シロイヌナズナ完全長cDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析
使用拟南芥全长 cDNA 微阵列进行基因表达分析
基本信息
- 批准号:13202075
- 负责人:
- 金额:$ 3.39万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では、モデル高等植物のシロイヌナズナを用い、シロイヌナズナ完全長cDNAマイクロアレイを用いた解析により、種々のストレス、ホルモンおよび光に応答する遺伝子や種々の植物組織特異的に発現する遺伝子等を単離、同定する。同定された遺伝子に関してプロモーター解析(シス配列の検索など)を行う。ビオチン化cap trapper法によりシロイヌナズナの完全長cDNAライブラリーをこれまでに19種類作製し、これまでに約150,000個のcDNAクローンを単離した。それらをクラスタリングしたところ、約14,000個の独立したcDNAグループに分類された。これまでに単離した約7000個の完全長cDNAクローンを用いて完全長cDNAマイクロアレイを作製し、乾燥、低温、塩などのストレスおよび植物ホルモンABAに応答する遺伝子の同定を試みた。その結果、乾燥、低温、塩およびABA誘導性遺伝子はそれぞれ、277個、53個、194個、243個同定された。これら同定された誘導性遺伝子の中には転写因子と相同性を持つものが40個存在しており、乾燥、低温、塩、ABAのシグナル伝達経路には多くの遺伝子発現制御機構が存在していることが明らかとなった。また、同定された乾燥、低温、塩ストレス誘導性遺伝子の重なり具合について調べたところ、乾燥と塩ストレスの両方により誘導される遺伝子は、乾燥と低温ストレスの両方により誘導される遺伝子や低温と塩ストレスの両方により誘導される遺伝子よりもはるかに多く存在していた。これらの結果は、乾燥と塩ストレスのシグナル伝達経路は、低温ストレスのシグナル伝達経路よりもよりクロストークしている、というこれまでに考えられていたモデルと一致した。さらに、同定された低温誘導性遺伝子のプロモーターについて解析したところ、これまでに報告されている低温誘導性の遺伝子発現に関与するシス配列DREをプロモーター領域に持たない遺伝子が存在しており、低温誘導性の遺伝子発現に関与する新規なシス配列の存在が示唆された。
This study で は, モ デ ル higher plants の シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ を い, シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ completely long cDNA マ イ ク ロ ア レ イ を with い た parsing に よ り, kind of 々 の ス ト レ ス, ホ ル モ ン お よ び light に 応 answer す る heritage 伝 や kind son 々 の plant tissue specific に 発 now す る heritage 伝 child such as を 単 from, be す る. Son be さ れ た heritage 伝 に masato し て プ ロ モ ー タ ー parsing (シ ス match column の 検 cable な ど) う を line. ビ オ チ ン cap trapper the law に よ り シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ の completely long cDNA ラ イ ブ ラ リ ー を こ れ ま で に 19 species for し, こ れ ま で に about 150000 の cDNA ク ロ ー ン を 単 from し た. そ れ ら を ク ラ ス タ リ ン グ し た と こ ろ, about 14000 の independent し た cDNA グ ル ー プ に classification さ れ た. こ れ ま で に 単 from し た about 7000 の completely long cDNA ク ロ ー ン を with い て completely long cDNA マ イ ク ロ ア レ イ を し, dry and low temperature, salt な ど の ス ト レ ス お よ び plant ホ ル モ ン ABA に 応 answer す る heritage 伝 の son be を try み た. Youdaoplaceholder0 そ results, drying, low temperature, salt および aba-induced residues 伝 それぞれ, 277, 53, 194, 243 all determined された. こ れ ら with fixed さ れ た induced heritage 伝 child の に は planning write と phase gay を hold つ も の が 40 existing し て お り, dry, low temperature, salt, ABA の シ グ ナ ル 伝 da 経 road に は more く の posthumous son 伝 発 system royal institution が extant し て い る こ と が Ming ら か と な っ た. ま た, with さ れ た is dry, low temperature, salt ス ト レ ス induced posthumous son 伝 の heavy な り with close に つ い て adjustable べ た と こ ろ, dry と salt ス ト レ ス の struck party に よ り induced さ れ る heritage 伝 は, dry と cryogenic ス ト レ ス の struck party に よ り induced さ れ る posthumous son 伝 や cryogenic と salt ス ト レ ス の struck party に よ り induced さ れ る heritage 伝 son よ り も は る か に Youdaoplaceholder0 exists in て て た た. こ れ ら の results は, dry と salt ス ト レ ス の シ グ ナ ル 伝 は 経 road, low-temperature ス ト レ ス の シ グ ナ ル 伝 da 経 road よ り も よ り ク ロ ス ト ー ク し て い る, と い う こ れ ま で に exam え ら れ て い た モ デ ル と consistent し た. さ ら に, with さ れ た traces of low temperature induced 伝 son の プ ロ モ ー タ ー に つ い て parsing し た と こ ろ, こ れ ま で に report さ れ て い る low temperature induced の posthumous son 伝 発 now に masato and す る シ ス match column DRE を プ ロ モ ー タ に ー field hold た な い posthumous son 伝 が exist し て お り, low temperature induced の posthumous son 伝 発 now に masato and す る new rules な シ ス column の There exists が suggesting された.
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
澤崎 達也 他: "植物cDNAからの無細胞蛋白質合成系:コムギ胚芽を用いた網羅的発現"蛋白質、核酸、酵素 臨時増刊号"構造プロテオミクス、蛋白質ネットワークの構造生物学". (in press). (2002)
Tatsuya Sawazaki 等人:“植物 cDNA 的无细胞蛋白质合成系统:使用小麦胚芽的综合表达”蛋白质、核酸、酶特刊“结构蛋白质组学,蛋白质网络的结构生物学”(出版中)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
篠崎一雄 他: "シロイヌナズナゲノム上に同定された転写因子の遺伝子、植物ゲノム機能のダイナミズム"シュプリンガー、フェアラーク東京株式会社. 6 (2001)
Kazuo Shinozaki 等:“拟南芥基因组中鉴定的转录因子基因和植物基因组功能的动态” Springer,Fairlark Tokyo Co., Ltd. 6 (2001)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Seki et al.: "Monitoring the expression pattern of 1300 Arabidopsis genes under drought and cold stresses using a full-length cDNA microarray"Plant Cell. 13. 61-72 (2001)
Seki 等人:“使用全长 cDNA 微阵列监测 1300 个拟南芥基因在干旱和冷胁迫下的表达模式”Plant Cell。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Yoshiba et al.: "Characterization of four extensin genes in Arabidopsis thaliana by differential gene expression under stress and non-stress conditions"DNA Research. 8. 115-122 (2001)
Yoshiba 等人:“通过胁迫和非胁迫条件下的差异基因表达来表征拟南芥中的四个延伸蛋白基因”DNA 研究。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Taji et al.: "Important roles of drought- and cold-inducible genes for galactinol synthase in stress tolerance in Arabidopsis thaliana"Plant Journal. (in press). (2002)
Taji 等人:“半乳糖醇合酶的干旱和寒冷诱导基因在拟南芥胁迫耐受性中的重要作用”植物杂志。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
関 原明其他文献
コロナチン立体異性体ライブラリーを用いた植物ホルモン受容体サブタイプ選択的リガンドのスクリーニング
使用冠菌素立体异构体库筛选植物激素受体亚型选择性配体
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
林 謙吾;加藤信樹;野本春菜;中山美涼;齊藤里菜;渡部 楽;高岡洋輔;加治拓哉;Khurram Bashir;高橋聡史;田中真帆;関 原明;永野 惇;宮本皓司;岡田憲典;上田 実 - 通讯作者:
上田 実
シロイヌナズナ による特異的なスプライシングが発芽後の種子油脂貯蔵プログラムの抑制に必要である
需要拟南芥的特定剪接来抑制发芽后种子油储存程序
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
鈴木 孝征;河合 都妙;上田 実;関 原明;東山 哲也; 中村 研三 - 通讯作者:
中村 研三
蛋白質のチロシンリン酸化が制御する気孔の開口
蛋白质酪氨酸磷酸化控制气孔开放
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
中村 理香;平山 隆志;関 原明;尾山 大明;秦 裕子;中山 洋;藤 泰子;岩崎 渉;石館 文善;古野 暁子;朽津 和幸;坂本 健作;中野 明彦;篠崎 一雄;横山 茂之 - 通讯作者:
横山 茂之
New insights into the molecular mechanisms of centromere distribution during interphase in plants
植物间期着丝粒分布分子机制的新见解
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
山下 朋恵;坂本 卓也;坂本 勇貴;松井 章浩;金 鐘明;関 原明;松永 幸大 - 通讯作者:
松永 幸大
コンデンシンIIによるクロマチン動態の制御
凝缩蛋白 II 对染色质动力学的控制
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
山下 朋恵;坂本 卓也;坂本 勇貴;松井 章浩;金 鐘明;関 原明;松永 幸大 - 通讯作者:
松永 幸大
関 原明的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('関 原明', 18)}}的其他基金
アンチセンスRNAによる概日リズムおよび非生物的ストレス応答の制御機構の解明
反义RNA阐明昼夜节律和非生物胁迫反应的控制机制
- 批准号:
10F00213 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
シロイヌナズナDNAアレイを用いた遺伝子発現制御ネットワークの解析
使用拟南芥 DNA 阵列分析基因表达控制网络
- 批准号:
17017041 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シロイヌナズナDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析
使用拟南芥 DNA 微阵列进行基因表达分析
- 批准号:
16011266 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シロイヌナズナ完全長cDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析
使用拟南芥全长 cDNA 微阵列进行基因表达分析
- 批准号:
15011264 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シロイヌナズナ完全長cDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析
使用拟南芥全长 cDNA 微阵列进行基因表达分析
- 批准号:
14011257 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シロイヌナズナ完全長cDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析
使用拟南芥全长 cDNA 微阵列进行基因表达分析
- 批准号:
12202056 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
逆遺伝学的手法による高等植物シグナル伝達経路関連遺伝子の機能解析
利用反向遗传学方法对高等植物信号转导途径相关基因进行功能分析
- 批准号:
11780502 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
cDNAセレクション法とトランスポゾンタギング法による高等植物の機能遺伝子の単離
使用 cDNA 选择和转座子标记方法分离高等植物中的功能基因
- 批准号:
09780647 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
cDNAセレクション法による植物の形態形成および胚発生に関与する遺伝子の単離
使用 cDNA 选择方法分离参与植物形态发生和胚胎发育的基因
- 批准号:
08780666 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
Identification of novel neoantigen candidates in cancers by full-length cDNA sequencing using a long read sequencer
使用长读长测序仪进行全长 cDNA 测序,鉴定癌症中的新型新抗原候选物
- 批准号:
19K16792 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Comprehensive analysis of full length cDNA and alternative splicing for the genes related to fruit development and ripening
果实发育成熟相关基因全长cDNA及选择性剪接综合分析
- 批准号:
16K14854 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
完全長cDNAライブラリを用いたダニアレルギーワクチンの開発
利用全长cDNA文库开发尘螨过敏疫苗
- 批准号:
12J40160 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
バベシア原虫の完全長cDNAライブラリーを活用した新規診断・予防用抗原の探索
利用巴贝虫原生动物全长 cDNA 文库寻找新的诊断和预防抗原
- 批准号:
22248035 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Screening of house dust mite allergy vaccine candidates using full-length cDNA library.
使用全长 cDNA 文库筛选屋尘螨过敏候选疫苗。
- 批准号:
22710202 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Analysis of novel periodontal ligament-specific molecules identified in human periodontal ligament full-length cDNA database.
分析人牙周膜全长 cDNA 数据库中鉴定的新型牙周膜特异性分子。
- 批准号:
21792119 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Identification of stress tolerance related genes via FOX hunting of Thellungiella halophila full-length cDNA
FOX狩猎盐藻全长cDNA鉴定耐逆相关基因
- 批准号:
20780242 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Screening of novel malaria DNA vaccine candidates using full-length cDNA library
使用全长 cDNA 文库筛选新型疟疾 DNA 候选疫苗
- 批准号:
19710168 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Dinoflagellate Full-Length cDNA Sequencing
甲藻全长 cDNA 测序
- 批准号:
0626678 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
Standard Grant
Retroviral Expression Cloning Using an Arrayed Full Length cDNA Gene Set
使用阵列全长 cDNA 基因集进行逆转录病毒表达克隆
- 批准号:
nhmrc : 401608 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 3.39万 - 项目类别:
NHMRC Strategic Awards














{{item.name}}会员




