课题基金 / 基金详情

新規の反応論の導出を指向した水溶液中での基礎有機反応シミュレーション

新規の反応論の導出を指向した水溶液中での基礎有機反応シミュレーション
水溶液中的基本有机反应模拟旨在推导新的反应理论
批准号:
10J04901
负责人:
佐藤 真
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011

项目摘要

项目成果

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本年度は前年に引き続きt-BuClの加水分解反応シミュレーションを行った。フラグメント分子軌道法(FMO)を電子状態計算に用い、水分子410個の液滴モデル中(半径約12Å)におけるt-BuClに対して、FMO2-HF/6-31G^*、FMO(3)-MP2/6-31G^*レベルによる分子動力学(MD)シミュレーションを行った。ここでFMO(3)は、HF部分にのみ3体項を考慮に入れた計算であり、従来の2体近似よりも精度が高い方法である。まずt-BuClの3級炭素-塩素間距離(RC)を1.7~3.4Åの範囲で変化させ、以前より長時間のサンプリングを行い(平衡化1.0ps、サンプリング0.4ps)、自由エネルギー変化を計算した。その結果RC=2.84にC-Cl不均一開裂の遷移状態(14.44kcal mol^<-1>)、RC=2.88に接触イオン対(14.33kcal mol^<-1>)に対応する領域が現れたが、RC=2.7~3.0の範囲での自由エネルギープロファイルは非常にフラットであり、より正確なプロファイルの記述には、電子相関を考慮した計算レベルが必要であると結論した。FMO(3)-MP2/6-31G^*レベルにて、RC=1.86および2.85に固定してシミュレーションを行ったとき、t-BuClのマリケン電荷の差が0.04(0.3ps間のシミュレーションの時間平均)と計算された。これはC-Cl不均一開裂の遷移状態付近で、t-BuClから周辺の水分子へと電子が流れ出していることに対応しており、すなわち求電子的溶媒関与が求核的溶媒関与よりも優位であることを示唆する結果である。しかしこの計算方法では、FMO2-HFと比べて~10倍程度の計算時間を要するため、十分なサンプリングを実行することができず、全体の自由エネルギープロファイルを記述するには至らなかった。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [Kakinuma, K., Okayasu, T., Jamsran, U., Ohkuro, T., Takeuchi, K., 佐藤真]
通讯作者: 佐藤真
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [柿沼薫, 岡安智生, 佐々木雄大, ジャムスランウンダルマー, 大黒俊哉, 武内和彦, 佐藤真]
通讯作者: 佐藤真
大脳皮質内神経回路操作法の樹立と神経細胞移動障害による大脳回路機能変異の解明
  • 批准号:
    20659026
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.11万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    佐藤 真
  • 依托单位:
フィラミン/FILIPの神経系形成に及ぼす働きについて
  • 批准号:
    18022017
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.86万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    佐藤 真
  • 依托单位:
FILIPの神経系形成に及ぼす働きについて
  • 批准号:
    17024022
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    佐藤 真
  • 依托单位:
PHドメイン含有分子と大脳皮質形成-網羅的検索と機能解析
  • 批准号:
    17650098
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.18万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    佐藤 真
  • 依托单位:
海外基金