レンサ球菌属における種特異的ゲノム進化機構の解明

阐明链球菌属物种特异性基因组进化机制

• 批准号: 21390487
• 负责人: 中川 一路
• 金额: $ 11.48万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21390487/
• 关键词: A群レンサ球菌; S.mutans; ファージ; 進化; 再構成; CRISPR; レンサ球菌; Streptococcus mutans; バクテリオファージ; グノム再構成

広範かつ多種にわたる病原性細菌のゲノム解析が世界的規模で推進され,現在ではこれらの遺伝子情報の入手は容易となってきでいる.口腔の2大疾患の1つである齲蝕は,感染症的色彩の強い疾患であり,その原因がStreptococcus mutansを中心とするレンサ球菌によることは多くの報告から明らかであるが,その機能発現メカニズムについては未だ不明な点が多い.レンサ球菌種の分類学上の分類基準種であり,かつ咽頭部粘膜が初発感染部位と考えられるA群レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)は,多彩な病態を示し,近年,劇症型A群レンサ球菌感染症(TSLS)の起因菌として注目を集めている.S.pyogenesは,申請者らが決定した劇症型のSSI-1株を含め13株のゲノムが決定されている.比較ゲノム解析の結果,S.pyogenesゲノムの約1/5もがファージ由来であり,そのため,S.pyogenesはファージによって異なる病原因子を獲得し,これが本菌による多彩な病原性を発揮する原因の一つだと考えられている.細菌のファージへの獲得免疫として機能することが実験的に証明されたclustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)が同種の配列を持つファージへの抵抗性を持つようになることが報告されているが,その詳細な機構は明らかとされていない.そこで本研究では、CRISPRはすでにゲノムに入り込んだファージ由来の遺伝子によってその遺伝子発現が特異的に抑制されていることを明らかとし、またA群レンサ球菌ではゲノムの再構成そのものにも関わっていることを明らかとした.すなわちワァージは細菌の免疫機構を打ち破る,いわばanti-CRISPR systemをすでに有していることが推定された.

Hiroo van か つ multiple に わ た る pathogenic bacteria の ゲ ノ ム parsing が world scale で propulsion さ れ, now で は こ れ ら の heritage 伝 child intelligence with の は easy と な っ て き で い る. Oral の の 1 2 big disease つ で あ る decay は, strong adapting just-in-time inventory color の い disorders で あ り, そ の reason が Streptococcus Mutans を center と す る レ ン サ aureus に よ る こ と は more く の report か ら Ming ら か で あ る が, そ の function 発 now メ カ ニ ズ ム に つ い て は not unknown だ な point が い. レ ン サ aureus species on の の taxonomic classification benchmark で あ り, か つ those department at the beginning of the mucosa が 発 infection site と exam え ら れ る group A レ ン サ aureus (Strepto Coccus pyogenes) は, colorful な pathological を し, in recent years, play USES A group of レ ン サ aureus adapting just-in-time inventory (TSLS) の causes bacterium と し て attention を set め て い る. Supachai panitchpakdi yogenes は, applicants ら が decided し た play USES の SSI - 1 strain を containing め 13 strains の ゲ ノ ム が decided さ れ て い る. Compare ゲ ノ ム parsing の results, supachai panitchpakdi yogenes ゲ ノ ム の about 1/5 も が フ ァ ー ジ origin で あ り, そ の た め, supachai panitchpakdi yogenes は フ ァ ー ジ に よ っ て different な る pathogenic factor を し, こ れ が this bacterium に よ る colorful な pathogenicity を 発 swing す る reason の つ だ と exam え ら れ て い る. Bacteria <s:1> ファ ジへ ジへ ジへ ファ acquire immune と <s:1> て function する とが とが experimental に proof されたclustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) が same の match column を hold つ フ ァ ー ジ へ の resistance を hold つ よ う に な る こ と が report さ れ て い る が, そ の detailed な institutions は Ming ら か と さ れ て い な い. そ こ で this study で は, CRISPR は す で に ゲ ノ ム に into り 込 ん だ フ ァ ー ジ origin の heritage 伝 son に よ っ て そ の heritage 伝 発 now が specific に suppression System さ れ て い る こ と を Ming ら か と し, ま た group A レ ン サ aureus で は ゲ ノ ム の reconstitution そ の も の に も masato わ っ て い る こ と を Ming ら か と し た. す な わ ち ワ ァ ー ジ は bacteria の immune institutions を ち to smash る, い わ ば anti - CRISPR system を す で に have し て い る こ と が presumption さ れ た.

项目成果

Potent in vitro and in vivo antitumor effects of MDM2 inhibitor nutlin-3 in gastric cancer cells

• DOI: 10.1111/j.1349-7006.2010.01821.x
• 发表时间: 2011-03-01
• 期刊: CANCER SCIENCE
• 影响因子: 5.7
• 作者: Endo, Shinji;Yamato, Kenji;Hyodo, Ichinosuke
• 通讯作者: Hyodo, Ichinosuke

Streptococcus, Shigella and Listeria-induced autophagy.

链球菌、志贺氏菌和李斯特菌诱导的自噬。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Method Enzymol. 452
• 作者: Ogawa M;et al.
• 通讯作者: et al.

A群レンサ球菌プロファージによるCRISPR制御機構の解析

A组链球菌原噬菌体的CRISPR控制机制分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 李銀姫;久木田明子;久木田敏夫;森宏員
• 通讯作者: 森宏員

The dawning era of comprehensive transcriptome analysis in cellular microbiology.

• DOI: 10.3389/fmicb.2010.00118
• 发表时间: 2010
• 期刊: Frontiers in microbiology
• 影响因子: 5.2
• 作者: Aikawa C;Maruyama F;Nakagawa I
• 通讯作者: Nakagawa I

Rab タンパク質による A 群レンサ球菌感染誘導オートファジーの制御機構

Rab蛋白控制A族链球菌感染诱导自噬的机制

• 发表时间: 2012
• 作者: 野澤孝志; 相川知宏;郷田瑛;丸山史人;中川一路
• 通讯作者: 中川一路