Analyse der Expression aller Gene einer Zelle am Beispiel des Bakteriums Mycoplasma pneumoniae

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In der bisherigen Förderperiode wurde ein Verfahren ausgearbeitet und beispielhaft angewandt, um eine Transkriptionsanalyse aller (ungefähr 700) Gene des Genoms (Transkription) des Bakteriums Mycoplasma pneumoniae durchzuführen. Darauf aufbauend wurden für den Fortsetzungsantrag folgende Ziele vorgegeben: 1. Überprüfung der bisherigen Ergebnisse mit einer zweiten unabhängigen Methode; 2. Transkriptomanalysen von M. pneumoniae Zellen, welche unter "in vivo nahen" Bedingungen in vitro vermehrt worden sind, z. B. in Gegenwart von humanen Lungenepithelzellen, die als Wirtszellen dienen; 3. Untersuchungen zur Funktion und Regulation der Expression solcher Gene, welche bei Transkriptomanalysen auffällig geworden sind. Die Versuchsplanung basiert auf der inzwischen experimentell bestätigten Hypothese, daß M. pneumoniae Zellen in Abhängigkeit von den Wachstumsbedingungen unterschiedliche Transkriptionsmuster zeigen. Weiterhin wird angenommen, daß die Funktionen aller Gene, welche aufgrund eines bestimmten externen Stimulus mit einer Erhöhung der Zahl der Transkripte reagieren, mit dem Stimulus ursächlich in Zusammenhang stehen und damit einem gewissen Funktionskreis zugeordnet werden können. Auf der Grundlage dieser Vorselektion werden die Funktionen einzelner interessanter Kandidaten experimentell bestimmt.