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シロイヌナズナDNAアレイを用いた遺伝子発現制御ネットワークの解析

使用拟南芥 DNA 阵列分析基因表达控制网络

基本信息

批准号：
17017041
负责人：
関原明
金额：
$ 3.2万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

シロイヌナズナ22Kオリゴアレイを用いて、低温ストレスから回復までの過程の遺伝子発現プロファイル解析を行った。低温ストレス処理または低温ストレスからの回復過程で発現が変動する618個の遺伝子をクラスタリングして発現パターンでグループ分けした。その結果、(1)低温ストレスからの回復過程で発現誘導される遺伝子の多くは、低温ストレス処理で発現が抑制され、また逆に(2)低温ストレスからの回復過程で発現が抑制される遺伝子の多くは、低温ストレス処理で発現が誘導されることが明らかになった。種々の転写因子(bZIP転写因子のAREB1やNAC転写因子のNST1など)に関して、過剰発現型トランスジェニック植物などをマイクロアレイ解析することにより、転写因子により制御される下流のターゲット遺伝子を同定した。ストレス応答に関与する種々の制御遺伝子(Ser/Thr型プロティンキナーゼのSOS2,カルシュニューリンのβサブユニットをコードするSOS3,WRKYドメインを持つSLH1,ABA誘導性のレセプター型プロティンキナーゼのRPK1など)に関して、遺伝子破壊系統のマイクロアレイ解析を行うなどして制御遺伝子の機能解析を行った。これまでに同定した約600個のストレス誘導性遺伝子に関して、1kbのプロモーター断片を回収し、プロモーター+LUC、プロモーター+GUSのベクターコンストラクトを作製した。それらコンストラクトを含むトランスジェニック植物の作出を進め、これまでにプロモーター+LUCのT2植物を約200系統作製した。得られたT2系統について、LUC遺伝子の発現解析を進めている。シロイヌナズナ全ゲノムタイリングアレイを用いた遺伝子発現解析システムの立ち上げも進め、プローブの調製方法などタイリングアレイ実験のプロトコールをほぼ確立した。

At 22K, the temperature is low and the temperature is low. During the whole process, you will be able to analyze the data. In the course of the operation of the cryogenic cycle, the operating cycle of the cryogenic cycle has been realized through the operation of 618 operating units. The results are as follows: (1) the results show that: (1) the process of low-temperature temperature reduction is effective, and that of low-temperature temperature is different. (1) the results of the test results are as follows: (1) the results of the test results are as follows: (1) the results of the test results are as follows: (1) the results of the test results, (1) the results of the test results: (1) the results show that the low temperature temperature response process results in the reduction of temperature, temperature and temperature. A variety of bZIP writing factors (bZIP writing factors, AREB1 writing factors, writing factors, NST1 writing factors) are used to determine whether or not you are responsible for the analysis of environmental pollution in plants. Please tell me how to make sure that you have a lot of trouble with other types of equipment (Ser/ THR). You need to know that you need to make sure that you have a SLH1, and that you need to know that you are not responsible for your SLH1. You need to know that you are not responsible for SLH1. The ABA system is capable of parsing the bank, the system, the machine, the computer, the computer, the computer, This is the same as the agreement for about 600th of the total number of clips, 1kb fragments, LUC, GUS fragments, and so on. This is the most important thing in the world. You need to improve the quality of your plants. You need to improve your performance. If you want to use LUC T2 plants, you will need to pay more than 200 percent of them. It is necessary to improve the performance of the T2 system and LUC system. In the first place, please do not know if you are going to make progress on the computer. Please do not know what to do. Please do not know what to do. Please do not know if you are going to make progress.