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シロイヌナズナDNAアレイを用いた遺伝子発現制御ネットワークの解析

使用拟南芥 DNA 阵列分析基因表达控制网络

基本信息

批准号：
17017041
负责人：
関原明
金额：
$ 3.2万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

シロイヌナズナ22Kオリゴアレイを用いて、低温ストレスから回復までの過程の遺伝子発現プロファイル解析を行った。低温ストレス処理または低温ストレスからの回復過程で発現が変動する618個の遺伝子をクラスタリングして発現パターンでグループ分けした。その結果、(1)低温ストレスからの回復過程で発現誘導される遺伝子の多くは、低温ストレス処理で発現が抑制され、また逆に(2)低温ストレスからの回復過程で発現が抑制される遺伝子の多くは、低温ストレス処理で発現が誘導されることが明らかになった。種々の転写因子(bZIP転写因子のAREB1やNAC転写因子のNST1など)に関して、過剰発現型トランスジェニック植物などをマイクロアレイ解析することにより、転写因子により制御される下流のターゲット遺伝子を同定した。ストレス応答に関与する種々の制御遺伝子(Ser/Thr型プロティンキナーゼのSOS2,カルシュニューリンのβサブユニットをコードするSOS3,WRKYドメインを持つSLH1,ABA誘導性のレセプター型プロティンキナーゼのRPK1など)に関して、遺伝子破壊系統のマイクロアレイ解析を行うなどして制御遺伝子の機能解析を行った。これまでに同定した約600個のストレス誘導性遺伝子に関して、1kbのプロモーター断片を回収し、プロモーター+LUC、プロモーター+GUSのベクターコンストラクトを作製した。それらコンストラクトを含むトランスジェニック植物の作出を進め、これまでにプロモーター+LUCのT2植物を約200系統作製した。得られたT2系統について、LUC遺伝子の発現解析を進めている。シロイヌナズナ全ゲノムタイリングアレイを用いた遺伝子発現解析システムの立ち上げも進め、プローブの調製方法などタイリングアレイ実験のプロトコールをほぼ確立した。

The process of recovery from heat and cold at 22K is analyzed by means of electron evolution. 618 pieces of DNA were found in the recovery process of low temperature treatment. The results are as follows: (1) The recovery process of low temperature temperature shock wave is induced by the occurrence of multiple particles, and the recovery process of low temperature shock wave is inhibited by the occurrence of multiple particles, and the recovery process of low temperature shock wave is inhibited by the occurrence of multiple particles, and the recovery process of low temperature shock wave is induced by the occurrence of multiple particles. The seed writing factor (AREB1 of the ZIP writing factor and NST1 of the NAC writing factor) is related to the occurrence type of the plant and the control type of the downstream writing factor. The analysis of Ser/Thr type receptor SOS2, CRR type receptor β receptor SOS3,WRKY type receptor SLH 1, ABA induced receptor Ser/Thr type receptor RPK 1, CRR type receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr type receptor β receptor SLH1,ABA induced receptor RPK1, CRR type receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr type receptor β receptor Ser/Thr type receptor Ser/Thr This is the same as about 600 gene expression vectors, 1kb gene expression vectors, LUC gene expression vectors, and GUS gene expression vectors. There are about 200 systems for the production of Konsanskoft including Konsanskoft Jnikköft plants, and there are about 200 systems for the production of T2 plants from Promo Tara +LUC. T2 system, LUC genetic analysis of the occurrence of the progress All kinds of different kinds of different