muscle swelling had ALK gene increased in amplitude and 2 of 49 cases had ALK gene variation. In the past year, we have reported that there are abnormal changes in ALK gene expression, such as striated muscle mass and Ewing muscle mass, which are related to the pathological changes and the future improvement of these refractory diseases. In addition, 496 cases of acute leukemia and 135 cases of leukemia and 135 cases of solid tumors were examined in detail. The distribution of LOH was analyzed in detail. The common LOH accumulation domain among tumors was analyzed in detail. The specific LOH accumulation domain among tumors was analyzed in detail. The distribution of LOH in tumors was analyzed in detail. The existence of related genes in the LOH domain is discussed in detail, and the possibility of identifying new related genes is shown. The results of the analysis of the 238 cases were different from those of the A20 cases. A20-induced cell growth inhibition, immune deficiency and tumor inhibition A20 is the most important factor in the development of the disease. A20 is the molecular mechanism of inflammatory response and immune response center. This study shows that A20 is abnormal and chronic inflammatory response.